男性生殖器检查阴囊内睾丸的大小和质地很重要。附睾有无硬结常代表附睾有没有发生过炎症或结核，圆形的肿块很可能是精液囊肿可妨碍附睾管的畅通。附睾饱满而精液中没有精子可能是阻塞性无精子症。
阴茎检查
根据外伤史及局部表现常可作出正确诊断，通常无需特殊检查。海绵体造影可体现海绵体损伤的部位及程度。
阴囊检查
15至35岁之间男性，至少每2至3年进行一次睾丸检查，医生有时不会自动进行这项检查，如果检查时没有这一项或本文列出的其它项目，可自行要求。
泌尿系统检查
男性泌尿系统易患炎症，早期诊断、治疗对愈后影响大，应定期检查。
前列腺检查
通过肛门指检，可在直肠前壁摸到前列腺，根据大小、质地、有无压痛可以初步判断前列腺有无问题，必要时作前列腺按摩取液以进行化验检查。精囊正常时常触摸不到，但在有炎症增大时有时可以在前列腺上部摸到有压痛的精囊。
二、男性检查需要注意的事项
不合宜人群：不同检查不合宜的人群不同，详细请浏览男科检查的各项检查。
检查前禁忌：（1）提前一周向医生咨询最近服用的一些药物，特别是增强性功能的药物是否需要停服。（2）检查前一天晚上洗澡、换洁净的内衣，这样能给医生一个良好的印象。（3）男性精液检查：①留精液前，病人应停止性交4-7天。检查前1周不能用丙酸睾丸酮、苯乙酸睾丸酮、苯丙酸诺龙。检查前1个月内应停止饮酒，这点必须做到。②采取精液时，可用软皂或石蜡油做阴茎按摩，将标本收集在无菌的试管中;也可用避孕套(冲洗干净，不含杀精子药物)或采用性交中断法收集精液，但这样收集的量往往不多。③如用上述方法采不到精液，可经直肠内按摩精囊及输精管末端、压迫采尿，检查沉渣中有无精子。④不要将精液暴露在过热和过冷的环境中。及时交给医生备查，不得超过30分钟。冷天要注意保暖，送检时可放在内衣口袋里保温。⑤如果要进行细菌培养，应先冲洗、消毒尿道口，再将精液收集在无菌试管中。
检查时要求：（1）检查过程中不必紧张和感到害羞。（2）检查时不要憋尿和大便。例如在检查前列腺时，医生要用肛诊法检查前列腺大小、硬度和有无压痛感，憋尿和大便对此都有影响。（3）用医用小瓶采集完精液后，应该迅速交到医生手里，最长不能超过2个小时。天气变冷时，还要注意给瓶子保温。建议密封好瓶盖，把它放在皮包或口袋里。（4）检查过程中感到疼时一定要告诉医生，否则不利于医生掌握真实情况。
三、男性精液检查的认知误区
男性精液检查的误区一：男方身体很健康，精液检查不用做。
受传统的封建思想影响，觉得生不出孩子是女方的事，丈夫总怪妻子“一块咸碱地，种啥都不长！”所以，有许多不孕不育夫妇治疗多年，但一直是女方在医院奔波，男方不愿做最基本的检查。
男性精液检查的误区二：如精液检查结果正常，那就是女方的问题。
在日常门诊治疗中，有许多丈夫是带着忐忑不安的心情等待着精液检查的结果的，一旦被告知此次化验结果指标在正常范围内时，会长长松口气告诉自己的妻子：“我是好的，那是你的问题！”这种非此即彼的判断其实又是一个错误的观念，因为精液检查结果正常≠可以生育。
另外，在所有的不育夫妇中约有10%属于原因不明性不育，夫妇双方目前可以做的所有检查可以是正常的，但就是不能怀孕。有的夫妇由于不能生育而离婚，当他（她）再次结婚时，又很容易怀孕了。所以，如精液检查结果正常，在女方进行进一步的检查后，如果基本正常，那男方还要进行进一步的检查。
男性精液检查的误区三：精液常规检查一次就可以了。
在男科门诊中经常发现，有些患者在拿到第一次的精液常规检查报告后，就急于要知道自己的情况好不好，可不可以使女方怀孕。其实这时下结论为时过早了。
四、需要进行男性病检查的人群
需要进行男性病检查的人群
一、睡觉时频繁起夜。
开着会却频受尿意骚扰，晚上睡觉怎么也得起夜两次……久坐不动，让男性的前列腺变得特别“娇嫩”，血液循环较差，日子久了它就会“反抗”，出现尿频、尿急的情况。
二、喝完酒小便变细了。
生意总在酒桌上谈，天天不醉不归，一个星期下来，男性就会发现，自己小便时常有隐痛，尿线变细。其实，酩酊大醉后，前列腺也会跟着充血、肿胀，再加上熬夜焦虑，前列腺免疫力下降，病菌就会乘虚而入，导致细菌性前列腺炎。
三性欲亢进。
50岁以后性能力不退反进，性欲求增多，妻子连喊受不了。这时候，危机也悄悄袭来，因为前列腺到了这个年龄本该自然衰退，如果性功能亢进，则可能是雄性激素代谢紊乱，需要及时做检查加以控制。
第一，实验室检查：血、尿常规、空腹血糖，高低密度脂蛋白及肝肾功能检查，对发现糖尿病、血脂代谢和慢性肝、肾疾病等引起的勃起性功能障碍，有诊断意义。第二，性激素水平测定：男性雄性激素睾酮的高低对勃起功能及性欲的强弱有一定的影响，内分泌的失调可影响性激素水平，检测激素水平有助于内分泌性性功能障碍的诊断。第三，心血管系统的检查：如心功能测定、心电图等。以了解心肌耗氧量，心输出量，有效循环血量、血液粘稠度，血管弹性系数，及总周阻力，帮助诊断血管性阳痿。
3.尿道分泌物检查(淋球菌涂片、支原体、衣原体)4.血PSA检查(t/fPSA)5.精液常规检查6.精子功能检查7.精浆的生化检查8.精子的免疫学检查9.男性生殖内分泌检查(血睾丸酮T、卵泡刺激素FSH、黄体生成素LH、催乳素PRL、雌激素E2)10.男生殖系活组织检查(无精子症)11.血抑制素B(待开展项目，对睾丸生精功能评价)二、海绵体血管活性物质注射三、阴茎海绵体造影术四、阴茎夜间勃起试验检查五、男性生殖系X线检查1.X线平片2.尿道造影检查六、男科超声检查1.前列腺的超声检查2.精囊腺病变3.阴囊内容物七、尿流率测定八、男科计算器体层扫描(CT)1.前列腺2.精囊腺3.睾丸发育异常4.睾丸肿瘤5.睾丸鞘膜积液