外科为门诊综合外科设置,可进行普通外科、骨科、胸外、泌尿外科、脑外科等常见疾病的诊治，可进行皮肤裂伤缝合、关节扭伤、肌肉拉伤等急症处理，可辅助进行B超、X光片及各种血液生化检查。出诊医师均为主治医师以上职称。我部设有门诊手术室，可进行各种门诊手术。重点发展骨科慢性退行性疾病的综合处理，对颈椎病，腰间盘突出，骨关节病，骨质疏松，慢性颈肩腰腿痛等疾病的保守治疗强调综合管理的理念，注重健康教育和患者参与。外科门诊手术项目:脂肪瘤、粉瘤、纤维瘤、皮赘、表皮样囊肿、色素痣等体表肿物，乳腺纤维瘤、乳腺增生活检、头皮肿物、皮下异物取出等。
口腔科专业
北医三院第二门诊部口腔科是集口腔健康保健，口腔常见疾病治疗，口腔健康修复治疗的特色专科。主要开展牙体牙髓病、牙周病、牙槽外科、牙列缺损修复等治疗业务。科室拥有4台德国进口牙科综合治疗椅，配备进口高温高压预真空消毒机、数字化牙片机，CT、快速灭菌器、封口机、光固化机、根管长度测量仪、超声波洁牙机等专业口腔医疗设备。科室专业人员技术熟练，院感防控严格规范。目前开展业务如下：
口腔内科：主要诊治牙体、牙髓、牙周以及口腔粘膜病，如龋齿光敏树脂填充、牙周炎治疗，食物嵌塞的治疗和口腔溃疡的治疗、牙髓炎及根尖周疾病的根管治疗、牙周炎的牙周基础治疗、年轻恒牙的护髓治疗和根尖诱导形成治疗、常规口腔健康检查、咨询。
口腔外科：主要诊治各种牙拔除术，包括儿童滞留乳牙、多生牙、成人阻生牙、死髓牙、正畸牙，残根残冠的拔除。
口腔修复:部分或全部牙齿缺失修复、部分活动假牙、全口活动假牙、固定假牙、整铸支架义牙修复、烤瓷修复、全瓷修复，隐形义齿的修复。
儿科专业
承担二门诊儿科门诊医疗任务。出诊3名医师均为主治医师职称，拥有丰富的临床经验。对儿童各种常见疾病进行专业诊疗和预防指导。诊疗范围：小儿呼吸系统、消化系统、心血管系统、神经系统、血液系统、泌尿系统、小儿营养性疾病、儿童保健及生长发育，以及小儿传染病，如猩红热、麻疹、水痘、风疹、流行性腮腺炎和手足口病等。
妇产科专业
1.在治疗妇科炎症方面，能够诊治外阴炎、阴道炎、宫颈炎、前庭大腺炎、附件炎、急性盆腔炎、慢性盆腔炎等常见妇科炎症；
2.在治疗内分泌疾病方面，治疗内容包含月经失调、多囊卵巢综合征、异常子宫出血、更年期综合征、早发性卵巢功能不全等；
3.在诊治妇科肿瘤方面，针对子宫肌瘤、子宫腺肌症、巧克力囊肿、卵巢囊肿、宫颈病变等疾病的诊断、监控及治疗；
4.在不孕不育、多次不良孕产史、优生优育等方面，能够进行诊断识别、并给出合理化的诊疗方案；
5.在手术方面，妇科门诊可以实施宫颈息肉、前庭大腺囊、外阴肿物的切除手术；人流术、药流术以及取环术、上环术、诊断性刮宫等手术；尤其在高危、疑难取环方面积累了丰富的临床操作经验；
常规检验项目：
1.真菌镜检+培养鉴定
2.螨虫、疥虫、毛囊虫检查
3.皮肤组织病理检查
4.过敏源检测可针对各种过敏性疾病如急慢性湿疹、急慢性荨麻疹、过敏性鼻炎、过敏性哮喘等的过敏性原因的筛查。
耳鼻喉科专业
耳鼻喉科由1名经验丰富的高年资主治医师出诊，能够进行耳鼻喉科常见病及多发病的诊断及治疗，竭诚为广大患者提供优质、科学、专业的医疗服务。
耳鼻喉科诊疗疾病：
咽喉常见病：急慢性咽及扁桃体炎、口咽及喉咽异物、急慢性喉炎、声带小结及声带息肉等。
眼科专业
眼科常见疾病诊治：
