国家林业和草原局信息中心负责林业信息重点数据库、应用系统和网站的建设及维护工作；承担林业系统信息资源的共享、使用和发布；负责林业信息化重点项目的设计、实施、技术培训；承担国家林业和草原局交办的其他事项。
林业工作站管理总站
国家林业和草原局林业工作站管理总站承担全国林业工作站行业管理、林政案件稽查和林权争议处理的具体工作。主要包括：研究拟订林业工作站的职责、规范和标准，并监督执行，指导各级林业工作站依法履行职责；制定全国林业工作站人员岗位规范；负责全国森林资源林政案件的稽查、督办工作，指导地方林权争议处理工作，承办国务院确定的重点林区和省际间林权争议的确认、调查和调解的具体工作。
林业和草原基金管理总站
宣传中心
天然林保护工程管理中心
国家林业和草原局天然林保护工程管理中心是承担天然林保护修复工作的专门管理机构，与天然林保护管理办公室(简称天保办)一套人马、两块牌子，下设办公室、综合处、管护处、核查处、监测处、社保处、信息处7个处（室）。主要职责：天然林保护修复政策规划编制和立法草案起草；标准规程制修订；资源管护及其能力建设；保护修复成效年度核查；综合效益监测；工程区职工社会保险和林区政策性社会性补助监管；天然林保护修复业务宣传、国际合作、人员培训、数据统计和信息化建设；国家林业和草原局交办的其他事项。
西北华北东北防护林建设局
退耕还林（草）工程管理中心
国家林业和草原局退耕还林（草）工程管理中心承担退耕还林工程总体规划、年度计划编制的有关工作，经批准后监督实施；拟订退耕还林工程建设的标准和办法，并监督执行；实施退耕还林工程三级检查验收制度，承担工程营造林、工程管理实绩核查的具体工作；组织开展退耕还林工程检测和评估、信息统计和汇总；负责退耕还林工程的技术指导、人员培训等。
世界银行贷款项目管理中心
国家林业和草原局世界银行贷款项目管理中心承担世界银行、亚洲开发银行、欧洲投资银行、GEF、WWF等国际金融机构与国际组织贷赠款林草项目申报、管理与技术服务；承担国家储备林、速生丰产林、全国木材战略储备基地建设的技术管理、技术指导、技术服务，负责全国性和区域性储备林规划编制工作，负责审查地方储备林技术方案；承担林业血防林工程的技术指导、监测评价、监督管理等。
科技发展中心
经济发展研究中心
人才开发交流中心
对外项目合作中心
国家林业和草原局对外项目合作中心承担对外合作项目管理工作。
中国林业科学研究院
中国林业科学研究院（简称中国林科院）是国家林业和草原局直属的综合性、多学科、社会公益型国家级科研机构，主要从事林业应用基础研究、战略高技术研究。中国林科院设有19个独立法人研究所、中心，13个非独立法人机构，22个共建机构，分布在全国24个省、自治区、直辖市，构成了布局合理、体系完整、实力雄厚的国家级林业科技创新体系。按气候带部署有林业研究所、亚热带林业研究所、热带林业研究所三个研究所及热带、亚热带、沙漠和华北四个林业实验中心；设有森林生态环境与保护、资源信息、资源昆虫、新技术、科技信息、木材工业、林产化学工业、林业机械9个专门研究机构；针对泡桐及经济林、桉树、竹子等中国特有或重要树种建立了泡桐、桉树和竹子三个研究开发中心。根据三大系统一个多样性要求，组建了荒漠化所、湿地所研究所和盐碱地研究开发中心。
调查规划设计院
国家林业和草原局调查规划设计院承担森林、草原等自然资源调查、规划、设计、监测、评估、新技术应用等工作。
林产工业规划设计院
国家林业和草原局林产工业规划设计院成立于1958年，以林产工业、林业工程、园林工程和建筑工程咨询设计为核心，以园林工程、市政公用工程、建筑装修装饰工程施工以及林业工程和建筑工程监理为辅的综合性设计院。设有工业工程、林业工程、建筑工程、城市规划、园林工程、森林资源调查监测中心、《林产工业》编辑部等42个业务部门；中国园林工程公司、北京思创监理有限责任公司、海南分院、厦门分院、昆明分院、郑州分院等下属公司及分支机构。
管理干部学院
国家林业和草原局管理干部学院是国家林业和草原局直属的干部教育培训专责机构。中共国家林业和草原局党校与学院一个机构两块牌子，国家林业和草原局干部教育培训研究中心、国家林业和草原局教育培训信息中心设在院内。学院是“国家级专业技术人员继续教育基地”。自1951年建院起，累计面授培训干部近20万人次。主要职责是：轮训国家林业和草原局机关、直属事业单位和派出机构党员干部和公务员；培训林业草原系统领导干部、专业技术人才、基层骨干人才以及外国林草官员；宣传贯彻党的方针政策，围绕重点生态工程，自然保护地体系建立，生态资源保护，草原保护，林草资源合理开发利用，生态扶贫，国有林区、国有林场、集体林权制度改革等重大问题开展培训。为干部能力建设和林草人才培养提供咨询支撑服务。
中国绿色时报社
中国林业出版社
中国林业出版社成立于1953年，是我国唯一的中央级科技类林业专业出版社，2011年3月完成了转企，2018年完成公司化改制，目前是国家林业和草原局唯一的文化企业单位。中国林业出版社始终围绕国家林业和草原局中心工作，扎实推进图书出版生产工作。在宣传生态文明建设、传播生态文化知识、推动国家林草业繁荣发展等方向持续加大选题策划出版力度，重点服务于林草业科技、林草业教育、“三农”以及基层林草业工作者。目前年均出版物1000种，年图书生产码洋超过1亿元，拥有丰富的选题资源储备。
