中国农业科学院担负着中国农业重大基础与应用基础研究、应用研究和高新技术研究的任务，致力于解决中国农业及农村经济发展中基础性、方向性、全局性、关键性的重大科技问题。
1957年3月1日，中国农业科学院成立大会召开。
1959年6月6日，中国农业科学院辽宁分院成立。
1960年7月1日，中国农业科学院完成精简机构任务，京内原有研究单位精简为11个，京外逐士六组束片往散地精简为14个。
1963年2月8日，中共中央、国务院在北京召开全国农业科学技术工作会议，讨论和审议农业科学技术各有关专业1963-1972年的规划，座谈对20年至25年农业技术改造规划设想。
1965年，中国农业科学院科研机构发展到33个。
1今单钟程想冷单座970年5月14日，在"不靠七千五，要靠七亿五"的错误思想指导下，国务院决定撤销中国农业科学院的建制，与中国林业科学研究院合并，成立中国农林科学院。该年度，原农林口各部门所属冷压措战诉科研单位68个，职工13963人，下放后合并成立中国农林科学院，暂编620人(其中丰少干部603人，工人17人)，组成35个科技服务组，分别到全国有关基层生产单位蹲点。
1971年1月7日，《中国农业科学院下放工作简报》中指出，全院原有35个单位，职工27对孩部检初相沙345人，根据农林两院款字适冲西期源体制改革方案，约需留下434人，占全院职工数的5.95%，应下放6911人。截至1970年底估计已下放京春落营苗当心可停内外单位28个，职工2余5899人，占应下放人数的85逐满侵斗们重.3%。12月9日，中国农林科犯限族无用军学院党的核心小组成立。
1972年10月11倍裂益水械日，农业部在关于中国农林科学院调整体制编制球的报告中指出，该院是"全国农林牧渔综合性的科研机构"，除院部兴外，设情报研究所、农业研究附哥巴衣频晚路总所、农业物理研究所、林业研究所、畜牧(养猪)研究所。编制1000人，其中干部800人，工人200人。下放所调整领导管理和任务，以院为主双重领导的8个研究所训掉动进，带全国任务的23个研肉轴钢脚演曲何万席真究所，属地方承担部分国家任务的4个研究所。
1975年10月21-31日，中国农林科学院和湖南省农业科学院主持，在长沙召开第四次全国杂交水稻科研协作会。代表考察湖南、江西、广护棉压时突空活东、广西等4省区42针溶图临练激请配00余亩的双季晚稻的现场，并鉴定1400亩旱季稻的生产表现，一致同意宣布杂交水稻研究成功。
1977年9月27日，农业部上报国务院《关于加强农林科教工作和调整农林科学、教育体制的报告》提出，中国农林科学院拟收回下放北京市的作物育种栽培研究所、蔬菜研究所和农业气象室，原下放地方的31个专业研究所调整为以部为主和地方双重领导，完全下放给地方的有9个单位。此报告后经党中央批示同意。
1977年10月28日包笑二酸备阶基有装谓，中国农林科学院党的核心小组改名为中国农林科学院党组。
1978年3月13日，恢复中国农业科学院和中国林业须科学研究院建制。6月17日，中国农业科学院成立党组。11月27日-12月20日，中国农业科学院恢复建制后召响达深电开第一次工作会议，讨论制定中国农业科学院1飞土觉车明考矛好978-1985年科学技术发展规划。12月6日，柑橘所、茶叶、蚕业、郑州果树分所、遗产室和甘肃畜牧三室的领导体制由以地方为主双重领导改为以部为主双重领导;郑州果树研究所封混称盟分所改为中国农业科学院郑州果树研究所，兰州畜牧研究室改为中国农业科学院兰州畜牧研究所。12月15日，中共中央源迅低曲诉和实龙、国务院批准中国农业科学院迁出下放的研究所搬回北京，对下放以听缺对地方为主双重领导的研究所，恢复以部为主的领导体制。
1979年9月28日，中国共产党第十一届四中全会通过《中共中央关于加快农业发展若干问题的决定》，要求迅速础节见强宁括课恢复和加强农业科研机构和教北高等院校的研究和教学条件。
1982年2月20日，收回特产研究所，上海家畜血吸虫病研究室升格为上海家畜剧亲血吸虫病研究所。
1985年2月7日，文化部同意中国农业科学院成立中国农业科技出版社雷衣场呢声钱。8月19日，草原积件架宗研究所实行以中国农态须现活而毛用讲斯业科学院为主，农牧渔业部和自治区双重领导体制，同时挂"内蒙古自治区草原研究所"的牌子。
