按照《医院分级管理标准》，医院经过评审确定为三级，每级再划分为甲、乙、丙三等，其中三级医院增设特等，因此医院共分三级十等。而二甲属于二级甲等医院，三甲属于三级甲等医院；
三甲医院当中的高职称级别的医生较多，且科室划分较细，对于危重症疾病具有一定诊疗水平。而二甲医院承担地区常见病、多发病的诊治，对于重症以及疑难病例，需要转诊至三甲医院；
三甲医院承担着教学、医疗、科研等任务，但二甲医院主要承担医疗任务；
医院病床的数量决定医院的规模和收治病人的能力，但不能代表医院业务水平的高低。根据医院分级管理标准，医院病床编设的原则为二级医院病床数不少于100张，三级医院病床数不少于500张；
科学研究是医院的另一个基本任务。医院是医疗实践的场所，许多临床上的问题是科学研究的课题，由于三甲医院的就诊人数较多，且疑难杂症较多，故需要承担的科研立项，承担医学院校学生的见习、实习，以及二甲医院的进修学习。但二甲医院承担着基层医疗工作者进修、学习。
三甲与二甲医院虽然有诸多不同，但是日常对于常见病如感冒、发热、关节炎等，建议前往二甲医院就诊，且部分二甲医院具有专科特色。但是对于大型颅脑外伤、休克等，建议前往三甲医院就诊。
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