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第一名：上海长海医院
医院本部位于杨浦区长海路，虹口院区位于虹口区东江湾路，下辖62个临床科室，展开床位2700余张。拥有牵头建设国家重点学科6个、参与建设国家重点学科9个，国家临床医学研究中心1个、国家临床重点专科14个、全军专科中心(所)16个，中国工程院院士3名。在烧创伤救治、消化系统疾病诊治、泌尿系统疾病诊治、心脑血管及大血管内外科诊治、全器官及造血移植和中西医结合治疗肿瘤等方面，具有水平和雄厚临床综合实力。“十三五”以来获国家科技进步奖二等奖4项，军队及省部级一等奖7项，是国家首批住院医师规范化培训示范基地、中国研究型医院示范医院、示范高级卒中中心。自2014年纳入上海申康绩效考核体系，优势病种综合绩效一直位居上海市各大单体医院。2020年上半年在《NewEngland》《JAMA》《Nature》发表论著各1篇，充分彰显医院科技创新活力。
第二名：上海交通大学医学院附属仁济医院
截至2020年底，医院共设有53个临床医技科室，总核定床位2750张;共有正式职工4390人，其中正、副高级职称专家587名，博导136名、硕导166名。仁济医院在2019年度医院综合实力排名榜(复旦版)中位列全国第十五名，在全国医院专科声誉排名中，医院消化内科排第二，风湿免疫科排第三，变态反应科排全国第四、麻醉科排全国第六，泌尿外科排第七，核医学科、生殖医学科排全国第十，肾内科、神经外科、妇产科、放射科、普通外科、检验医学、健康管理等学科均获提名，处于国内地位，部分领域达国际水平。
第三名：复旦大学附属肿瘤医院
复旦大学附属肿瘤医院是国家卫生健康委员会预算管理单位，是复旦大学的直属附属医院，建院于1931年3月1日，是我国成立早的，集医、教、研、防为一体的三级甲等肿瘤专科医院。医院设有徐汇院区、浦东院区两个院区，并与上海市质子重离子医院(复旦大学附属肿瘤医院质子重离子中心)高度融合、共同发展。截至2021年底，医院实际开放床位2084张，设有大外科、乳腺外科、胸外科、头颈外科、胃外科、肝脏外科、胰腺外科、大肠外1科、大肠外2科、大肠综合治疗科、泌尿外科、肿瘤妇科、神经外科、骨软组织外科、麻醉科、大内科、头颈及神经内分泌肿瘤内科、乳腺及泌尿肿瘤内科、胸部肿瘤内科、消化肿瘤内科、淋巴瘤科、放射治疗中心、中西医结合科、综合治疗科、介入治疗科、I期临床试验病房、病理科、放射诊断科、核医学科、超声诊断科、内镜科、检验科、药剂科、心肺功能科、营养科、心理医学科36个临床医技科室。医院有教职员工2,882人，其中医师759人，护理人员1,282人，医技人员531人，科研专职人员97人，职能人员213名;其中正副高级专家407人;博士生导师89人，硕士生导师99人。
第四名：复旦大学附属华山医院
华山北院坐落于宝山顾村地区，占地98490m2，核定床位600张，编制职工800名。设有内、外、妇、儿、中等临床与医技科室共38个。医院全新配置了MRI、CT、DSA等的医疗设备，在医疗质量、学科发展、教学科研、人才队伍建设方面传承母院特色，华山的神经外科、神经内科、皮肤科、感染科等国家教育部重点学科和卫生部临床重点专科均在北院开设，且学科骨干、管理团队均由母院派遣。此外，还引进了资深妇产科团队、加入“复旦儿科医联体”，完善了学科设置与布局。
第五名：复旦大学附属中山医院
医院科室齐全、综合实力雄厚。心脏、肝脏、肾脏和肺部疾病诊治是医院的重点和特色，诊治水平始终处于国内地位。医院有1个国家临床医学研究中心：放射与治疗(介入治疗)中心。1项国家疑难病症诊治能力提升工程(心脑血管方向)。1个国家公共卫生和重大疫情防控救治体系建设项目。1个国家重点学科(呼吸)发展项目。18个国家临床重点专科建设项目：消化科、检验科、麻醉科、心血管内科、内分泌科、胸外科、心脏大血管外科、临床护理、中医脑病科、呼吸内科、肾病科、普通外科、重症医学科、肿瘤科、医学影像科、器官移植科、急诊医学科和神经内科。4个国家重大疾病多学科合作诊疗能力建设项目：消化道肿瘤、心脏瓣膜病、重症肺炎和早期认知障碍疾病。