第一展厅介绍了一个建在湿地的王国的崛起与发展。以良渚文化时期的原始生态环境和先人们日常生活作为背景壁画，复原了先人使用快轮制陶和先民纺织的生动场面，同时展示着良渚文化时期的先进农业生产工具，包括石犁、石铲、石刀、破土器、石镰以及狩猎用的石镞和捕鱼的网坠，这些成套又制作精良的生产工具是同期考古文化中最复杂的，其发达的农业和手工业也为良渚文明的形成和发展奠定了雄厚的经济基础。
良渚古城遗址被誉为“中华第一城”，它证实了中华五千年的文明史，通过微缩技术还原了良渚古城内王陵、作坊区、纵横水路及临水而居的江南生活模式，以及外城众星拱月，围合的人工营建台地上居住着村民。同时在第一、二展厅之间用一段仿制的古墙衔接，加上声光电等高科技的手法，让这个古国变得活灵活现。陈了场景还原，还展示着良渚文化部分精品器物，有雕琢精美的玉器、磨制精细的石器及制作规整的陶器。
玉器文明是良渚文明的重要特征，玉器在良渚时期作为权力、礼制、信仰的物质载体，用以标识身份、区分等级。并通过复原展示一座良渚文化时期的“玉敛葬”大墓，在四周墙面展示了不同等级的墓葬出土照片，通过丰富的墓葬资料的对比展示来揭示良渚文化社会等级的分化和阶级的形成，把良渚文化的诠释上升到文明的高度，整个展览达到了高潮。
良渚博物馆的三个展厅内容相辅相成，各有重点展示对象，通过三个展厅的对历史的还原及文物展示，充分展示了良渚先民所创造出的高度的物质文明和精神文明，更说明了中华文明的起源可以追溯到四五千年前的良渚时期。
良渚时期，玉被赋予神圣的品格，重型礼器有玉琮、玉璧和玉钺，它们是沟通天地人神的灵物，是神圣的法器也是维系社会等级与秩序的重要礼器，更是世俗权力的象征。良渚文化玉器，达到了中国史前文化之高峰，其数量之众多、品种之丰富、雕琢之精湛，在同时期中国乃至环太平洋拥有玉传统的部族中，独占鳌头。
其中玉琮是神人兽面纹的重要载体，内贺外方，中部贯穿，四角对称施刻四组相同的图案，四壁有纵向直槽，是良渚先民天地宇宙观的反映。玉琮仅出土于高等级墓葬，是良渚社会通天地、敬鬼神的重要宗教法器。反山十二号墓出土的一件玉琮，重达6.5千克，堪称“玉琮王”。
良渚文化玉器和陶器制作场景还原
良渚的陶器，当以泥质灰胎磨光的黑皮陶最具特色，采用轮制，器形规则，圈足器居多，用镂孔、竹节纹、弦纹装饰，也有彩绘，甚至还有刻着原始文字的陶器，如单把杯、椭圆形豆、罐等，尤其有一件刻划着8个符号的刻文黑陶罐，被称为“前所未见的珍品。”