开篇：写作不仅是一种记录，更是一种创造，它让我们能够捕捉那些稍纵即逝的灵感，将它们永久地定格在纸上。下面是小编精心整理的12篇生物信息学论文，希望这些内容能成为您创作过程中的良师益友，陪伴您不断探索和进步。
一、开设课程的必要性
空前繁荣的生物医学大数据的产出，及其蕴含的重大生命奥秘的揭示，将决定现代生命科技和医药产业研发的高度，决定人们对疾病的认识和掌控能力，也将对主导生物医学大数据存储、管理、注释、分析全过程，解决生命密码的关键手段———现代生物信息学技术的发展带来前所未有的机遇和挑战[2]。对于医学专业学生而言，通过学习生物信息学，从而掌握利用各种网络信息资源来检索和获取生物信息数据，并选择和使用各种生物信息学软件来分析数据。在当今大数据时代，这方面的知识和技能的培养对于医学生今后从事医学科研工作是非常重要的。因此，在医学专业学生中开设生物信息学课程非常必要。我校从2010年开始将生物信息学设置为研究生教学的必修课；从2013年开始在医学检验专业中开设生物信息学选修课，自2015年开始转为医学检验技术专业。在医学检验技术专业中开设生物信息学课程，能够为该专业学生的临床和科研方面的素质积累提供必要的支持，更重要的是增强了在医学和信息科学交叉领域解决问题的技能，其意义几乎等同于在研究生教学中的设课意义。
二、教学内容的安排
三、教学方法的设计
四、考核方式的变革
五、展望
实践表明，生物信息学课程教学能够给学生提供所需要的生物信息学知识和技能，但是在教学内容安排、教学方法设计、教学手段使用和教学效果评价等诸多环节都需要进一步探讨。在这个过程中，我们既需要吸收传统教学模式中的优点和精髓，做到严谨和切合实际，又需要更新教学理念，突出医学特色，大胆尝试新的教学方法和手段，最终形成本课程别具一格的教学特色。
作者:伦永志单位:大连大学
参考文献
关键词：生物信息学；本科教育；实践与体会
湖南农业大学生物信息学本科专业2004年获教育部批准增设，2005年正式招生，是国内最早开展生物信息学本科教育的高校之一，为社会培养了近500名生物信息学急需的人才。
一、农业院校开展生物信息学本科教育存在的主要问题
1.师资力量薄弱，教师知识结构单一。我校在2004年申报生物信息学本科专业时，主要是以植物保护学院植物病理学系的教师为基础，结合昆虫学系讲授生物统计课程的教师，组建了生物信息学系。教师的专业背景主要为植物保护、生物学等方面，知识结构相对单一，计算机及数学理论方面的知识缺乏。
3.教学硬件软件不足，难以满足培养专业技能的需求。生物信息学是一门新兴学科和前沿学科，应用性和实战性非常强。随着生物技术的迅速发展，生物学数据每年都成倍增加，生物信息学的研究方法不断改进，研究内容也随之增加[2，3]。专业创办之初，国内生物信息学呈现“小荷才露尖尖角”的发展之势，有关生物信息学的中文版教材非常少，有关生物信息学软件的使用方法和实验指导的中文版更是凤毛麟角[4]。
二、解决办法
1.加大师资培训力度，引进外缘教师。为了让生物信息学专业的教师尽快适应生物信息学的教学，学院和学校加大了对生物信息学专业的师资培训力度。全系所有教师都参加了浙江大学主办的“基因组科学研习班”，有7人次赴日本、美国等地开展生物信息学方面的科研工作，提高了对生物信息学的基础理论认识和实践操作技能。
2.利用传统农科专业优势，形成我校生物信息学的专业特色。我校生源的自身特点和基础知识不允许我们在制定人才培养目标和课程设置时，生搬硬套综合性院校生物信息学专业的教学模式，必须根据我校的人才培养目标和我校的传统农科专业的优势。我校生物信息学专业立足湖南，开展水稻、油菜、棉花、柑桔等农作物抗病基因和重要病原物的基因组以及资源微生物功能基因组方面的研究，这为加速湖南省的经济发展做出了贡献。
4.加强实践教学训练，改革考核方法。2009年我院搬迁到新教学楼，给生物信息学专业安排了两间学生计算机机房，添置了50余台计算机。2015年建设了一个云教室，设有40个云终端，先后添置了10台高性能浪潮服务器以及2台高容量的存储设备，建立了一个小型的计算机集群，CPU计算核数达108个，内存达850GB，能满足生物信息学专业本科教学对服务器和计算机的需要，同时较大程度地缓解了科研的计算需求。
5.加大与生物信息公司的合作，与华大基因学院联合办学。与中国科学院北京基因组研究所、生物物理所等科研单位；与北京百迈客生物科技有限公司、上海美吉生物医药科技有限公司、深圳华大基因科技有限公司等单位签订校外教学实习基地协议；与深圳华大基因研究院签订了“基因组科学人才联合培养协议”，进行“2.5+1.5”联合办学。2015年只有1名学生入选“基因组科学创新班”，2016年有6名学生入选深圳市华大基因学院“基因组科学创新班”。
三、取得的成绩和主要体会
（一）取得的主要成绩
2.建立了一支热爱生物信息学专业的师资队伍。通过10年的建设，生物信息学专业的整体师资队伍得到了加强，现有9名专职教师中，教授4名，副教授3名，讲师2人；“湖南省新世纪121人才工程”第三层次人才1人，湖南省学科带头人1人，湖南省青年骨干教师4人；全部具有博士学位，7位有在国外留学1年以上的经历。将美国克莱姆逊大学罗峰博士聘请为湖南省百人计划，同时将美国伊利诺伊州立大学刘世名博士和爱荷华州立大学的李迅博士聘请为湖南农业大学神农学者讲座教授。目前我校生物信息系已形成了两个特色鲜明的团队：由袁哲明教授领衔的算法创新团队和由罗峰教授领衔的应用拓展團队。
（二）主要体会
1.结合优势办好生物信息学专业。生物信息学是一门交叉科学，涉及生物学、计算机、数学等领域，范围相当广泛。同时，生物信息学也是实用性相当强的技术，运用生物信息学的方法和技术可以解决生命遗传信息和生命活动信息中的实际问题。
2.加强实践教学，提高学生的实战能力。生物信息学是一门应用性强的专业，必须让学生通过大量的训练去熟悉生物信息学软件的应用。同时，教师在教学过程中，应该将教学与科研相结合，多为学生提供科研科题，让学生在科研中能够熟练地运用生物信息知识去分析和解决问题，从而更好地理解生物信息学的作用。
参考文献：
[1]徐光宪.21世纪是信息科学、合成化学和生命科学共同繁荣的世纪[J].化学通报，2003，66（1）：3-11.
