重庆自然博物馆具有丰厚的文化积淀，迄今已有88年不间断的历史，在我国现代科技发展史、博物馆发展史上曾占有重要一席。该馆的前身为1930年卢作孚先生创办的“中国西部科学院”，以及1943年由十余家全国性学术机构联合组建的“中国西部博物馆”。
2018年5月18日国际博物馆日，重庆自然博物馆老馆“科学魂强国梦——中国西部科学院旧址历史陈列展览”全新开放！
惠宇楼的故事
1930年成立的中国西部科学院，是卢作孚致力于国家现代化目标，将“科学救国”与“实业救国”思想相结合，积极探索救国、强国之路的光辉典范。
以“研究实用科学,促进生产文化事业”为宗旨、以“从事于科学之探讨，以开发宝藏,富裕民生”为目的。中国西部科学院的建立，揭开了北碚研究、引进现代应用科学技术的先河，促进了四川及西南地区的工农业发展和科学研究的长足进步。
在抗战时期，为中国民族科学的发展、经济建设和科普教育做出了巨大贡献。
科学不仅要研究，更应服务于大众，以科学普及启迪民智。抗战时期，国民政府西迁重庆,为数甚多的学术机关随迁至此。内迁科研机关在进行科学研究的同时也进行科学的普及教育。在战时举办有影响的展览，对于展示科学新知、启启迪民众智识、激发爱国斗志有积极作用。
1943年中国西部科学院联络内迁北碚的中央研究院动、植物研究所等十余家科研机构又在北碚创建了中国西部博物馆。
卢作孚借让中国西部科学院“惠宇”大楼作为博物馆的陈列主楼，办公室、实验室、图书室等则在“惠宇”附近另行建筑。
以“从事科学教育之推广及专门学科之研究”为宗旨的中国西部博物馆，设地理、地质、工矿、生物、农林、医药卫生6个分馆，是中国人自己建立的、综合了最多学科的第一家自然科学博物馆。
中国西部博物馆的宗旨为推广科学教育，提倡专门科学研究，其收藏陈列内容充实、品类丰富、设备齐全，具有相当规模，反映了重庆、四川地区自然资源的开发利用，弘扬了我国战时科研成果，并向广大民众传播科学。其诞生正值中国博物馆事业因战争遭到重创时期，因而独树一帜,不仅在博物馆发展史上占有重要席,而且作为抗战中出现的科学文化机构，在科学的促进与推广上也发挥过积极作用。
战时学术中心
抗战时期，国民政府西迁重庆，一大批重要的学术机关也向大后方迁移。中国西部科学院及其所在地北碚，接受了许多著名学术机构和一流的科技人才的转移安置，一度成为中国科学界的“诺亚方舟”和“战时学术研究中心”。
新时代的辉煌
1943年，英国与中国共同创设于重庆，其目的为加强中英及中外战时科学文化交流与合作。馆址位于浮图关两浮路胜利新村一号，英国科学家李约瑟任馆长。下设纯粹科学、工业科学、战时工业及医学4组。1945年，该馆共有6名英国、10名中国科学工作者。1946年3月，李约瑟回国，该馆工作告一段落。该机构的成立对战时中国科学起到援助作用。
从中国西部科学院走出的青年学者以及参加中国西部博物馆筹建、设计的一大批专家，继后成为新中国自然科学的领军人物，为我国自然科学事业的发展做出不可磨灭的贡献。