关于举办“第二期基于AI的蛋白质结构解析与设计专题（线上）培训班”的通知
各有关单位：
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大会概况
第二期基于AI的蛋白质结构解析与设计专题（线上）培训班
12月27日：下午15：00-15：30平台网络及设备测试
12月28日-29日：上午9：00-12：00，下午14：00-17：00培训课程（详情参考附件一）
地点：小鹅通在线直播平台
大会规模：100+
主办单位：中国化工企业管理协会医药化工专委会
承办单位：中科凯晟化工技术研究院/药成材在线直播平台
培训对象：
1.蛋白质工程领域科研单位专家及学者；
2.医学、药学及食品学院校及企业蛋白质功能开发负责人；
3.生物及化工工程领域从业工作者。
大会报名通道：
02
课程内容
附件一：
第二期基于AI的蛋白质结构解析与智能设计专题培训班课程表
12月27日下午15：00-15：30线上测试
（第一天）12月28日，上午9:00-12:00;下午14:00-17:00
《结合AI的蛋白质结构解析与预测》
1.蛋白质结构的重要性、结合AI的蛋白质结构解析方法与实践（3h）；
1.1蛋白质结构AI预测软件介绍，优缺点、精度、适用条件(陈荣昌30min)。
1.2AI时代的结构解析特点和流程(SPA、结晶、NMR技术方案选择依据，AI带来的便利性,基本流程介绍)--杨银龙60min
1.3AI时代服务于结构解析的蛋白样品制备(程洪金60min)
1.3.1表达方案制定依据、表达体系选择、质粒标签选择。
1.3.2经典案例。
2.结合AI的蛋白质结构预测、优化途径与实践（3h）。
2.1AI模型对于结构解析的帮助，带来的好处。AI蛋白质预测软件使用alphafold2,alphafold3使用。
2.2AI模型用于结构解析案例实际操作（晶体prfaH）
2.3AI模型用于结构解析案例实际操作（SPA烟草花叶病毒）
2.4晶体结构质量的评价指标、PDB数据提交等数据发表
杨老师，山东第一医科大学硕士研究生，在蛋白表达纯化，晶体培养和结构解析方面拥有丰富科研经验，目前在青云瑞晶担任项目经理一职。曾参与多个国家基金项目的申请和开展，学习期间主要从事细菌和病毒致病蛋白的结构和功能研究，后续在清华大学药学院学习药物功能研究和真核蛋白表达纯化。先后参与发表CellReprot论文2篇，CancerImmunologyResearch论文1篇，NucleicAcidsResearch论文1篇。
（第二天）12月29日，上午9:00-12:00;下午14:00-15:30
《数据驱动的功能蛋白挖掘与工程化》1.3h
9：00-10：10
1.数据驱动的合成生物学技术。
2.基因编辑工具的介绍。
3.工具酶的挖掘与改造。
4.蛋白材料的设计与改造。
姚老师，浙江大学杭州国际科创中心“百人计划”研究员，合成生物学研究所副所长。聚焦数据驱动的基因编辑技术、蛋白设计与进化技术，基于遗传多样性的暗物质挖掘与进化技术，并应用于生物医药和化学工程等领域。共主持科研项目13项（包括国家重点研发计划课题，国家自然科学基金项目等6项国家级项目），共发表SCI论文50篇。近5年，以通讯作者在NatureChemicalBiology,AdvancedFunctionalMaterials等期刊发表SCI论文30篇。申请国家发明专利10件。联合国内医药上市公司和领军企业实现技术产业化1项。担任Science合作期刊BioDesignResearch编委等学术职务。
《人工智能在酶蛋白设计中的应用》1.7h
10：20-12：00
1.开场(10分钟)：概述课程涵盖的工具及其在蛋白质工程中的重要性
2.工具概览及安装(15分钟)
(1)介绍将使用的工具：简要介绍ESM模型、ProteinMPNN、MutCompute、MLDE、CLADE等
(2)工具的获取与安装：如何下载和安装这些工具、基本的系统要求和配置注意事项
3.使用蛋白质语言模型(20分钟)
(1)ESM模型使用基础：如何配置和启动ESM模型、输入数据的格式和准备
(2)实作演示：演示如何用ESM预测蛋白质结构
4.基于结构优化算法的设计(20分钟)
(1)ProteinMPNN和MutCompute：基本工作流程和使用场景
(2)实作演示：通过案例展示如何用ProteinMPNN进行蛋白质设计、运用MutCompute优化酶的活性和稳定性
5.监督学习算法在酶工程中的应用(20分钟)
(1)MLDE和CLADE概述：讲解核心原理、应用范围、基本工作流程
(2)实作演示：演示如何通过MLDE进行酶功能优化、CLADE的实际使用案例
6.结尾与问答环节(15分钟)
(1)总结工具使用技巧
l归纳不同工具的最佳使用场景和优劣势
(2)互动问答
l解答学员在工具使用过程中的常见问题。
《基于AI的酶蛋白元件之改造与设计》1.5h
14:00-15:30
1.无监督蛋白改造及案例解析；
2.基于小样本的蛋白改造及案例解析；
3.蛋白从头设计及案例解析；
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会议费用
4000元/单位，可投屏全员观看（含5个直播链接、2本资料、1个月有效期回放）
注：所有报名单位款项必须在会前办理，以便提前开具发票。