国际竹藤中心
亚太森林网络管理中心
森林和草原病虫害防治总站
国家林业和草原局森林和草原病虫害防治总站承担森林和草原病虫害防治工作。
华东调查规划设计院
国家林业和草原局华东调查规划设计院，是国家林业和草原局直属从事森林资源监测和调查规划设计的正厅（局）级公益型事业单位。机构内设办公室、党委办公室(工会办公室)、生产技术管理处(总工办)、人事处(离退休办公室)、计划财务处、纪检审计处、金华院区管理处、行政后勤处、森林资源监测一处、森林资源监测二处、生态工程监测评估处(碳汇计量监测处)、信息技术处、湿地监测评估处、规划设计处(工程咨询评估处)、自然保护地及国家公园处。
中南调查规划设计院
国家林业和草原局中南调查规划设计院作为国家林业和草原局直属事业单位，与国家林业和草原局中南森林资源监测中心、石漠化监测中心、中南林业碳汇计量监测中心、中南生态监测评估中心、森林城市监测评估中心实行一套人马、六块牌子的管理模式。主要工作范围包括湖北、湖南、广东、广西、海南、贵州、西藏、云南、重庆、四川等10个省（自治区、直辖市），主要履行林业和草原资源监测职能，为国家林业宏观决策、编制全国林业中长远发展规划和制定年度计划提供科学可靠依据。同时，围绕林草中心和重点工作，积极支持服务地方林草生态建设。中南院现有内设机构17个，其中管理处室７个，分别是院办公室、院党委办公室、人事处、纪检监察处、生产技术管理处(总工办)、计划财务处、行政后勤处；业务处室10个，分别是森林资源监测一处、森林资源监测二处、生态工程监测评估处、石漠化监测评估处、湿地监测评估处、森林城市监测评估处、碳汇计量监测评估处、自然资源规划设计处、工程咨询设计处、信息技术处。
西北调查规划设计院
国家林业和草原局西北调查规划设计院暨西北森林资源监测中心，是国家林业和草原局直属的公益性事业单位，是国家林业和草原局设置在西部地区的一支重要的林业技术队伍，主要承担西北监测区山西、重庆、陕西、甘肃、青海、宁夏、新疆和新疆建设兵团等8个省（市、自治区、兵团）的森林资源监测、荒漠化和草原监测评估、湿地和野生动植物监测评估、碳汇监测及重要自然保护地生物多样性监测等重要任务。在西北监测区生态建设、生态保护、生态修复等国家重点工程中发挥着先行军作用。
昆明勘察设计院
国家林业和草原局昆明勘察设计院原名林业部西南林业勘察设计院，成立于1965年，是国家林业和草原局直属的事业单位，是全国森林资源监测五大院之一。工作职能是完成国家林业和草原局下达的各项指令性任务，重点承担西南地区区域性森林资源监测和生态监测评估任务，承担碳汇计量研究、自然保护区及野生动植物监测任务，重点林业工程的勘察设计任务，并在全国范围内承担林业管理检查、核查工作，林业行业标准编制，自然资源综合考察，森林资源资产评估，林业司法鉴定等任务，是一个以林业生态为主、工程为辅的综合性甲级勘察设计院。
中国大熊猫保护研究中心
中国大熊猫保护研究中心开展大熊猫野外生态及种群动态研究；负责大熊猫人工饲养、繁育、遗传、疾病防控以及圈养大熊猫野化培训与放归；协助开展大熊猫国内外合作交流；推动大熊猫文化建设、科普教育和宣传工作等。
国际竹藤中心安徽太平试验中心
国际竹藤中心安徽太平试验中心是隶属于国家林业和草原局的正处级公益一类科研事业单位，于2008年6月18日经中央编制办公室正式批复成立。安徽太平试验中心位于风景秀美的国家4A景区太平湖畔，总占地面积1000亩，建筑面积1.5万余平方米，拥有1个国家级竹类植物与木本花卉种质资源保存库、1个国家竹藤科学技术工程中心以及1个国家林业和草原局安徽太平竹林生态系统定位观测研究站。主要机构职责包括种质资源收集保存、科学研究、竹藤工程材料中试、竹木结构建筑与示范、技术培训和人才培养。
国家林业和草原局幼儿园
国家林业和草原局幼儿园是国家林业和草原局直属事业单位，由国家林业和草原局机关服务局代管，其主要职能是承担国家林业和草原局机关及直属单位职工子女的入托工作，开展3-6岁学龄前幼儿的保育和教育。近年来，幼儿园以办“机关放心、百姓满意、社会认可”的绿色优质品牌园为宗旨，利用多种教育资源在教育实践中探索与尝试，总结开发出有自身特色的园本教育课程，逐渐成为中央国家机关特级幼儿园、北京市一级一类幼儿园、北京市示范幼儿园、北京市社区儿童早期教育示范基地、东城区示范幼儿园、东城区体育特色园、东城区卫生保健示范园、东城区健康促进园。
中国绿化基金会
中国绿化基金会是在邓小平同志提议下，由时任全国人大副委员长、国家副主席乌兰夫等中央领导人支持，联合社会各界共同发起，经国务院常务会议批准，于1985年9月27日成立的全国性公募基金会，是我国建国以来成立最早的由中央编办批复编制的四大基金会之一。中国绿化基金会作为筹集民间绿化资金的重要组织，在林业发展中发挥着筹集民间绿化资金主渠道的作用，在发动全社会参与林业生态建设和环境保护中发挥着重要的桥梁作用。同时，在国际民间绿化合作中发挥着积极的对外友好交往的纽带作用。