清代的私人藏书目比较多，最著名的有清初钱曾(字遵王)的三种藏书目录：
一、《也是园书目》，收录书籍三千八百余种，只记载书名、卷数。
二、《述古堂书目》，收录书籍两千二百余种，除记载书名、卷数外，间或著录册数和版本。
三、《读书敏求记》，收录书籍六百三十四种，其中有很多是《也是园书目》所未收入的善本书，是钱氏藏书中的精华。
这几种书目的特点是：一、收藏丰富。三种书目的总数，即使除去重复，也超过《四库全书简明目录》。二、《也是园书目》继承了明代赵琦美“脉望馆”藏书中的很多钞本和刻本，其中数百种古代小说和戏曲剧本，都是极为珍贵的文学资料。三、《读书敏求记》对宋元古籍的版本情况考订精详，是研究版本学的重要参考资料。
作为研究资料，这三种书目各有短长。但重复既多，又各有不同，应用时不便，所以一九五八年上海古典文学出版社把这三种书目合编在一起，题为《虞山钱遵王藏书目录汇编》，由瞿凤起编撰。
由于这三种书目的分类和编排次序都不相同，《汇编》就以《也是园书目》为纲，仍按照其原有次序排列。其余两种书目所收与“也是园”重复而版本不同的，即列于《也是园书目》之下。凡是《也是园书目》所未收的，则增补于每类之后。
《汇编》共分为经、史、子、集、三藏、道藏、戏曲小说等十卷。除去重复，收录书籍总数为四千一百八十种。书后附有《述古堂书目》、《读书敏求记》原目二种，还附有原书序跋、刻书序跋等。并编有书名和著者姓名的四角号码综合索引。
清初黄虞稷(字俞邰)也是一位书目学专家，他曾编撰过《宋史艺文志补》、《辽金元三史艺文志补》等书，并参与修撰《明史·艺文志》的工作。他所编的《千顷堂书目》三十二卷，著录明代的各种著作比较完备，是检索明人著作的重要工具书。
《天一阁书目》是明清之际非常著名的一种书目。明代嘉靖年间，浙江宁波大官僚范钦，搜集古籍七万余卷，藏于自建的“天一阁”，被称为当时浙东最大的藏书家。范氏曾手编书目，久佚不传。明清之际，宁波遭受兵燹，藏书遗失十分之二。清代初年，黄宗羲曾到阁内看书，钞有目录，现在也已失传。
清代嘉庆年间，阮元编有《天一阁书目》十卷(一八○八年即嘉庆十三年刻本)，由于杂出自众手，遗漏很多。
到了清朝末年，天一阁焚于兵火，藏书大部分被毁或遗失。光绪中叶，薛福成根据阁中所余藏书，编成《天一阁见(现)存书目》四卷，著录书籍约两千种。卷末附以“进呈书目”、“范氏家著”、“石刻碑目”和“新藏书目”等四种。
一九一四年和一九一八年，天一阁中藏书又连续被盗，所余书已无几。一九三○年，杨铁夫又编有《天一阁图书目录》，金陵大学中国文化研究所一九三二年出版，著录书籍九百六十二种，共七千九百九十一册，只及薛氏《见存书目》的二分之一。但此目仓促编成，与藏书实际情况并不符合。
一九三七年，冯贞群又根据阁内实际藏书情况，经过详细调查整理，编为《鄞县范氏天一阁书目内编》。据原序说：“幸存之籍，尚有千五六百种。”比杨氏书目多出六百多种，不过其中有很多残本。这部书目分为五部分：一、劫余书目次;二、书藏目次;三、范氏家著;四、附录;五、补遗。全书凡十卷，一九四○年由“鄞县重修天一阁委员会”刊印。
天一阁藏书虽历经洗劫，所存不足十分之二，但其中仍有很多稀见古籍，保存了不少珍贵的文化遗产和历史资料。以上这些书目仍是可以利用的工具。
此外，上海古典文学出版社重印了一批明清私人藏书目，计有：明赵用贤编撰的《赵定宇书目》，清赵宗建撰的《旧山楼书目》，以上系一九五七年出版。又有：清马瀛著、潘景郑校订的《吟香仙馆书目》、清祁理孙撰的《奕庆藏书楼书目》等，以上系一九五八年出版。其中《奕庆藏书楼书目》是根据前燕京大学图书馆所藏旧钞本整理付印的。这一旧钞本的外皮题为《鸣野山房书目》，并冠以沈复粲墓表等，实系张冠李戴;而该出版社于付印时竟未发现，仍以讹传讹，题为清沈复粲编《鸣野山房书目》。读者使用时应予注意。（吴小如吴同宾）