上海市肺科医院呼吸科于1995年由著名呼吸病学专家何国钧教授倡议建立独立的呼吸科，独立于原有的肺内科；2018年更名为呼吸与危重症医学科。目前是国家临床重点专科、国家呼吸与危重症规范化建设三级医院示范单位、上海市重中之重临床重点学科、上海市临床重点专科。2018年度中国医院科技量值（呼吸病学）排行榜全国第四，2019年度跻身复旦排行榜提名。
呼吸与危重症医学科设有3个病区、呼吸ICU病房以及呼吸病实验室。目前开放床位数156张，其中呼吸监护室床位数28张。全年提供门急诊服务15万余人次。是全国支气管扩张症诊治与研究联盟联合盟主单位、长三角呼吸专科联盟盟主单位、中国罕见病联盟、国家危重症协作组成员单位，科室设置了疑难肺部疾病临床研究中心，慢性气道疾病诊治中心、哮喘靶向诊疗中心3个诊疗中心及支扩、结节病、肺真菌病、睡眠呼吸障碍疾病、哮喘、脱敏等专病门诊。
科室承担国家级项目包括国自然杰出青年项目、重大研究计划、重点项目等二十余项，执笔和参与制定临床诊治指南和专家共识十余项。获得国家杰出青年、上海市领军人才、上海市优秀学科带头人、浦江人才、曙光学者、上海市青年科技启明星、市卫生系统优青、“银蛇奖”等人才项目和奖项。
现任科主任和学科带头人徐金富教授为国家杰青、上海市领军人才。全科共有医师38人，其中正高6人，副高11人。护理：护士总数63名，主管护师8名；副主任护师1名；硕士1名，本科36名。科室拥有丰富的专家资源，包括中华医学会呼吸病学分会常务委员和委员，中华医学会呼吸病学分会青委副主委，中华医学会呼吸病学分会间质病学组副组长、中国医师协会呼吸分会青委副主委，中国医师协会呼吸医师分会间质性肺疾病工作委员会副主任委员、上海市医学会呼吸病学分会副主委，上海市医学会呼吸病学分会间质病学组组长、上海市医学会慢病管理分会副主委，上海市医卫青联副主席，上海市医师协会呼吸专科分会委员。RespiratoryResearch副主编；ClinicalRespiratoryJournal副主编；ClinicalMicrobiologyandInfection编委；Thorax中文版副主编,中华结核和呼吸杂志等中文杂志编委或通讯编委。
科室长期承担同济大学呼吸病学教学工作，肺科临床医学院内科教研室工作，从事呼吸系统疾病临床、科研和教学任务。呼吸与危重症医学科培养了大量的全国各地呼吸病学进修生、同济大学博士和硕士研究生，其中很多获得出国进一步深造机会。呼吸与危重症医学科每年举办叶园呼吸高峰论坛、全国呼吸道感染诊治进展学习班和疑难肺部疾病进展学习班，深受全国同道欢迎。
科室连续多年获得先进集体、青年文明号、巾帼文明岗、杨浦区青年突击队、杨浦区青年安全生产示范岗等荣誉称号。科室积极响应国家医疗扶贫号召，每年选派优秀医生参加援藏、援滇医疗对口支援。积极参与对口支援浙江奉化人民医院、南通六院、郑州市人民医院工作。
展望未来，在学科带头人的带领下，肺科医院呼吸与危重症医学科将团结奋进，不忘初心，砥砺前行，全力打造国际有声音、国内有地位、亚洲一流的呼吸病学专科。