[2]钟扬，张亮，赵琼.简明生物信息学[M].北京：高等教育出版社，2001.
[3]陈铭.生物信息学[M].第二版.北京：科学出版社，2015.
【关键词】大学本科生物信息课程建设教学
1.结合课程本质，加强教材的编写
2.加强教学与科研相结合，提高学生的实践能力
3.转变课堂模式，充分利用现代教育技术
生物信息学课程之中有很多都是非常抽象的知识，如果教师单纯的用板书去描述，用语言去讲解，可能会影响教学效果。因此，在教学实践中，教师要充分利用现代教育技术，包括计算机、网络、多媒体等，用更为直观形象、便捷的方式来激发学生的学习兴趣，拓展学生思维[4]。比如在讲解蛋白质二级结构预测时，教师就可以用Flash形象将这种螺旋、折叠和无规则卷曲的特征做出来，然后慢慢的一帧一帧的去播放，让学生可以立体地看到不同结构的区别，这样学生自然就会慢慢的产生兴趣。另外，教师还可以利用网络平台，让学们分小组对一些现象进行研究，通过文献查阅、分析交流，将结果做成PPT，展示给全班同学，以此来调动学生们的主体性，使他们更好地参与课堂活动。
4.结语
生物信息学是生命科学和信息科学等多学科交叉融合的新兴学科，是当今全球最具发展前途的学科之一。但是，生物信息课程作为一门新兴课程，其课程建设和教学模式必然有很多问题存在。因此，结合教学实践不断的加强对该门课程的研究，这对于进一步发展生物信息课程，以及目前正在广泛开始的生物信息专业的发展，都具有举足轻重的意义。为此，我们就需要一方面要提高教师自身的综合素质，另一方面还要加强该门课程所需要的实践条件，只有这样才能更快、更好的促进生物信息课程的快速发展。
[1]丁彦蕊，蔡宇杰.计算机专业生物信息学课程教学的实践探讨[J].安徽农业科学，2012（29）.
[2]孙啸，陆祖宏，谢建明.生物信息学基础[M].北京：清华大学出版社，2005：3.
生物信息学教学模式探索任务引领生物信息学是用数理和信息科学的观点、理论和方法研究生命现象、组织和分析呈现指数增长的生物医学数据的一门学科，它是生物医学、数学、信息科学以及计算机科学等诸多学科的崭新交叉学科。生物信息学几乎是今后所有生物（医药）研究开发所必需的工具。
一、生物信息学的课程特点
诺贝尔奖获得者W.Gilbert1991年提出了这样一个观点：传统生物学解决问题的方式是实验的，而现在，基于全部基因都将知晓，并以电子可操作的方式驻留在数据库中，新的生物学研究模式的出发点应是理论的，是一个科学家先从理论推测出发设定研究目标，然后再回到实验中去追踪或验证这些理论假设。而生物信息学研究正是从英特网上源源不断地采集数据，进行分析、归类与重组，发现新线索、新现象和新规律，用以指导实验工作设计，是一条既快又省的研究路线。它对于找寻一个研究项目的突破口是非常重要的，选定合适的研究出发点，可避免许多不必要的重复，最大程度节约研究资源，使研究成果最大化。鉴于该门技术对生物科学的理论、实践要求以及对信息技术掌握的要求，生物信息学课程与其他课程的教学有很大不同。
3.课程教学实践性强，同时涉及生物技术专业实践和计算机应用技术的实践，这需要教师在授课过程中根据学生的学习规律合理安排实践项目，发挥好这两种技术的协同作用。
二、生物信息学课程教学模式探索
1.教学目标与其所培养学生的核心技能
在课程目标的设定过程中，应牢记高校对文化的传承的功能，要使学生了解生物信息学发展的历程。在生物信息学学科发展过程中所涌现出来的著名学者，众所周知的震撼人心、启迪心灵的奇闻秩事，能使学生对这门课程产生浓厚的兴趣，甚至更深刻地领会这门课程的含义。
增强学生使用生物信息处理软件的能力，是生物信息学课程教学的重要目标。在世界各地，科学家每天都要通过序列比对软件进行成千上万次的序列比对。学生需要通过课程的学习熟练掌握各种生物信息处理软件，有时还有必要进行一些简单程序的设计，进而掌握发现新线索、查找新规律的工具。例如，目前，借助于生物信息手段的蛋白质预测是提供蛋白质结构及功能信息的重要方法，对这种预测方法的学习将使学生更多更快地了解蛋白质的信息，加深对生物技术科学的理解和运用。除了生物数据库和生物软件使用学习外，还要着重体现生物学文献调研和阅读、论文撰写等基本能力的训练，如EndNote文献管理软件的使用。
2.教学内容选择和教学顺序的组织
生物信息学的课程教学内容的选择，要紧随生物信息学的发展方向，涵盖最前沿知识和最先进技术领域。与此同时，教学内容的选择还应充分考虑学生基础和对该门课程的需求。生物信息学选课学生通常有两类，一类是具有较为扎实的生物学基础的学生，他们学习目的非常明确，其学习重点在于提高对生物信息实验所得结果的分析解释和验证能力。另一类是生物学基础相对较弱的学生，这些学生主要是为了了解生物信息学发展前沿、掌握检索能力以及初步的分析技能，对分析、处理、预测结果的验证涉及不多。无论哪种学生，都比较欠缺信息技术方面的知识，因此，这类知识在前面部分介绍。而后面部分则随学生的类型有所改变，我们根据授课学生的分类选择不同的授课内容和授课重点，尝试据此来划分教学组织的各个阶段，在每个教学节点精心设置任务（如表1所示）。
