主持馆全面工作。负责党的政治、思想、组织、作风、制度建设和党风廉政建设工作；负责干部人事、财务工作。分管办公室、党群人事部。
副馆长、党总支副书记：原丰
负责陈列展览、文物保护、涉案文物鉴定（不可移动）、信息传媒、文化创意、工程基建及招投标工作。分管陈列展览部、文保科技部、信息传媒部（文化创意部）、工程管理部。
副馆长：黄豫民
负责免费开放、公共服务、安全生产、信访稳定、精神文明建设工作。分管社会服务部、安全保卫部、汉画像石艺术馆管理部、书画艺术馆管理部。
副馆长：宗时珍
负责藏品管理、文物对外交流、涉案文物鉴定（可移动）、科学研究工作。分管藏品部（文物交流部）、科研部。
理事会：
审议和提出本馆章程修订意见；审议本馆业务发展规划、财务预决算、管理层工作报告；审定本馆重大业务活动计划、内部主要管理制度；拟定本馆内设机构或分支机构设置方案；监督管理层执行理事会决议。
学术委员会：
审议博物馆业务发展规划，提出促进博物馆事业发展的合理化意见和建议；审定各类科研项目的申报，评审本馆科研成果奖；决定学术争议处理规则，指导、组织学术道德教育活动，受理有关学术不端行为的举报并组织调查，评议、裁决学术纠纷和学术失范行为；审核本馆职工申报职称的学术成果材料；对科研奖励进行评审与认定，对科研经费的使用进行监管。
办公室：
承担单位日常运转工作，承担文电、会务、机要保密、档案、政务公开、接待、后勤、财务和资产管理等工作；拟订博物馆事业发展总体规划；承担徐州博物馆理事会、监事会日常工作。
党群人事部：
承担党群、教育培训工作；协助做好机构编制、干部人事和劳动工资工作；承担离退休人员工作。
藏品部（文物交流部）：
承担各类文物的鉴定、征集、捐赠、移交和入藏工作；承担藏品编目、登账、建档、统计、保管、研究工作；承担文物藏品账册、各类文物档案资料及文物库房管理；负责对外交流展览的宣传推介、策展、接洽、布展撤展等工作。
文保科技部：
陈列展览部：
社会服务部：
担免费开放、窗口服务、观众预约、讲解接待等工作；承担各类社会教育、研学旅游活动；承担博物馆志愿者招募及管理工作；承担社群组织和馆校共建工作；承担观众满意度调查工作，搜集并反馈观众意见和建议；承担公益性文物鉴定咨询服务工作。
信息传媒部（文化创意部）：
科研部：
承担科研工作规划编制、统筹管理以及内部刊物的征稿、编辑、出版等工作；承担处理学术委员会日常事务；协助做好各级各类科研项目、研究课题的申报、管理、奖励等工作；承担策划组织出版各类学术专著、研究图录及举办各类学术活动等工作；承担图书、期刊、报纸的采购、征订、编目、管理、借阅工作。
安全保卫部：
承担制定安全保卫、消防安全管理制度，保障人员、文物和财产的安全工作；承担范围内社会治安综合治理工作；承担各类应急预案的拟订和演练实施工作；承担人员安全教育培训及保安队伍日常管理工作；承担馆内安（消）防、防雷设施设备日常维护、保养和检测工作。
工程管理部：
汉画像石艺术馆管理部：
承担汉画像石艺术馆日常工作的组织、协调和管理；承担讲解和游客接待服务以及安全保卫、卫生保洁和环境整治工作；承担汉画像石艺术馆文物、设施设备安全、维护等工作；承担汉画像石艺术馆学术研究工作。
书画艺术馆管理部：
承担尉天池书法馆、赵绪成艺术馆、李可染艺术中心等各类名人艺术馆日常工作的组织协调及藏品、设施设备安全、维护等工作；承担讲解和游客接待服务以及安全保卫、卫生保洁和环境整治工作。