云南智库依托云南省社会科学院，负责人由云南省社会科学院院长、副院长兼任：
主任：纳麒教授、博士
副主任：杨福泉研究员、博士
任佳研究员、博士
边明社教授、博士
（二）办事机构
1、办公室：
主任：杨炼
副主任：蔡欧李坚
主要职能：内外联络、综合协调、信息沟通、财务和固定资产管理、监督管理
传真：0871—4142394
2、科研部：
主任：郑晓云
副主任：李向春李立纲
主要职能：研究咨询类项目洽谈、承接、管理，项目成果评估、知识产权认定与运用
3、宣讲团：
团长：董棣
主要职能：教育培训、理论宣讲、知识普及等项目洽谈、承接、管理和组织实施
4、人事部：
主任：王文成
副主任：李跃明任仕暄
主要职能：人才招聘、调配、引进，特约研究员选聘，智库人才培训
5、信息中心：
主任：郑凡
副主任：谢蕴秋
主要职能：智库网页制作管理，信息发布，开展网上咨询、网络调查等
6、后勤部：
主任：郑海
副主任：李晓铃
主要职能：智库安全保卫、后勤保障、服务
7、图书馆：
馆长：穆文春
副馆长：毕先弟
主要职能：专业文献检索、查新，智库书籍资料收藏、借阅服务、管理
8、编辑部：
主任：黄淳
主要职能：智库论文审阅、编辑、出版
（三）研究机构
1、马克思主义研究所
所长：刘阶群
副所长：黄小军
2、哲学研究所
副所长(主持工作)：肖飒
3、经济研究所
所长：康云海
副所长：马勇宣宜
4、民族学研究所
所长：王清华
副所长：饶琨杜娟
5、民族文学研究所
所长：郭家骥
副所长：石高峰李金明
6、东南亚研究所
所长：王士录
副所长：李见明
7、南亚研究所
所长：王崇理
副所长：陈利君
8、历史研究所、文献研究所：
所长：胡华生
副所长：颜恩泉刘景毛
9、社会学研究所
副所长(主持工作)：樊坚
10、宗教研究所
所长：杨学政
副所长：古文凤
11、农村发展研究所
所长：郑宝华
副所长：赵鸭桥
（四）项目组
云南智库根据智库工作需要,以项目为依据，由智库特聘顾问、项目首席专家、项目组成员组建项目组，按照项目组长负责制，具体负责项目组织实施。