与其他课程的教学一样，生物信息学课程的教学需遵守学生对知识的掌握规律，其内容的选择与安排应按照循序渐进的原则。从第一阶段到第二阶段，教学内容“由易到难”。随着教学过程的深入，课程内容更侧重于对生物信息学某一专业领域的引导，此时授课教师的指导更加重要，这类领域往往与开课院系专业的优势研究领域和导师研究方向相结合。
3.课程教学方法的改革
生物信息学是一门涉及知识面深刻而广泛，学生独立自学的难度很大的交叉科学。依据建构主义教学理论的特点，这类难度大、技术性和实践性强的课程要特别重视以学生为教学主体的教学方法，应尝试从任务引领入手，将生物信息学的一些重要学习内容逐步展现出来。
学生在每个节点都非常清晰地知道下个节点的主题，并在完成教师的任务过程中，构建局部知识框架，形成自己的见解。教师需在课堂上和课堂以外及时掌握学生对各个节点知识的掌握情况，找到学生的最近发展区，针对重点、难点解惑，提高教学效果。这样可以使选择的教学任务吸引学生、引领学科前沿，还能在教学过程与学生的互动中有效地实现教学相长。
4.重视切合课程设计的教材编写
生物信息学不同于其他学科，其很多内容和知识节点更新很快，很多最新成果必须教师根据生物信息学发展前沿及时整理和总结，其教学内容设置着重于保证教学内容的先进性和前沿性。教材的更新和修订周期较短，几乎每学期均需要重新修订。
2001年，教育部在[2001]4号文件中明确要求直属高校的“本科教育要创造条件使用英语等外语进行公共课和专业课教学”，在信息技术、生物科学、管理、金融、法律等专业力争在3年内使外语讲授的课程达到所开课程的5%～10%，尤其强调了生物科学更要先行一步。现实情况也使英文自编教材的编写刻不容缓，现在，绝大部分前沿生物数据信息（最主要的核酸和蛋白质）数据库均为全英文操作界面，操作者只有熟练掌握生物信息学英文术语才能自如地使用该系统，才能更有效的进行生物信息学的学习和研究工作。在英文自编教材编写时，理论部分的参考书我们精心应选定了具有非常严谨理论体系和反应了最前沿生物信息技术的《BIOINFORMATICS：Databases，Tools，andAlgorithms》。编写时需要特别注意应依据教学设计来设定来序化任务，突出不同教学阶段的教学重点，使学生学习过程是个循序渐进的过程。我校采用的自编教材根据教学阶段共设置五个引领任务：
（1）Pubmed检索profilin基因研究进展；
（2）家蚕profilin基因结构分析与PCR扩增引物的设计；
（3）家蚕profilin基因同源序列的获取与进化树的构建；
（4）家蚕profilin蛋白二级和三级结构的模拟；
（5）家蚕profilin蛋白理化性质和功能位点的分析.
5.合理配置网络资源和多媒体教学资源
首先，学会利用互联网、计算机、数据库和应用软件进行生物信息分析的基本方法和技能本身就是生物信息学教学重点。以往普通的多媒体教室已难以提供一个交互式的网络化、信息化的教学环境，如果想上好生物信息学这门课程，网络资源和多媒体教学资源的应用，将贯穿于整个生物信息学课程（从任务下发及申领、任务控制及执行、任务完成结果检验与反馈）的整个教与学的过程。而我们通过极域电子教室和学校4A网络教学平台结合，较好的实现了生物信息学交互式的网络化、信息化的教学环境。
课前，教师通过网络平台将任务教学内容、任务序列、工具等传递给学生，学生通过登陆互联网络，利用网络资源和软件尝试完成预习任务。此处可以设置学情反馈点，教师通过网络论坛等形式掌握学生预习情况。授课过程中，教师利用教师机客户端的文件分发系统将任务教学内容、任务序列、工具等发送到学生桌面，再通过广播教学多媒体技术为学生形象的讲解任务内容以及完成方法。每位学生在教师的监督下在互联网上执行任务。教师在监控学生完成任务过程中，不断的得到学生任务进程的反馈，对于任务中学生出现共性问题，利用网络、广播教学或演示等形式及时解决。课下，学生同样可通过学校4A网络教学平台将任务报告、作业、问题和意见等反馈给教师，教师在平台上批改任务报告后将成绩和评语发送给学生，让学生及时了解自己的学习情况，师生还可以通过平台中的网络论坛进行问题讨论等。网络环境下的生物信息学任务引领式教学，不仅能提高学生的学习兴趣，还能创造更为有效的师生互动信息教学环境。
三、结束语
[1]张林，柴惠.现代教学手段在生物信息学教学中的应用[J].新课程研究，2011，219（4）：156-158.
[2]柴惠，赵虹，张婷.高等院校生物信息学双语教学课程建设之我见[J].中国高等医学教育，2010，（4）：83-84.
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[4]刘伟，张纪阳.“生物信息学”课程中研讨式教学实践[J].中国电力教育，2012，（23）：60-61.
[5]范丙友，贾小平，胥华伟.生物信息学课程教学改革与探索[J].大学教育，2013，（16）：61-62.