1.眼睑疾病：眼睑水肿，眼部带状疱疹，睑皮炎及湿疹，睑缘炎，麦粒肿，霰粒肿，睑腺炎，倒睫，眼睑肿瘤；
2.泪器疾病：泪囊炎，泪腺炎；
3.结膜病：感染性结膜炎、过敏性结膜炎，结膜话结石，结膜肿物，干眼症；
4.角膜病：感染性角膜炎，角膜变性，角膜先天异常；
5.巩膜病：巩膜炎；
6．晶体病：白内障，晶状体异位；
7．玻璃体病：飞蚊症，玻璃体出血，玻璃体混浊；
8．青光眼：原发性青光眼，继发性青光眼，先天性青光眼；
9．色素膜病：虹膜睫状体炎，脉络膜肿瘤；
10．眼底疾病：视网膜血管阻塞，视网膜炎性疾病，视网膜脱离；
11．儿童眼科疾病：近视远视，散光，斜视与弱视；
中医针灸专业
中医科为我部特色科室之一。拥有专业技术人员近十名，其中副高以上医师1名，经验丰富的高年资主治医师4人。中医科人才齐备，技术力量雄厚，在社区常见的多种病症中均具有丰富的中医临床诊疗经验。主治病种有：
1．心脑血管疾病，如眩晕、头痛、脑血管病、冠心病、高血压；
2．肝胆脾胃系统疾病，如胃脘痛、反酸、大便不调、腹胀、脂肪肝、胆结石、胆囊炎等；
3．神经系统疾病，如失眠、面神经炎、神经性耳鸣等；
4．呼吸系统疾病，如慢性支气管炎、支气管哮喘、反复咳嗽等；
5．泌尿系统疾病，如反复泌尿系感染、慢性肾病等；
7．妇科常见病，如慢性盆腔炎、阴道炎、带下病、月经不调、痛经等；
10.儿科常见病症，如小儿反复感冒咳嗽、消化不良、胃肠功能不调、夜眠不安、盗汗、遗尿、腺样体肥大、生长发育缓慢等；
预防保健专业
医技科室（心电图，检验科、B超室和脑血流图）
检验科
检验科设有临床检验、生物化学和免疫学3个专业组，现有专业技术人员6人，中级职称3，初级师3人。全科拥有迈瑞全自动血球分析仪、贝克曼全自动生化分析仪和罗氏全自动免疫分析仪等各类先进设备。数据联网，检验结果实时向临床传送，为患者、临床提供及时、准确的检验服务。
科室现已开展检验项目主要有：肝功能、肾功能、电解质、心肌酶、血脂、血糖等41项生化检查；肿瘤标志物检查、甲功五项、血常规、尿常规和尿流式细胞检查、便常规、潜血、轮状病毒、幽门螺旋杆菌、c-反应蛋白、尿微量白蛋白、血沉、心肌钙蛋白T，糖化血红蛋白等常规检查项目。常规项目40分钟出结果，生化、免疫项目当日下午四点出结果。
心电图室简介
心电图室由1名高年资主治医师负责，目前有工作人员两名。主要进行电脑多导联心电图检查、24小时动态心电图监测、24小时动态血压监测，此外还参与二门诊急性冠脉综合征、各种复杂心律失常的诊断和救治工作。
B超室简介
超声室目前拥有飞利浦，GE，日立高端品牌的高档彩色超声诊断设备，由高年资经验丰富的副主任医师和主治医师检查诊断，开设的检查项目：
腹部彩超：肝胆胰脾肾输尿管膀胱前列腺等；
浅表彩超：甲状腺、乳腺、体表肿物、淋巴结等；
血管彩超：颈动脉、上下肢血管等；
妇科彩超：子宫附件、早孕；
超声心动图：心脏的超声检查。
脑血流图室
脑血流图检查：观察颅内部分血管的血流速度，反应脑血管的血流供应状况、弹性、紧张度、外周阻力等，主要用于协助血管神经性头痛、脑动脉硬化、高血压病、颈椎病、偏头痛、眩晕的鉴别诊断。
骨密度检查：用来协助检测中老年人骨质疏松情况；儿童超声骨密度检查，检测儿童是否缺钙，从而通过调整饮食及时帮助儿童补钙，保证儿童骨骼发育正常,此为超声波检测，对儿童没有辐射伤害。