1933年10月1日，中国第一水工试验所在天津成立，这是中国第一个现代水利科研机构，是中国水利水电科学研究院的前身。1953年1月，水利部向中央人民政府报送了一份筹建水利科学研究所的计划任务书，这标志着中国水科院的前身之一“水利部北京水利科学研究院”处于开始酝酿中，次年开始了筹建工作，1956年7月陆续开展水利科研工作。其职工大部分来自前南京水利实验处及天津水工实验所。
1955年8月中国科学院和清华大学合作筹建了中国科学院水工研究室。1957年12月，中国科学院水工研究室与水利部北京水利科学研究院合并成立了“中国科学院、水利部水利科学研究院”。另一中国水科院的前身“电力工业部水电科学研究院”（原名“水电总局科学试验所”）于1953年筹建，1955年初正式开展试验工作。1958年6月，电力工业部水电科学研究院与中国科学院、水利部水利科学研究院正式合并，于1959年6月更名为中国科学院、水利电力部水利水电科学研究院。
特殊的历史时期，水科院经历了10年离散时期，1978年4月水利水电科学研究院恢复重建，1994年9月，水利水电科学研究院更名为中国水利水电科学研究院
1933年9月，中国第一水工试验所（中国水科院前身）董事会成立，李仪祉先生任董事长
中国第一水工试验所董事会章程
第一水工试验所完工后的试验厅全景
水工试验所的主体设施
中国第一个水工模型：1934年永定河官厅拦洪坝试验模型
1953年1月水利部报送中央人民政府的筹建水利科学研究所计划任务书原件
1954年南京水利实验处第一届水工试验学习班结业合影（后右3为陈椿庭）
1957年中科院水工室、北京水利科学研究院合并的报告
1957年秋第一水工所部分职工合影
1958年合并定名后的水利科学研究院颁发印章批文
1958年6月11日启用水利科学研究院新印章通知
1964年院技术处同志合影
1984年7月21日国际泥沙研究培训中心成立揭幕式
1980年3月薄一波副总理接见出席第一次国际河流泥沙国际学术讨论会的代表
1985年泥沙中心第一届顾问委员会第一次会议
1996年汪闻韶代表中国振动工程学会土动力学专业委员会向俄罗斯建筑研究院伊利乔夫授予外席委员聘书
新中国成立以后，为适应我国水利事业发展的需要，水利部于1955年着手筹建水利部水利科学研究院。作为该院主要机构之一的泥沙研究所于1956年正式成立，人员主要来自原南京水利实验处、原黄河规划委员会、水利部有关司局、水利部天津水利科学研究所等单位。由方宗岱、孙子文任副所长。右图为1956年泥沙所部分同志与越南同志在原水科院礼堂（已拆）门前合影。
1958年，中国科学院水工研究室、电力部水电科学研究院与水利部水利科学研究院合并，成立中国科学院水利电力部水利水电科学研究院，中国科学院水工室泥沙组与水利科学研究院泥沙所合并，泥沙研究所改名为河渠研究所，左图为当时合影，先后有方宗岱、孙子文、钱宁、丁联臻任副所长。
1956年河渠所刚成立，就成立了永定河河道测验站，进行永定河下游河道观测，为研究工作提供了大量的宝贵资料。永定河演变特性及河道整治研究项目（1956年-1959年）取得了丰富的成果，专著《官厅水库建成后永定河下游的河道演变》及《植树工程在永定河政治中的应用》均出版成单行本，向国庆10周年献礼，永定河的研究和治理，也成为宽浅游荡性河道整治的样本。
1956年，正值黄河下游引黄灌区开展时期，河渠所开展无坝引水、导流屏装置以及人民胜利渠泥沙问题的调查研究。1958-1960年，进行了黄河位山枢纽建成后枢纽及灌区泥沙问题的观测研究，取得了不少观测资料和研究成果。
1958年进行水文测验1958年在山东安装导流浮箱1959年国庆，钱宁同志带领郑州工作组部分人员查勘永定河1959年河渠研究所一组在位山枢纽模型结束后同工程局领导、工程人员合影1958年我院苏联专家在现场考察工作1959年孙子文副所长与下放的八位同志合影1960年4月水科院举办动大会，河渠所获团体总分第一名，男子百米接力第一名
1956年，北京科学研究院水利土壤改良研究所成立，人员来自水利部灌溉总局、留学回国人员和应届大、中专毕业生，编制近90人。
1959年，由于水利部与电力部合并，灌溉总局划归农业部，全所科研骨干力量一分为二：一半人员归属到中国农业科学院，迁到河南省新乡市组建农田灌溉研究所；另一半留下，改名为水利水电科学研究院灌溉研究所。
1961年，灌溉研究所更名为水利研究所，设有5个研究组和一个水工试验厅。
1966年文化大革命期间，水利研究所被解散，科研人员下放到各省。
1978年，水利研究所在北京恢复。先后承担了从“六五”至“九五”国家科技攻关项目、“十五”期间“863”项目、“十一五”期间“863”项目和国家科技支撑项目以及大量的省、部级科研项目，并积极开展国际科技合作研究，逐步树立了水利研究所在行业内的地位。
1984年，水利电力部下属的水质研究中心成立，挂靠在水利所。1988年，水质研究中心独立运行。
1999年，国家科技部批准以水利研究所为依托组建国家节水灌溉北京工程技术研究中心。2002年通过科技部验收，水利研究所与国家节水灌溉工程技术研究中心（北京）并行运作。
照片说明
中国第一次参加国际大坝会议(李桂芬)
三十四年前，受国际大坝委员会主席托兰先生的邀请，我国于1973年6月首次参加了国际大坝委员会在西班牙马德里召开的第11届大会。这是我国水利水电部门第一次介入国际学术活动，具有非常重要的历史意义。
当年，我国还正式申请加入国际大坝委员会。在以西班牙大坝委员会为首的各国委员会的热情支持下，1974年在ICOLD第42届执行会议上，国际大坝委员会正式接受了我国为第70个成员国。此后至今，我国在大坝会议中活动积极，成绩显著，一大批中国专家在该组织中担任了重要职务，并于2000年成功承办了第22届国际大坝会议。
我院老年门球队
我院老年门球队成立于1985年。当时老年文体活动比较单调，活动项目也很少，适逢北京以至全国门球引进并日益兴旺的大环境，我院的老年门球队便应运而生了。当时队员不足10名，基本为离休老干部，老院长田孝忠任队长，原老干部处副处长晁敏做教练，经过短期培训后，便组队参加了1987年在内蒙举办的水利电力部首届老干部门球邀请赛，并取得了第二名的好成绩。1991年，门球队又吸收了部分退休干部，并组队参加了水利部在山西太原举办的第二届门球邀请赛，获得了第十一名。此后又多次参加部系统、中央国家机关、街道等举办的门球赛，并都取得了较好的成绩。
近几年，在院领导重视、关心、支持下，我院各项老年文体活动开展得更加丰富多彩，门球队也进行了重新组建，吸收新生力量，加强技术培训，增强了整体实力，在市、区级大赛中多次捧得奖杯，受到了市、区门球协会的表彰。