目标是精灵宝可梦大师的小智与伙伴的皮卡丘踏上卡洛斯地区，出现在他们眼前的是从未见过的宝可梦、当地强劲的道馆，在这小智与希特隆、柚莉嘉、瑟蕾娜相遇，结伴而行，踏上了新的旅途。小智向着卡洛斯地区联盟进发，希特隆进行更加深入的科学探究，柚莉嘉慢慢往宝可梦训练师靠拢，瑟蕾娜也为了三冠卫星赛而努力。之后更是为了解开卡洛斯地区的传说宝可梦基格尔德之谜，而与企图破坏并再生世界的闪焰团展开较量。
以上，都是过去的事了。
随着游戏新系列《太阳／月亮》的发售，卡洛斯地区的故事暂告一段落，动画也突入了阿罗拉地区。然而对于卡洛斯地区的这段旅行，仍意犹未尽，虽有不少因“大人的事情”而导致的不必要的发展，但旅途中却有着不少值得回味的桥段。监督矢岛哲生（矢嶋哲生）在完结之后开通了推特，也接受了不少媒体的采访。
担当本作监督的是在当时28岁的矢岛哲生，《精灵宝可梦XY》也是他的第一部监督作品。在《Animage》11月号的采访中，矢岛说，毕竟是播出周期为3年的长篇系列，要在这期间都维持高质量，确实不容易，矢岛压力不少，时常把“要做出好的作品，有趣的且质量高的动画”挂在心上。矢岛收到不少观众的来信，信中有些对动画展开的批判，也有不少观众表示非常感动，很有趣，这也是令矢岛最欣慰的事。动画播出期间，矢岛的儿子也出生了，目前2岁，还会哼唱《小软之歌》。
去年4月9日播出的第67话《密阿雷道馆对战！小智VS希特隆!!》，场面相当有迫力，速度感十足，作画强劲，华丽的大招从各个角度进行招式的描写，身临其境。矢岛监督完全把这集当作是“《XY》第1章·完”的印象在做，无论是摄像机的运镜、3D、作画都可以说达到了精灵宝可梦TV系列的极限。本集的主题是“小智的再出发”，在构图与台词上都与小智最初踏上旅途时相呼应。而再出发的不仅是小智，还有站在决斗舞台对面的希特隆。
均出自《精灵宝可梦》第67话。《精灵宝可梦》的通常作画数在4000~5000张，本话传闻作画数超过10000张。
瑟蕾娜的削发一举，也是矢岛监督下的狠心。当初仅是因为“游戏中是可以换发型的”一言，竟然会让瑟蕾娜有着如此大的转变，不仅是观众，也让STAFF们感到苦恼，但最终还是下了这么个决定，矢岛认为瑟蕾娜自己也会这么想的，既然是要与过去诀别，就要削去长发。这是瑟蕾娜的成长。有了未来的目标，下了决心之后。瑟蕾娜在后半的剧情里也更多了勇敢的表情。因此，矢岛也特别嘱咐，希望画师们能在瑟蕾娜的表情、头发被风吹乱的镜头以及握拳的场景上非常用心去画。
出自《精灵宝可梦》第60话。毅然决然的瑟蕾娜剪去了心爱的长发，也配合这清爽的短发换了身造型。
本作最能体现羁绊的莫过于小智与XY篇中主力宝可梦甲贺忍蛙，也是小智进入卡洛斯地区后收服的第一只宝可梦。XY加入的“羁绊现象”，是由训练家与宝可梦之间强大的信赖关系而得以产生。当小智的心情与甲贺忍蛙一致时，内心的波长同步，此时的甲贺忍蛙就会变化为背负巨大水手里剑的“小智版甲贺忍蛙”的完成形态。
对于羁绊的表现，矢岛认为要通过画来表现真的很难，如果动画直接从甲贺忍蛙过渡到小智版甲贺忍蛙未免有些唐突，于是便追加了小智版甲贺忍蛙全身被水包覆着的中间形态。当“真正的羁绊”发动时，覆在身上的水化为背上的巨大水手里剑，水手里剑即是小智与甲贺忍蛙之间产生羁绊的证明。然而为了表现小智与甲贺忍蛙之间的羁绊，也费了几番周折，其中与小智约好了在联盟中再战的翔太，也让小智回忆起了自己的初心——能帮到小智的不是别人，正是那些宝可梦。
小智版甲贺忍蛙的两种形态
另一体现了《XY&Z》羁绊证明的要数柚莉嘉与基格尔德核心“小软”，基格尔德捍卫着卡洛斯地区的生态系统，监视着破坏生态平衡的人。基格尔德最初本以为人类只是把宝可梦当作道具一样看待，在柚莉嘉的身边，小软感受到了竟然有着对宝可梦们关心与爱护的人类，人类也并不那么坏。这也是柚莉嘉在剧中被赋予的任务，可以说这个任务非柚莉嘉不可，在与被闪焰团控制的Z2决战时的小软，继承的正是柚莉嘉最纯粹的“灵魂”。
基格尔德完全体形态
顺带一提，小软这个名字其实是剧本会议阶段时为了方便而叫的名字，结果叫着叫着也就习惯了，最终也就用了这么个随便的名字给基格尔德核心命名。不过这倒也非常符合柚莉嘉的风格。柚莉嘉在剧中经历了多次的相遇、离别，相信这些悲欢离合也会让她成长。
剧中柚莉嘉特别为小软唱了即兴的《小软之歌》。柚莉嘉的声优伊濑茉莉也在推特上说，录音这首歌的时候，开始因为唱得太好而被要求重唱。
矢岛认为《XY&Z》最终的“闪焰团篇”是最能展现出成长的篇章。在这时，小智等人虽然分头行动，但彼此之间的信任也可以看出这已经是一支足够团结的队伍了。从小软与Z2的对话中，也可看到在小软的眼里，人们与宝可梦共存的光景，这正是《精灵宝可梦》所要向传达的世界。
基格尔德所看到的光景
得到成长的不仅是小智等人，一直以小智的皮卡丘为目标的火箭队们在与闪焰团的决战中也有所“成长”。既然是可爱又迷人的反派人物，倘若一直都是以“反派”的形象出现，是没法体现出他们“迷人”的一面的。不单是搞笑的地方，还得表现出他们灵魂深处流淌着的热血。
“既然你诚心诚意地发问了，那我们就大发慈悲地告诉你。”
另外，剧中还有个监督非常执着的地方，就是喵喵制造出的机械，有时不仅是外在的造型，就连内部也要求有着精细的构造，这也是喵喵的匠人魂。
出自《精灵宝可梦XY&Z》特别ED《火箭队队歌》
说到喜欢的宝可梦，矢岛监督表示自己非常喜欢有男子气概的“森林冠军”摔角鹰人。但如果作为伙伴的话，还是选咚咚鼠，因为非常可爱，也想像柚莉嘉一样把它放在小口袋里带着它散步。
矢岛监督喜欢的咚咚鼠。由于咚咚鼠的表情非常可爱，在推特上还有个名为“今天的咚咚鼠”的标签（#今日のデデンネ），有兴趣有条件的朋友可以搜搜看。
《XY&Z》完结后，矢岛也暂时退离了宝可梦的制作现场，接下来《太阳&月亮》的棒子就交给《XY&Z》副监督富安大贵了，第1集SP目前表现良好，今后将会如何展开就看富安监督的舵要如何摆了。