除此之外，在北京地区，【北京协和医院】、【301医院】、【北京大学第一医院】、【北京大学人民医院】、【北医三院】、【同仁医院】等等多家三甲综合医院均具有强大的心内科团队，水平国内领先。
心外科
心外科主要涉及心脏及大血管疾病的手术治疗，以及心脏移植的开展。
在北京以及全国范围，最享盛誉的仍为【北京安贞医院】与【阜外医院】。尤其是手术风险难度极大的主动脉外科，【北京安贞医院】孙立忠主任、黄连军主任团队在国内、乃至国际水平领先。同样需要特别注明的是，除了成人，对于婴幼儿复杂先天性心脏病的外科手术治疗，【北京安贞医院】小儿心脏外科同样享有盛誉，在主任刘迎龙教授的领导下，综合实力强大。
呼吸内科
变态反应科
胸外科
内分泌科
消化内科
消化内科所属疾病可累及多个脏器，包括胃肠、肝胆、胰腺等。特别强调，此处的推荐未将消化系统肿瘤的内科诊治纳入，其包含于肿瘤专科范畴。
【北京协和医院】、【301医院】、【北京友谊医院】及【北医三院】的消化内科在全国范围内均属权威，享有盛誉。
普通外科
风湿科
风湿科疾病，包括了很多像系统性红斑狼疮这样的少见疑难疾病，同时也包括像类风湿关节炎、痛风性关节炎这样的常见疾病。何时去看风湿科？往往不好一概而论。简单来讲，关节疾病、系统性疾病、发热原因待查等情况，往往可以从风湿科入手。
我国风湿科的奠基者张乃峥教授在【北京协和医院】首创风湿学科，至今，该科综合实力仍在全国范围内首屈一指，一号难求。
除此之外，【北京大学人民医院】、【301医院】等三甲综合医院的风湿科也实力强大。
骨科
除此之外，【301医院】、【北医三院】、【北京协和医院】、【北京大学人民医院】等三甲综合医院的骨科也颇具特色。
其中，【北医三院】具有特色学科“运动医学”，在运动创伤、营养、康复等方面颇有建树。
【北京协和医院】骨科对于“脊柱侧弯”这一畸形疾病的诊治，在首席专家邱贵兴院士的指导下，水平国内领先。
肾内科
泌尿外科
泌尿外科所诊治疾病包括泌尿系统的肾脏、输尿管、膀胱、尿道以及解剖紧邻泌尿系统的肾上腺及前列腺。
全国范围内，【北京大学第一医院】的泌尿外科综合实力首屈一指。另外，【301医院】、【北京协和医院】等三甲综合医院的泌尿外科亦综合实力强大。其中，【北京协和医院】泌尿外科依托于协和内分泌科的强大专科优势，在肾上腺疾病诊治上颇具独到之处，国内领先。
另外，在北京范围内，肾脏移植方面，【309医院】、【北京友谊医院】、【武警总医院】等医院的泌尿外科优势突出，经验丰富。
【宣武医院】与【北京天坛医院】在全国的神经专科均属权威，水平国内领先。另外，【北京协和医院】在罕见疑难神经系统疾病的诊治上也颇有特色。
神经外科
神经外科不等于脑外科，还包括脊髓外科以及周围神经系统的外科诊治。
【北京天坛医院】、【宣武医院】与【北京三博脑科医院】均云集神经外科大家，综合实力强大。另外，【北京协和医院】神经外科依托于协和内分泌科的强大专科优势，在垂体微创外科方面颇有特色，国内领先。
血液内科
妇产科
精神科
口腔科
提到口腔科，最富盛名即为“北北医，南华西”。【北京大学口腔医院】是全国口腔医学最为权威的诊治中心。另外，紧邻天坛医院的【北京口腔医院】（首都医科大学附属）也是口腔医学综合实力非常强大的专科医院。
疼痛科
皮肤科
儿科
眼科
耳鼻咽喉头颈外科
一提到耳鼻喉科，众所周知，最富盛名的即为【北京同仁医院】，专科综合实力强大，全国首屈一指。除此之外，【北京协和医院】、【301医院】、【北京大学第一医院】及【海军总医院】等三甲综合医院的耳鼻喉科也均实力强大。
整形外科
肿瘤科
肿瘤的综合治疗，除了外科手术，还包括内科化疗、放疗等多种手段，统称为肿瘤科。
【医科院肿瘤医院】、【北京大学肿瘤医院】与【天津医科大学附属肿瘤医院】（位于天津市、紧邻北京）在国内首屈一指，为肿瘤综合诊治的权威。
放射科
提到放射科，容易与放疗科造成混淆。放射科主要以影像学诊断为主，也包括在影像学引导下的部分介入治疗；而放疗科则是应用放射线对于肿瘤等疾病进行治疗的专科。放射科承担着对本院患者行影像学检查以及外院影像学检查结果进行会诊的任务。
病理科
对于专科优势强大的病理科来说，除了为本院外科手术或者消化内镜等操作取得标本进行病理诊断外，还担负着为外院取得并借出的病理标本进行会诊的任务。
整体来讲，北京各大三甲医院的病理科实力均相当强大，尤其是【北京协和医院】、【301医院】与【北医三院】的病理科，实力了得。值得一提的是，北京协和医院病理科的首席专家刘彤华院士，在疑难病理诊断方面被誉为“金标准”，是国内首屈一指的病理专家。
北京范围内，【北京博爱医院】、【北京康复医院】在康复专科实力强大。另外，【北医三院】、【北京大学第一医院】等三甲综合医院的康复专科亦颇具特色。