王老师带你玩转FlowJo?之脱胎换骨的细胞增殖分析

FlowJoV10.7版本重点升级之一就是增殖分析平台(ProliferationPlatform)。今天,我们就跟随王老师一起来看一下升级后的平台所具备的精彩功能吧!

//1.细胞增殖分析的实验方法

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BDFlowJo

1.1CFSE检测:

CFSE是一种亲脂性染料,可被细胞膜吸收。细胞标记CFSE后再诱导增殖,分裂后的细胞将含半量的CFSE,如此可监控细胞分裂的数目。

1.2VPD450检测:

BD生物科学的BDHorizonVPD450是一种非荧光的酯化染料,同样可以被吸收进入细胞。染料一旦进入细胞内部,酯酶会切割酯基,将染料变成细胞内的荧光产品。随着细胞的复制,细胞内的染料数量逐渐减少,形成了特征的图案。由此,我们可以采用多色流式技术从有限的样品量中获得更多的数据。

1.3BrdU检测:

Brdu是5-溴脱氧尿嘧啶核苷,BrdU可代替胸腺嘧啶渗入DNA的合成,BrdU荧光抗体检测渗入量,反映细胞增殖情况。此外Brdu可以在分析细胞周期时让S期更为精准。

(点击图片可放大查看)

//2.FlowJo细胞增殖分析平台

2.1确定“第0代”峰

增殖实验通常将使用未刺激的样品开始分析,以确定“第0代”峰。第0代高峰代表未分裂的细胞,在增殖实验中收集的样本中应该有相对一致的强度和CV。在增殖实验中,在未受刺激峰周围画一个线性门门来设置“0代”峰。

2.3数据自动分析和手动微调

FlowJo首先会拟合出代表该群体的最优峰比和CV。这些可以手动调整和修复,以便它们在扩散分析中保持一致。还需要调整峰值的数量,以表示分析中出现的峰值的数量。通常,FlowJo将设置一个接近预期0.5%的峰值比率。预计细胞每分裂一次,两个子代细胞中的每一个都会有一半的染色量,因此它们的信号强度也会减半。

2.4自动生成每个增殖峰的细胞门

“CreateGates”按钮可以用来快速地在代表每个增殖峰的细胞群上创建门。

2.5图像选项优化结果图

图形选项通过添加峰值数或DrawModelSum来影响增殖显示,DrawModelSum将增殖峰值的重叠相加,创建一个类似于原始数据的形状。

2.6增殖统计数据获得

2.7数据结果导出

2.8增殖数据定义

DivisionIndex:分裂指数是指原始细胞群中细胞分裂的平均次数。即使对于从未分裂的细胞也是平均水平。(例如:包括未分裂的细胞峰)。

ProliferationIndex:增殖指数是细胞分裂的总数除以进入分裂的细胞数。增殖指数只考虑了至少经历过一次分裂的细胞,也就是说,只有增殖的细胞才反映在增殖指数中。这是一个很有用的进行样本间比较的值,因为它只考虑增殖的细胞。增殖指数更真实地反映了样本中增殖细胞的生物学特性;分裂指数反映了整个样本等状况。

PeakCV:增殖峰CV是峰的变异系数。所有峰值的CV值都相同。通常情况下,这个数字是4-7%。

Peakratio:增殖峰比率是后续峰之间的荧光比率。例如:0.5表示n峰的荧光量是n-1峰的一半。比值>0.5是没有生物学意义的,通常出现在logamp不是很好。所以该值应该接近0.5。

2.9增殖数据案例分析

举例:作为增殖指数和分裂指数如何计算的例子,如下:

G0=15888

G1=32922

G2=1364

G3=897

*培养开始时的细胞数:15888+(32922/2)+(13647/4)+(897/8)=35872.875

*分裂细胞总数:(32922/2)*1+(13647/4)*2+(897/8)*3=23620.875

*进入分裂的细胞数:35872.875-15888=19984.875

*分裂指数:23620.875/35872.875=0.66

*增殖指数:23620.875/19984.875=1.18

如果模型对数据拟合不理想,可以通过调整模型参数得到较好的拟合模型。

与FlowJo中的所有其他平台一样,增殖node可以通过拖动应用于一组样本。每一代都可以双击node打开图表单独分析。

-InterpretationofCellularProliferationData:AvoidthePanglossian.MarioRoederer,CytometryPartA,79A:95101,2011

-AssessingAntigen-SpecificProliferationandCytokineResponsesUsingFlowCytometry.AllsoppandLanghorne,EditedbyDeniseDoolan,MalariaMethodsandProtocol,p.409

-Antigen/Mitogen-StimulatedLymphocyteProliferation.Whiteside,MeasuringImmunity,Chpt.31p.364

-UseofCell-TrackingDyestoDetermineProliferationPrecursorFrequenciesofAntigen-SpecificTCells.Givan,Fisher,Waugh,Bercovici,Wallace.FlowCytometryProtocols2ndEd.p.109

-ProliferationAssaysBasedonBrdUIncorporationorCFSELabeling.Maecker,ImmunotherapyofCancer,Disis,p.62

-MonitoringTCellProliferation.Hodgkin,Hawkins,Hasbold,Gett,Deenick,Todd,Hommel.AnalyzingTCellResponsesByDirkNagorsen,FrancescoM.Marincola,p.122

(以上图片可点击放大查看)

以上就是王老师为大家带来的FlowJo增殖分析平台全面的全面解析,希望能够给每一位流式工作者带来帮助。最新升级版FlowJo增殖分析平台平台尽在V10.7版本,快来下载体验吧!

最后我还要提醒老师们的是,目前正版FlowJo还可以申请30天免费试用版本,我们也为大家准备了新手速成培训课程;对于已购买的老师们,我们更是准备了详细的视频培训讲解,大家赶快用起来吧!

THE END
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