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(i0002)沉痛悼念乔群教授无
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(i0004)《中华整形外科杂志》2011年总目录无
临床论著
(401)乳腺癌保乳术后腹腔镜带蒂网膜瓣一期重建术宋向阳管丹丹林辉戴益郑雪咏朱一平王先法
(405)重度褥疮的临床治疗经验许喜生马铮铮周永生欧才生程勇陈凯李柏同周海洋胡永才
(411)咪喹莫特治疗婴幼儿血管瘤马刚林晓曦江成鸿陈辉李伟胡晓洁金云波陈达陈晓东叶肖肖
(415)小儿颈部巨大囊状淋巴管瘤的手术治疗刘大看马玉春郭晓楠朱晓爽董长宪
读者·编者·作者
(417)本刊对论文中实验动物描述的要求无
(418)游离胫后动脉穿支皮瓣修复手、足背皮肤缺损赵风景张兴群姚建民马亮张龙春陈莹
(421)改良vechitti阴道成形与腹膜阴道成形术的对比研究董丽霞陈树波
(424)型尿道上裂的解剖学修复李养群潘焕丽唐勇陈文赵穆欣杨刘晓吉胡春梅刘媛媛马宁谢淼
(427)悬韧带松解延长术后延长长度预测模型的建立和验证王洪一陶灵陈亮曹川李世荣
实验论著
(431)p57^kip2和maspin在病理性瘢痕组织中的表达蔡玉梅朱世泽郑志芳杨维群吴文艺
(437)饲服环磷酰胺对兔耳早期增生性瘢痕组织的影响邵家松孟德峰岳毅刚周海花鸣春张敏
(442)血管内皮干细胞动员剂对糖尿病小鼠颅骨缺损愈合的影响王晓霞stephenwarren
(448)四氯二苯二f英致胎鼠腭裂作用机制的初步探讨蒲亚兰刘丽玲甘立强何晓梦傅跃先
生物信息学
工作研究
(461)胸大肌后与腺体后隆乳术后患者损伤情况比较郭科孙家明苏永胜
(462)奈福泮与曲马多预防整形手术腰麻-硬膜外联合麻醉寒战的效果比较张治明欧阳帆王剑鸣赵振龙张安生
经验介绍
&nb
sp;(464)邻指指动脉岛状皮瓣修复手指皮肤软组织缺损侯桥曾林如王利祥许良吴国明朱芳兵
(465)先天性狭窄及闭锁八例手术治疗体会胡春梅李养群唐勇杨赵穆欣刘媛媛陈文马宁
技术改进
(467)介绍一种微创无菌快速获取可移植脂肪颗粒装置黄海玲刘宏伟佘文莉徐媛陈苑雯谢波肖丽玲
(468)薄膜涂色法在扩张皮肤面积测量中的评价谭子明沈为民彭旦生
病例报告
(470)会阴严重烧伤患者再造一例朱小平包国宏黄朝帅
(471)足拇趾离断再植及踝前穿支皮瓣修复成功一例储国平吕国忠赵庆国杨敏烈
综述
摘要大学生在大学是生活、学习、交流一直是当前高校教育的重点；新就职的高校辅导员在工作中也有许多需要学习和提高的地方。本人根据自己的工作经验，浅谈我与大一新生共助成长的经历经验。
关键字高校大一新生对策共助成长
在大学里，大学辅导员已经渐渐成为了一个专业化的职业。自从2011年硕士研究生毕业后，我开始担任2011级大一新生的班主任，我和学生们都一样，都是新的，新的工作/学习环境，新的工作/学习陪伴者，新的工作/学习压力。在这期间，我一直在努力学习班主任技能、了解学生心理、促进学生学习。学生们也积极努力的适应他们的大学生活，在这期间，我和他们互相交流，提出大学中遇到的问题，共同解决，做到了师生共助。
新专业的困惑生物信息学作为本世纪的一个新兴学科，现在已经发展成为生物信息学专业和生物技术专业，国内大部分人对此还不熟悉，不知道该学科的过去和未来。在开学初期，曾有许多学生咨询我转专业的问题，也有咨询本专业未来的问题。为了让所有学生们能够对生物信息学有个大致的了解，我开了个“我的生物信息”主题班会，从生物信息的过去、现在、和未来三个角度进行了讲解，将生物信息学在生物医学领域的重要性进行了重点的举例讲解，并给仍有困惑的学生分发专业论文进行阅读，经过这一措施，学生们开始对本专业有了雏形的概念。
学习中的苦闷大学是个自主的环境，没有家长和老师日日看管，没有了早晚自习的强迫学习。有许多学生到学校后不知道怎么学习，不知道学什么。在一次班会上，我对学生在校学习情况进行了调查，结果所有人都去过图书馆上自习，50%左右的学生每晚去寝室楼外上自习，有30%左右在寝室自习室上自习；有55%左右学生上课听课效果不好，只有一小部分学生对大学有过规划。从调查中我意识到学生们目前存在迷茫的因素，不知道如何学习，不知道学什么的情况。为了让他们能够尽早恢复到正规的学习轨道上，我开始策划建立学习小组，由几个学习较好并有意有能力向他人讲授的学生组成，他们的任务是从学生中搜集不会的题目或知识点进行讲解。正在我策划的过程中，学委找到了我，她说现在不知道怎么学，不知道学什么，不会的问题也不知道问谁，我向她讲了下大学的学习思维和方式，也讲述了我要组建学习小组的事情，她非常高兴，也非常希望能够快速组建。在第二天，我就通知各班班委会进行讨论，阐述我的想法并和他们商量实施细则。最终由学委牵头组建的学习小组非常迅速，每周安排了3次左右的专门讲课，学生们的热情也都很高。这个活动现在仍在进行。
新同学的生疏远去他乡求学路，聚在冰城同甘苦。总体来说，大一新生的交往能力，自立能力还是较强的，但是不乏沉默是金、见面飞过的尴尬场景。从心里学角度讲，大学生具有渴望交往但又能力不足的矛盾。在开学半个学期后的对班级进行人际关系调查时，我发现男女同学存在不认识、不打招呼的情况。为了加强学生交流，促进学生之间的了解，我提出举办年级联谊舞会、班级篮球赛活动。在舞会的策划过程中，我提出要求学生随机分组，随机排座，加入组间竞争环节；在班级篮球赛中，我提出要求每组每个寝室最多2个人，男女组队，进行半场4人对4人，要求两男两女，为了加强女生与女生配合，特指出女生投篮2分算3分，3分算4分。这些活动的开展极大程度的促进了学生之间的交流，也提高了他们参与活动的热情。在这些活动的影响下，学生们自己还组织了食堂周末包饺子、校园寻宝等活动。