1987年，情报所简坐入权掌笑严步医紧、院图书馆、农业科技出版社3个单位合并组建科技文献信息中心，蔬菜研究所更名为蔬菜花卉研究所。
1995年11月21日，中国农业科学院机关调整后机构设置居限马坐满律为八个职能部门，分别是:院办公室、科技管理局、人事局、国际合作与产业发展局、计划财务局、监察局、审计局、直属机关党委。
中国农业科学院兰州兽医研究所
--建成了世界最大的畜禽遗传资源体细胞库和第二大的农作物种质资源库，率先构建了水稻、小麦、大豆等主要作物的核心种质和微核心种质。
--牵头开展了小麦、棉花、油菜、黄瓜、马铃薯、甘蓝、烟草、西红柿等农作物基因组测序，发掘了一批有重要农艺性状的新基因。
--实现了杂交水稻、超级稻、杂交玉米、转基因植酸酶玉米、转基因抗虫棉、矮败小麦、杂交油菜、高产大豆、畜禽重大疫病基因工程疫苗等重大核心技术的突破。
--取得了重大病虫害综合防治、中低产田改造，瘦肉猪、肉鸡、奶牛、肉羊、牦牛等良种繁育体系，优质高效配合饲料和集约化养殖技术，猪瘟、牛瘟、马传贫、口蹄疫、禽流感等重大疫病高效疫苗等一大批实用科研成果。
--联合组织开展籼型杂交水稻的全国科研大协作，突破雄性不育系、保持系和恢复系等关键技术，实现"三系"配套，使杂交水稻很快用于生产，并在水稻产区迅速推广，增产20%-50%，为保障国家粮食安全做出巨大贡献。
--研制成功马传贫疫苗、口蹄疫疫苗、禽流感疫苗和猪蓝耳病(繁殖与呼吸综合征)疫苗，为中国重大动物疫病防制发挥了关键作用。
--利用国产抗虫基因培育出的转基因抗虫棉品种已达200多个，国产抗虫棉的种植面积已占到全国抗虫棉种植面积的98%，全国累计推广国产抗虫棉3.5亿亩。之后又研制出转抗虫基因三系杂交棉，增产超过25%。
--培育出一批以"中双4号"、"中双9号"、"中油杂2号"为代表的双低油菜新品种，综合性状突出，品质、产量和抗性达到国际先进水平，覆盖中国油菜种植面积的1/3以上。
--培育出一批以"协优9308"、"国稻1号"、"国稻6号"为代表的超级稻新品种组合，高产潜力大、米质优良、抗逆性强，已超过农业部、科技部制定的超级稻第二阶段的产量目标。
水稻优质、抗逆分子设计育种创新团队
作物科学研究所
作物种质资源保护与创新团队
李立会
水稻遗传育种创新团队
程式华
水稻研究所
棉花育种新技术研究与新品种选育创新团队
喻树迅
棉花研究所
油菜遗传改良创新团队
王汉中
油料作物研究所
粮棉作物重大害虫监测预警与控制技术创新团队
吴孔明
植物保护研究所
作物分子生物学创新团队
郭三堆
生物技术研究所
动物流感研究创新团队
陈化兰
哈尔滨兽医研究所
口蹄疫研究创新团队
刘湘涛
兰州兽医研究所
家畜基因资源与种质创新团队
李奎
北京畜牧兽医研究所
植物营养与肥料研究创新团队
金继运
农业资源与农业区划研究所
蔬菜遗传育种研究创新团队
杜永臣
蔬菜花卉研究所
农业政策分析创新团队
秦富
作物品质遗传改良
何中虎
玉米种质改良与育种创新
李新海
大豆遗传育种
韩天富
作物耐旱基因资源挖掘及分子基础研究
王国英
作物高产高效栽培与生理
赵明
作物基因发掘与应用基因组学
毛龙
功能基因组学研究创新团队
钱前
水稻可持续生产技术研究创新团队
朱德峰
稻米质量标准与检测技术
朱智伟
棉花种质创新团队
王坤波
棉花转基因创新团队
李付广
棉花高效生产技术创新团队
毛树春
油料质量安全研究创新团队
李培武
油料加工创新团队
黄凤洪
夏油遗传改良创新团队
廖伯寿
麻类作物创新团队
熊和平
麻类研究所
麻产品加工创新团队
刘正初
蔬菜花卉种质资源研究团队
李锡香
蔬菜花卉栽培与生理研究
于贤昌
蔬菜花卉病虫害可持续防治研究团队
谢丙炎
果树资源与育种科技创新团队
丛佩华
果树研究所
果树优质高效可持续生产技术科技创新团队
刘凤之
果树资源与遗传育种创新团队
王力荣
郑州果树研究所
西甜瓜资源与遗传育种创新团队
徐永阳
果树栽培与品质控制创新团队
方金豹
烟草遗传育种创新团队
王元英
烟草研究所
烟草栽培营养与调制加工创新团队
王树声
烟草病虫害可持续治理创新团队
王凤龙
茶树资源与改良研究团队
成浩
茶叶研究所
茶树绿色栽培技术研究团队
