颜值爆表,零代码绘图神器,数据可视化图形类型超200个!

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生信大坑下谁还不会点数据和代码,不然怎么画出那些高级的数据图!

那不会代码的科研人就跟这些高级的数据图无缘了吗?当然不是!

实验数据/图片处理+文献管理+科研绘图+写作翻译+统计分析+办公常用

提取码:6868

一、微生信介绍

免费且不依赖电脑操作系统、无需安装程序,一个浏览器即可实现高质量的科研绘图。

网站还有一直维护的人员。开发团队来自国内外一流研究所、大学(中科院、上海交大、中南大学等)的博士,硕士等。

常规绘图

包括:条形图,柱状图,饼图,折线图,面积图,漏斗图,box图,小提琴图,Venn图等60种

生命科学,医学等领域专业绘图

地图包括:世界地图,中国地图,各省份地图等20多种,

其他分析模块

包括:fasta序列处理,DESeq2差异分析,limma差异分析,GO和KEGG富集分析,GSEA分析等20种

不需要编程基础,开发人员根据他们的多年经验,将绘图代码简洁化,界面化,目前开发了近226个绘图模块。

每个绘图类型都有操作说明,常用模块的输入框上面有视频教程,先看视频,然后再做,上手非常简单。

最方便的所有所有绘图模块的示例数据都可以下载,就算没有数据我们也可以先用网站上提供的数据进行绘图练习。

二、画图案例

1、富集气泡图

利用气泡图,将富集结果的p值以颜色表示,基因数用气泡大小表示。

可以使用在线工具metascape提交基因,计算富集,得到结果后进行绘图。

操作步骤:

(1)首页检索【富集气泡图】跳转到操作页面。

(2)在左侧框内输入数据后点击提交即可。输入数据格式须与右侧示例数据格式一致,制表符分割

(3)右侧数据示例、输出图片展示以及数据说明:

数据包括4列,第一列是富集的名字(Y轴显示内容),第二列是富集倍数(X轴显示内容,若没有这个数据,可以用其他值代替,例如generatio等,都没有的话,1,用-log10(pvalue)代替这一列;2,用count代替这一列),第三列是p值(或者fdr也可以,即图中的颜色,根据p值变化),第四列是基因数(气泡大小)

2、聚类热图

利用颜色表示表达值(原始或标准化),并使用距离矩阵进行聚类。

(1)输入数据,设置图像大小、字体大小,点击提交。

注意:1,若基因有重名的,取均值;样品也不能有重名的。2,制表符分隔,可以在excel中做转化(例如log2等,这里默认数据已经处理好),然后贴过来。变种:若数据仅0,1,那么可以选择前后两种颜色展示(例如黑白),若数据仅三种(例如-1,0,1),则可以选3种颜色展示。

(2)参考数据说明。

第一行为group名字,第二行为样品名字,其余为数据(其中第一列是基因名)

(3)输出图片:鼠标右键“另存为”保存图片,默认svg矢量图,文件后缀不用改。

3、(m6A和表达谱)联合分析散点图

使用相同基因的m6Alog2倍数变化和表达谱倍数变化绘制散点图。从两个维度展示相同基因的变化情况,常用于展示联合分析结果,例如甲基化修饰和表达。

(1)输入数据、设置参数

(2)输出图片

4、火山图

芯片,测序等的火山图。

(1)输入数据:

(2)设置参数:

(3)点击提交,得到美丽的火山图。

5、箱体图、盒形图(boxplot)

常用于表达谱芯片、转录组测序等,用于描述样品间的整体特征,若box图参差不齐,则表示样品差异比较大。

(1)输入数据,设置参数。(PS:数据为矩阵形式。默认可以画20个,前12个颜色可选,后边8个默认白色)

输出图片展示

通过以上几个图的绘制过过程,相信大家都能看出用这个工具画图有多简单。这不还得赶紧去试试,那么多数据图类型,总有你需要的!

三、绘图常见问题

1、输入数据后不出图怎么办?

程序对输入格式有严格要求。查看右侧说明及示例数据。常见错误包括:非制表符分割,数据列数不对,没有带title等。

2、如何导出图片?

3、编辑图片方面如何编辑以满足杂志需求?

默认Arial字体,下载Inkscape软件(最兼容,推荐,inkscape常用技巧),打开另存的svg文件,修改布局,文字等后,导出pdf或其他格式图片。

4、如何引用?

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