大学是个集学习、生活、工作、交流的场所，只有营造使学生们能多方面成长的环境，才能使他们拥有乐观向上的生活和学习热情，我们的高校才能培养成优秀的国家栋梁之才。经过与学生们的互助成长，学生逐渐适应了大学的生活，逐个解决大学中的问题；我逐渐了解了大学生的成长需求和成长中的困惑，也为工作的开展奠定了良好的基础。
一、征文内容
二、征文要求
应征论文须用Word软件编辑，包括题目、作者、单位、必要的图表、结果和讨论、主要参考文献（2～5篇），用A4纸，版心尺寸为15cm×24cm，标题用小三号黑体，正文用小四号宋体，全文（包括图表）一般为一页，请勿超过两页。文末须附英文题目、作者姓名和单位。截稿日期：2015年3月15日。
三、收稿地址
有关稿件的处理意见、会议具体日程、注册费用、住宿安排等项事宜请见第二轮通知。会议筹备组联系人：
杨光富：027-67867800，;
钟鸿英：027-67862616，
张爱东：027-67867635，
关键词：入侵容忍；BLAST；InterProScan；Jemboss；生物信息分析
1概述
1.1生物数据库与分析系统
随着生物技术的深入发展和实验数据积累，产生了海量的生物信息资源数据库。一般来说，这些生物信息资源数据库可以分为一级数据库和二级数据库。
其中，一级数据库也称为基础数据库，其数据资源是直接从基础实验研究工作中获得的原始数据，它本身只是经过比较简单粗糙的归类、整理和备注注释。二级数据库则是在一级数据库的基础上，由不同的研究组织和研究者通过进一步的实验分析和数据整理而产生，它往往针对特定的研究目标衍生出来，是对生物学知识和信息资源的进一步挖掘和应用整理[1]。
许多科研部门与实验室纷纷利用Internet与一级、二级生物信息数据库进行链接，以满足生物分析研究的诸多需求。但是这种资源链接方式往往受制于Internet环境的影响，运行的安全性能较差，存在着巨大的数据安全隐患和风险。考虑到目前越来越多的生物信息学分析软件和数据库可以通过Internet免费下载获取。因此，可以采用第三代网络安全技术来构建一个安全、高效的本地化生物信息学分析平台，以满足生物信息研究的现实安全需要。
1.2入侵容忍技术
入侵容忍技术属国际前沿的第三代网络安全技术，也是信息安全领域的学术热点。第一代、二代安全技术均难实现系统绝对安全。入侵容忍技术承认来自内外的攻击不可避免，强调当受到攻击时即使某组件遭破坏或被控制，仍能保证数据的秘密性与完整性、保证系统关键功能运行，从而仍能对外提供正常或降级的服务。入侵容忍机制常可用冗余与多样性技术来实现。
2生物信息分析应用平台的构建
2.1系统构架
2.2BLAST配置
BLAST（basiclocalalignmentsearchtool），即基本局部相似性比对搜索工具，是美国国家生物技术信息中心（NCBI）提供的一套广泛应用于在蛋白质数据库或者DNA数据库中进行相似性比较的分析研究工具。它结合了动态规划算法和间接启发式算法的优点，把数据库搜索建立在了严格的统计学理论基础上，大大提高了搜索速度，是目前在技术上非常成熟且广泛使用的同源检索工具[2][3][4]。
2.3InterProScan配置
2.4JEMBOSS配置
3入侵容忍技术在平台中的应用设计
在本系统中，采用冗余与多样性技术来实现生物信息分析平台入侵容忍方案如图2所示[5][6]。外网的一级/二级数据库可以直接下载到本地数据库服务器中，因此在本模型中，仅考虑局域网内的应用。
在基于入侵容忍的生物信息分析平台应用模型中，主要包括几部分：客户端用户、服务器、Web服务器、数据库服务器[7]。系统模型工作原理如下：当客户（Client）通过Intranet访问Web生物信息分析平台时并提出服务请求（Request）时，首先经过由入侵检测系统与防火墙互联形成的外层保护组的过滤，并对请求数据进行验证，如果请求为带恶意的攻击行为，检测系统和防火墙保护组会对其进行控制和阻断，然后丢弃该请求数据包。如果确认此请求包是可信任时就将此发送给服务器（必要时可以设置服务器组）。
Web生物信息分析平台的服务器接收到服务器转发的请求后，执行入侵容忍策略的服务方针。该方针根据负载平衡的原则决定具体由哪些生物信息数据库服务器来执行请求，执行请求的全部过程都在集合成员一致性协议的指导之下进行。由于生物信息数据库服务器采用了冗余和多样性的技术配置，在异构环境下提供的是相同的数据服务，不会影响生物信息分析结果。此外，一致性协议还监督数据库服务器中成员（如DB2、Oracle、SQLServer等）的状态，能及时发现由故障引起的不一致，对有故障的数据库服务器进行隔离、处理。最后将除故障成员外的其他正常成员得到的一致的响应结果送回服务器。服务器检查其有效性后将结果送到客户端，形成最终响应（Response）。
4结束语
[1]廖志华，谌容，陈敏，杨春贤.生物学信息数据库简介[J].生物学教学，2006（31）.
[2]AltschulSF，GishW，MillerW，etal.BasicLocalAlignmentSearchTool[J].J.Mol.Biol，1990，215：403-410.
[3]周金华，朱涛，李红雨，徐钢，等.基于WEB页面的生物信息学分析平台的构建及其应用[J].中国现代医学杂志，2006（16）：17.
[4]周金华.基于Web页面的生物信息学分析平台的建立及其应用[D].上海：华中科技大学硕士论文，2006.
[5]陶雯.基于多级入侵容忍的数据库安全模型[J].江苏教育学院学报：自然科学版，2012（28）：4.