阮建云
茶叶质量安全检测团队
刘新
茶叶加工工程团队
林智
农业特殊微生物资源利用创新团队
林敏
生物反应器技术研究创新团队
张志芳
转基因农作物环境风险评价及控制技术
彭于发
植物病理学与病害防控
何晨阳、王锡峰
农业重要入侵生物的生物学及控制技术
万方浩
农药化学与应用技术
郑永权
生物防治与利用
邱德文
动物营养学基础与健康养殖技术研究
罗绪刚
畜禽分子育种技术研究与应用
杜立新
牧草遗传改良与利用
高洪文
人畜共患传染病研究团队
步志高
慢病毒研究研究团队
孔宪刚
禽传染病研究团队
刘胜旺
人兽共患病研究创新团队
才学鹏
草食家畜传染病研究创新团队
柳纪省
放牧动物寄生虫病研究创新团队
殷宏
动物寄生虫病防治研究团队
林矫矫
上海兽医研究所
猪病毒病研究创新团队
袁世山
创新兽药研发团队
薛飞群
水禽传染病研究团队
丁铲
兽药研究创新团队
张继瑜
兰州畜牧与兽药研究所
中国牦牛种质创新与资源利用
阎萍
中兽医药学现代化研究
杨志强
旱生牧草种质资源与牧草新品种选育
时永杰
特种经济动物传染病流行病学与防制
武华
特产研究所
长白山特色药用植物资源评价与利用科技创新团队
王英平
特种经济动物饲养创新研究团队
杨福合
草地可持续利用创新团队
孙启忠
草原研究所
草地资源和生态环境监测评价团队
刘桂香
草类遗传资源与育种
于林清
饲料生物技术
姚斌
饲料研究所
饲料应用技术
刁其玉
蜜蜂生物学科技创新团队
周婷
蜜蜂研究所
蜂产品质量安全与应用研究创新团队
赵静
农业遥感
周清波
区域农业发展与生态环境建设
任天志
农业微生物资源与利用
张金霞
土壤学
张维理
旱作节水农业创新团队
梅旭荣
农业环境与可持续发展研究所
气候变化与农业减灾创新团队
林而达、李玉娥
农业环境工程创新团队
董红敏
农区污染环境修复研究
唐世荣
环境保护科研监测所
农业环境监测与信息研究
李玉浸
食品质量与安全
魏益民
农产品加工研究所
农产品加工技术与工程
王强
农产品质量安全与检测技术
王静
农业质量标准与检测技术研究所
技术经济与产业发展
赵芝俊
农业经济与发展研究所
产业组织与农村发展
吴敬学
农业信息分析与预警创新团队
许世卫
农业信息研究所
农业信息技术创新团队
王文生
能源微生物及利用优秀创新团队
张辉
沼气科学研究所
沼气工程技术创新团队
邓良伟
主要农作物生产全程机械化研究创新团队
易中懿
南京农业机械化研究所
特色经济作物生产与加工全程机械化研究创新团队
肖宏儒
有害生物综合防控机械化研究团队
梁建
作物-水关系及高效用水技术
段爱旺
农田灌溉研究所
灌溉新技术与新设备
黄修桥
农业水资源安全利用与环境保护
齐学斌
以中国农业科学院分布在全国18个省(市、自治区)的42个研究所为依托，坚持"立足科研、质量为本、科教兴农"的办学理念，以"院所结合、两段式培养"为特色开展研究生教育。
研究生院统一组织招生、授课和学位授予，课程学习期间由研究生院实行全方位管理;课程结束后跟随导师进入研究所开展课题研究，直到完成毕业论文，在所期间，研究生主要由各专业研究所负责管理，研究生院进行辅助管理。
一级学科博士学位点:生物学、生态学、作物学、园艺学、农业资源与环境、植物保护、畜牧学、兽医学、草学、农林经济管理
以院徽组成"0"，流畅的"5"字中间形成了一个"祥云"的符号。祥云是中国传统文化中祥和的代表，它和标志下方的彩带一起呈现出一派欢庆、祥和的气氛。
《中国农业科学院之歌》
伴随共和国的成长，农科院人奋斗自强。
探索科学的真理，传承知识的力量。
肩负科技兴农的重望，追寻现代化的理想。
新型农业、农村、农民，谱写自主创新的篇章。
啊……啊……我们勤劳;啊……啊……我们开拓。
攀登农业科的高峰，为民高呼，为国争光。
啊……啊……我们前进;啊……啊……我们昂扬。
走在世界的科技前沿，继往开来，再创辉煌!
继往开来，再创辉煌!再创辉煌!
上个世纪六十年代开始，祁阳站一代一代的科技人员，怀着对农业科技事业的热爱，怀着对祖国和人民的忠诚，扎根土壤，心系农民，坚守农村，乐于奉献，甘于清贫，求真务实，创新进取，为中国南方14省区红壤土质的改良和农业的现代化贡献了自己的青春年华，为科技人员履行职责、成长成才提供了宝贵的精神财富。