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8.UMIATACseq数据分析及植物单细胞ATACseq技术的探索为了能更深入地研究植物的生长发育过程,重塑细胞发育轨迹,亟待建立适用于植物领域中的单细胞ATAC-seq高通量实验平台。本研究以水稻(Oryza sativa L.)幼穗为实验材料,在普通ATAC-seq实验过程中引入了独特分子标签并设计了独特的Tn5接头,经优化的染色质可及性测序方法命名为UMI-ATAC-seq(Unique Molecular Identifiers,https://cdmd.cnki.com.cn/Article/CDMD-10504-1021883541.htm

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11.单细胞barcode和umi的作用单细胞umi本文详细介绍了单细胞测序中GelBeads上的特殊序列,包括16nt的Barcode用于标记细胞,确保同一细胞的所有基因序列带有相同标识;12nt的UMI则用于绝对定量,解决mRNA扩增效率差异导致的误差。通过Barcode和UMI,可以准确追踪并量化每个细胞的基因表达情况。 摘要由CSDN通过智能技术生成 https://blog.csdn.net/weixin_47707171/article/details/120173160

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17.细数大规模单细胞转录组测序平台估计大家经过我前面的介绍,都对单细胞测序所了解了,但现在市面上有这么多测序平台,到底哪个更适合我的研究呢? 接下来的内容,将就五个国内外研究机构使用的“大规模单细胞测序平台”,一一解析如下问题(深度解析,文章略长,文末有彩蛋哦!): 10x Genomics Chromium?系统 http://m.yunbios.net/single-cell-transcriptome-sequencing-platform.html

18.单细胞测序平台知多少?企业动态选择合适的单细胞分选平台,是实验过程中至关重要的步骤。 10x Genomics一次可以捕获多少细胞?对于细胞大小的要求是多少? BD Rhapsody?为什么对于细胞活性要求比较低?什么类型的样本更适合上这个仪器? 10x Genomics和BD Rhapsody?通过什么区分单个细胞?UMI序列又有什么用? https://www.biomart.cn/news/16/2949205.htm

19.10xGenomics平台单细胞RNASeq测序详解基于10X Genomics 平台的高通量单细胞 RNA Seq技术是利用液滴法的原理,使用GemCode技术,通过控制微流体的进入,将带有 barcode、UMI(Unique Molecular Index,分子标签)、引物及酶的凝胶珠(Gel Beads)与单细胞混合,从而实现大规模的单细胞分离,以及单细胞文库构建的技术。 https://www.magigen.com/h-nd-324.html

20.单细胞转录组与流式细胞术强强联合:解析细胞复杂性的新维度医药GEMs形成后,细胞裂解,凝胶珠自动溶解释放大量barcode序列,随后mRNA逆转录产生带有10x barcode和UMI信息的CDNA,构建标准测序文库。随着单细胞测序技术的不断更新和发展,其在解析细胞异质性,揭示微环境中细胞群体间的关系,追踪疾病发生发展等研究中将发挥越来越重要的作用,后续可为个性化预防、治疗提供技术支持。https://bydrug.pharmcube.com/news/detail/a7f5ab4646f44e48e9405696723580f6

21.北京大学汤富酬等团队发布单细胞测序技术最新研究成果导读:基于第三代测序(TGS)平台的单细胞RNA-seq技术的进步加速了生物学研究。自2016年以来,已经开发了几种基于TGS平台的单细胞RNA-seq方法。由于受到低准确度和灵敏度的限制,它们要么结合基于NGS平台的方法降低错误率,要么通过牺牲通量来提高检测率。 2023年1月11日,北京大学汤富酬等团队合作在《Cell Discovery》在线https://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_21564669

22.给免疫学家们的单细胞测序指南单细胞测序技术 自2009年第一个scRNA-seqprotocol发布以来,已经有了关于scRNA-seq方法的扩展,这些方法不同于mRNA转录本如何被放大来生成全长cDNA或在5'或3'端具有唯一分子标识符(UMI)的cDNA。例如,SMART-seq ( switching mechanism at 5′ end of RNA template sequencing)及其改进的protocol,SMART-seq2是用来生成https://www.jianshu.com/p/b193c046e9be

23.单细胞转录组技术梳理(二)腾讯云开发者社区在这之后,许多更灵敏、更准确的单细胞转录组技术如雨后春笋般相继被开发出来。今天继续来回顾一下2011年的单细胞转录组测序技术STRT(Single-cell tagged reverse transcription )。文章是:Characterization of the single-cell transcriptional landscape by highly multiplex RNA-seq https://cloud.tencent.com/developer/article/1605952