优秀本科毕业论文感谢信范文【一】
衷心感谢我的导师胡毅夫教授，胡老师严谨细致、实事求是的治学态度，认真勤奋、不知疲倦的工作作风，思维敏捷、锐意创新的研究风格以及对科研的执着追求都将使我终生难忘，时时鞭策我努力工作。
衷心感谢彭述权老师、樊玲老师，彭老师学问扎实、思维开阔、治学严谨且具有创新精神，在试验研究上的认真和细致让我肃然起敬，在理论分析上的高屋建瓴让我钦佩;樊老师在试验方案和现场给我们的很多建设性的意见让我们的试验柳暗花明，让试验顺利开展。
感谢和我一起做试验的塔里木大学的王强、马光诚同学，感谢所有在我科研和生活中给我关怀和帮助的老师和同学。
感谢我的家人，一路走来，谢谢你们对我的支持、包容和激励。是你们热切的期盼和温馨的鼓舞让我有了不竭的动力，勇往直前。
感谢我的同门师兄弟马元军、乌青松、马莉、谢小明等。难忘四年与大家的朝夕相处，那些曾有过的争执与欢笑，并肩奋斗与酣畅对饮以及汗洒疆场的意志与酒入愁肠的情谊，都是一生中最美的回忆。同学志四海，天涯犹比邻。分别的日子里，青春永不散场。
纸短情长，想要说的太多太多。
这一次转身过后，我们又踏上了新的航程。人生所有的相遇都是久别重逢，重逢只为了不期而遇或相约而至。前路漫漫，大家且行且珍重!
优秀本科毕业论文感谢信范文【二】
感谢国家自然科学基金课题基于粗糙集理论的地理信息服务演绎推理研究对本研究工作的资助，该基金课题由苗立志老师负责，研究期限为XX年1月-2XX年12月。本文研究工作是在苗立志老师耐心指导下完成的，苗立志老师总能给我提出建议，使我把握住方向，非常感谢苗立志老师在我本科四年学习生涯中，对我生活方面的帮助、学习能力方面的提高、科研工作方面的关心，并指导我沿着正确的研究方向一步一个脚印的前进。
感谢地理与生物信息学院的领导，给我提供了良好的学习环境，感谢陪伴我四年的本科同学：陈金群、徐亮、蒋志远、潘多，感谢他们四年来对我生活上、学习上的帮助，祝愿他们都能找到满意的工作，感谢我父母的支持，感谢父母无私的帮助，感谢在百忙之中评阅论文和参加答辩的各位专家和教授!
优秀本科毕业论文感谢信范文【三】
在这短暂的四年里，我首先要感谢我的导师齐雁冰老师，在我人生最关键的时期得遇恩师是我的幸运。无论是在学习和生活中，齐老师都给予了我莫大的关心和帮助，并以其严谨的教学态度和宽以待人的作风影响着我。每当我在学习上倦怠的时候，齐老师都会督促和鼓励我;在我遇到困难时，齐老师会悉心为我答疑解惑。我的论文是在齐老师的悉心指导下完成的，从论文的选题、实验设计、论文开题、发表期刊论文以及毕业论文的撰写，都倾注了大量精力和心血。值此论文完成之际，谨向齐老师致以我最崇高的敬意和由衷的感谢!
感谢常庆瑞老师，常老师以其严谨的治学态度、渊博的学识和对教育事业的热情感染着我，让我怀着无限的激情面对我的科研生活!
感谢师弟楚万林、师妹蒲洁在我生活和实验中给予的关心和支持!
感谢论文实验开展过程中，实验室各位老师在实验仪器和测试过程中给予我的方便和指导!
感谢刘梦云老师在我的导师出国学习的这一年里给我的帮助与支持!
回首四年的本科生涯，有那么多的老师和同学给予了我帮助，有太多太多的人需要感谢，感谢刘京老师、陈涛老师、高义民老师，感谢学院田宵鸿老师、杨岩荣老师、任晓萍老师、哈力娜老师、李景林老师等，在我学习和科研等各方面为我提供的帮助。
二十一世纪国家之间的竞争归根结底是人才的竞争，面对社会和科技发展对高素质人才的需要，全面提高大学生的综合素质，培养适应科技发展和经济建设需要的创新人才，成为当前我国高等学校教学改革的热点。二十一世纪同样也是生命科学的世纪，生物信息技术，人类干细胞技术，克隆技术，转基因技术必将使生物技术产业成为二十一世纪最重要的产业。作为生命科学最重要组成部分的医学科学，也将迎来跨越式发展的新时期。因此培养面向二十一世纪的高素质医学人才，迎接生命科学世纪的挑战，是所有医学教学工作者应该高度重视的问题，这就要求我们必须从我国国情出发，制定新世纪医学教育跨越式发展战略，加快推进我国的医学教育改革，全面实施医学生的素质教育。
1生命科学发展与医学科技进步
2中国医学本科教育的现状
改革开放以后，中国的大学医学教育已经取得长足的进步，医科大学毕业生投身入救死扶伤，全民保健，在构建和谐社会、实现社会主义现代化建设过程中作出了重要的贡献。然而随着经济、科技的发展，社会对医学的要求有了明显的提高，传统的生物医学模式向新的医学模式的转变，引起了疾病观、健康观、卫生观的根本转变。这就要求新时代的医学研究者以整体化、系统化、科学化、社会化的观点去研究和处理人类健康与疾病问题的思维方法和行为方式。而现有的医学本科教育方式已经不能适应社会对医学的要求，目前医学本科教育存在的问题集中体现在学生创新意识和创新能力严重不足。
同志指出，“创新是一个民族的灵魂，是一个国家兴旺发达的不竭动力”，“创新精神是我国民族几千年来生生不息、发展壮大的重要动力”，“创新的关键在人才”。因此培养学生的创新能力关系到我们民族的兴旺。
3改革传统教学方法，逐步培养医学生的创新能力
3．1让医学生尽早接触科研，培养对科学研究的兴趣
医学生是医学教育的主体，激发他们学习医学知识的兴趣，调动他们学习的积极性和主动性，并逐步树立牢固的专业思想，对于培养合格的医学人才是极其重要的。学生可以根据自己兴趣利用寒暑期或周末参加各教研室的科研活动，使教学与科研相结合，培养学生的科研兴趣和科学思维的能力。更广泛地组织和鼓励本科生参与各种学术交流。学生参与的各种学校活动包括本专业的、跨专业的、跨校的、全国性的乃至国际性的学术交流活动。平时，也要让本科生尽可能地参加一些教师的科研项目立项论证会、博士生和硕士生的开题报告会和论文答辩会，可以参加各学科最新研究的学习报告会，对原有的基础实验教学内容进行有效融合，减少验证性实验，增加综合性实验和设计性实验，提高学生的能力。打破以往只有研究生才能进入科研实验室的惯例，组织医学专业学生早期进入感兴趣的实验室学习并实行导师制。在具有副教授职称或高年资讲师中选出思想政治素质好、有高度责任心的教师作为学生导师，明确规定导师的工作职责，要求他们在思想上和学习上给予学生指导和帮助。这样，学生在导师的指导下积极参与实验室的
科研活动，感受科研气氛，培养了他们的科研兴趣；使他们将书本知识运用到实践中去，形成初步的科研思路；培养了科研实践能力和与他人协作的能力；利用各种途径主动学习的能力也有了一定的提高。
3．2充分利用现代信息技术，为创新人才培养提供先进的教学手段和方法
关键词：生物统计与实验设计教学手段网络教学科研素养
《生物统计与试验设计》是农学、生物科学等专业重要的学科专业基础课[1]，是关于科学试验的设计、实施、试验数据的收集、整理、分析，以及结果解释和推断的一门科学。本课程主要是运用数理统计原理和方法于农学和生物科学研究，使学生理解试验数据现象和本质的关系，树立农学和生物科学研究正确的思想和方法。该课程教学的目的是使学生初步具有独立处理和分析农学和生物学试验数据的能力，为进一步学习各专业课程以及毕业论文设计与实施奠定坚实的基础。扬州大学的《生物统计与试验设计》课程在2010年入选国家精品课程。目前，该课程的授课对象包括农学院、园艺与植物保护学院、生物科学与技术学院以及环境科学与工程学院多数专业的本科生以及部分研究生。近年来，在该课程的教学改革实践中，我们注重将科研和教学紧密结合起来，通过科研促进教学，着力提高大学生的科研素养。通过深化教学改革，注重学生能力的培养，有效提高了农科大学生的科研素养。利用科研丰富教学内容，使学生通过本课程学习，掌握了进行科学研究的深入研究模式。
1教学内容与教学体系改革
1.1改革教学内容，适应新时期人才培养需要
根据夯实基础、拓展外延以及课程内容现代化的要求，需进一步修订教学大纲。教学大纲不是《生物统计与试验设计》章节内容的简单堆砌，而是本门课程教学的指导性文件；不只是课堂讲授的大纲，还应是指导学生自学的纲要。《生物统计与试验设计》是一门工具，学习的目的是为了应用这一工具处理和分析试验数据，对教学大纲进行修订，在把握本学科前沿知识的同时，强调生物统计方法的应用，同时注意介绍本领域前沿信息与新的统计方法研究进展，以提高学生的学习兴趣。
1.3规范教学环节，提高教学效果
在课堂讲授、上机操作等教学过程中，注重革新教学方式，活跃教学氛围，充分发挥启发式教学的特色，从发现问题、解决问题入手引导学生，强化自觉学习的效果。教学过程中结合多媒体课件使用，但又不拘泥于多媒体课件，采用多种形式，激发学生的学习积极性，提高学习效果。另外，讲授过程别注重统计基础理论与统计分析方法与生产和科研实践相结合，使学生对统计方法的了解与掌握更加实在。努力探讨实践互动式教学，改变传授式教学中师生的距离感，采用计算机演示，上机等实践环节，加深对知识点的掌握，熟练常用统计分析方法的学习与应用。多年来，本教研室一直采用试题库出卷、试卷内容广泛、题目严谨、严格考试、统一阅卷，判分标准合理，使生物统计课程历来为各类学生所重视，使这一在农学院普遍认为较难学习的课程，被广大学生所接受、理解并掌握，并能在毕业论文、科研实践中加以应用。
1.4突出精品，狠抓教材建设
2教学方法与教学手段改革
3以科学研究促进教学
3.1注重教学内容和教学体系改革
以科研促教学是做好《生物统计与试验设计》教学工作的主要措施。在精品课程建设的几年中，课程组成员群策群力，充分发挥集体作战的优势，努力争取教育部和校级教改项目，先后承担教育部、省教育厅和学校等多项教学研究项目，并将我们的研究成果应用到教学之中，对教学具有很好的促进作用。研究成果不断充实到教学内容中去，收到了很好的效果。此外在教学过程中我们还经常听课，互相讨论，加深对统计分析理论的理解。并注重对探讨的内容进行总结，积极撰写教学论文，提高教学水平。
3.2承担其他科研项目，拓宽研究领域
在教学过程中，可以将教学与科研相结合，提高学生的学习积极性。例如，平均数的比较可用我们自己培育的新品种间产量的比较；绪论的教学可介绍自己在生物统计与田间试验课程方面的科研成果，即把自己提出的胚乳性状QTL定位方法、最大似然聚类方法、非线性拟合的缩张算法和多种具有国际影响的QTL定位新方法等介绍给同学，一方面建立自己在学生中的威信，另一方面又提高学生的积极性；在适当的时候将研究生处理数据资料的经典例子给同学讲述，使他们意识到要灵活使用统计方法，才能发挥其最大的效益；把承担的国家、省部级科研项目的内容从生物统计与田间试验侧面讲述给学生，潜意识地培养学生的科学研究能力。
4全新教学方式的使用
依托校园网，建立了生物统计网络教学系统。本教学系统包含课程简介、师资队伍建设、教学大纲、课程教案、常用统计软件的应用、习题集、统计软件开发、教研教改和参考资料等内容。同时为方便同学生的交流，我们专门设立了网络讨论区。生物统计网络教学系统的多样性、形象性、互动性及灵活性等特点，改变了以往生物统计教学的抽象与难懂，促进了学生的学习积极主动性。除了建立了《生物统计与试验设计》教学网站，为适应单机版用户，我们开发了单机版的DAS（数据分析系统），目前2.0版本已经通过测试，即将在互联网上。DAS系统包含学习系统和数据分析系统两个部分。其中学习系统面向生物统计的初学者，为其提供一个良好的学习工具；而数据分析系统采用全菜单操作方式，类似Excel的运行界面，完美的图形输出方式来进行数据分析，涵盖了课程中所涉及到的所有的统计分析方法。目前我们正在积极开发DAS系统的iPad版本和android版本。
5在大学生科研素质培养中的作用
教研室坚持边研究探索、边试点实践的方针，不断总结经验，全面规划，重点突破。自2003年以来，参加试点实践的有农学、农业信息技术、农村区域发展、生物技术、植物保护和应用化学等本科专业，学生人数1000人。具体效果主要体现在：①通过深化教学改革，注重学生能力的培养，有效提高了农科大学生的科研素养。利用科研丰富教学内容，使学生通过本课程学习，掌握了进行科学研究的深入研究模式：立题制定试验方案选择田间试验设计类型田间实施观察记载收获、取样、考种整理资料统计分析撰写课程论文发现问题再次立题，深化研究。提高学生的分析问题解决问题的能力，为学生今后从事科学研究奠定了良好的科研素养。近年来，本科生将本课程所学习的教学方法应用到科研实习中，在国内外期刊上发表学术论文的本科生明显提高，并已经有本科生将在SCI刊物。②为本科生考取研究生后进行科学研究奠定了方法论的基础。开展统计软件的学习，扩大学生的视野，提高学生的素质，为学生以后在科研工作中利用统计软件解决实际问题奠定了基础。近年来农学院考取研究生的同学将生物统计和试验设计知识应用于科学研究中，数据分析的能力大大增强。
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关键词：大数据情报分析竞争情报商务智能生物医学政府治理军事情报
IntelligenceAnalysisinDifferentDomainsandItsDevelopmentundertheEnvironmentofBigData
AbstractBigdatahascaughttheattentionoffivedomains：competitiveintelligence，businessmanagement，bioinformatics，governmentgovernanceandmilitaryintelligence.Inordertounderstandthedifferencesbetweendifferentdomainsofintelligenceanalysis，thisarticlereviewsthecurrentstatusoftheconceptionandpracticeonintelligenceanalysisacrossfivedomains，revealsthecharacteristicsofintelligenceanalysis，andthenillustratesthedevelopmentofintelligenceanalysisacrossfivedomainsunderthebigdataenvironment，andpointsouttheeffectsofbigdataforintelligenceanalysis.
Keywordsbigdata;intelligenceanalysis;competitiveintelligence;businessintelligence;bioinformatics;governmentgovernance;militaryintelligence
1前言
2不同领域的情报分析及其在大数据环境下的发展
信息与情报是不同概念，情报是对信息进行深度加工或从各种文本中挖掘的知识，可以是一种产品、活动、组织，或是一组知识的专门表达形式[1-2];生成情报所采取的分析方法与执行过程称为情报分析研究。对于竞争情报、商业管理、生物医学、政府治理及军事情报等学科领域而言，它们的产生与发展与情报分析研究在具体问题域中的应用有着直接、密切的关系，尽管这五个领域对情报分析的概念理解及实践特点不尽相同，但情报分析都是这些领域知识的核心内容，也是支持该领域研究的关键，而且，在大数据环境下，大数据理念与方法正在对这五个领域产生着深刻的影响。这是本文选取竞争情报、商业管理、生物医学、政府治理及军事情报等领域作为研究对象的重要原因。
2.1竞争情报领域
“竞争情报”（CompetitiveIntelligence，CI）是企业用来提高竞争优势的情报分析工作，它通过感知外部环境变化、竞争对手的技术跟踪等手段，建立一个关于竞争对手或外部环境的预警系统，并支持决策服务，使企业在激烈的竞争中维持优势地位[3-5]。由此可见，CI是对外部竞争环境进行全面监控的过程，是一种“知己知彼”的交互分析过程。与其他领域的情报分析相比，通过CI分析所得到的情报更具有目的性、针对性及对抗性等特征，同时对自身跟对手的差距、潜在的机会等问题给出了解答。
2.2商业管理领域
2.3生物医学领域
2.4政府治理领域
GDM的分析对象是政府开放的公共数据，如，美国政府以数据共享及再利用为目标，建立了开放美国政府数据的Data.gov网站，对用户提供多种数据集和输出接口，以方便政府数据再利用及增值开发，并结合Data.gov与云计算，构建了面向美国所有政府部门的Apps.gov云服务门户[33]。以美国Data.gov网站开放的数据类型为例，截至2014年7月5日，网站上共开放了110，875个数据集，涉及了企业、地球观测、教育、地理空间等21类。从分析方法来看，数据挖掘是GDM的关键技术，常见如统计分析、分类、聚类、关联规则、决策树、神经网络等。刘典文[34]梳理了数据挖掘在公共管理领域的各种应用，如通过孤立点分析找出诈欺行为的特征、通过聚类分析找出城市交通系统规划及站点分布等，而电子政务、政府绩效管理、公共危机管理等也是广泛运用数据挖掘来找出更多有价值的情报。通过GDM分析得到的情报，可通过每月统计报表、问题解决方案、特定事件监测汇报等型式呈现结果，向决策者或管理者提供政府信息资源增值、信息孤岛与社会服务问题解决、城市管理与监控等方面的治理支持。
2.5军事情报领域
3结语
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