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第一名：上海长海医院
医院本部位于杨浦区长海路，虹口院区位于虹口区东江湾路，下辖62个临床科室，展开床位2700余张。拥有牵头建设国家重点学科6个、参与建设国家重点学科9个，国家临床医学研究中心1个、国家临床重点专科14个、全军专科中心(所)16个，中国工程院院士3名。在烧创伤救治、消化系统疾病诊治、泌尿系统疾病诊治、心脑血管及大血管内外科诊治、全器官及造血移植和中西医结合治疗肿瘤等方面，具有水平和雄厚临床综合实力。“十三五”以来获国家科技进步奖二等奖4项，军队及省部级一等奖7项，是国家首批住院医师规范化培训示范基地、中国研究型医院示范医院、示范高级卒中中心。自2014年纳入上海申康绩效考核体系，优势病种综合绩效一直位居上海市各大单体医院。2020年上半年在《NewEngland》《JAMA》《Nature》发表论著各1篇，充分彰显医院科技创新活力。
第二名：上海交通大学医学院附属仁济医院
医院拥有国家重点(培育)学科12个，国家临床重点专科军队建设项目12个，军队“双”重点学科1个，军队医学专科中心14个，其中7个全军研究所、7个全军专科(专病)中心。2020年复旦大学医院排行榜综合排名全国第25，较上一年度上升3名，其中烧伤科位列全国第1,病理科位列全国第4，检验科位列全国第4,整形外科位列全国第8，康复医学科位列全国第9，普通外科等12个学科上榜提名。拥有中国科学院院士1名，三级以上教授64名(在职8名)，“南丁格尔”奖章获得者2名，享受国务院政府特殊津贴专家22名，国家杰青、长江学者、青年千人、万人计划、国家优青等特殊人才20名，博士生与硕士生导师共207名。
第三名：复旦大学附属肿瘤医院
2021年医院门诊量173.4万人次，住院13.5万人次，手术7.2万人次，出院者平均住院日5.03天。医院在新的“中国佳医院综合排行榜”中位列第26位，连续三年蝉联全国专科医院之首，病理科连续第11年蝉联。在新的国家三级医院绩效考核中，考核成绩为A，位列肿瘤专科医院全国第二名。在申康中心2021年1-9月申康绩效简报中，医院各肿瘤类病种绩效稳中有进，甲状腺癌、食道癌、胃癌、结直肠癌、胰腺癌、前列腺癌、乳腺癌、卵巢癌8大病种名列第一，行业认可度和社会影响力与日俱增，医院综合实力稳步向前。医院始终以病人为中心，坚持公益性办医，不断践行“人民至上、生命至上”的理念。2021年，医院一手抓疫情防控，一手抓日常诊疗，做到两手抓、两手硬、两手赢。全面实施主诊医师院-科-组三级管理，继续推行多学科综合治疗，已成立15支MDT团队，不断探索肿瘤诊治技术前沿。大力推进医疗数字化转型，建设老年友善医院，不断改善患者就医体验。
第四名：复旦大学附属华山医院
华山医院浦东院区占地近50亩，环境优美，设施完善，除了拥有Cyberknife等国际的医疗设备外，DSA、MRI、CT、彩色多普勒等医疗设施也一应俱全。拥有住院床位200余张，监护室床位40张，诊疗科目设有皮肤科、神经外科、神经内科、射波刀治疗中心、普内科、内分泌科、消化科、运动医学科、感染科、心内科、呼吸科、中西医结合科、整形外科、静脉导管护理、妇科、普外科、疼痛科、重症医学科、麻醉科等学科，并开设健康管理中心和名医工作室及国际部等;2010年8月始与和睦家合作开设的国际门诊有：全科、儿科、妇科、内科、耳鼻喉科、泌尿外科、内分泌科、皮肤科、消化科、心理科。
第五名：复旦大学附属儿科医院
医院是教育部儿科教学指导委员会主任委员单位，拥有重点学科、精品课程和优秀教学团队。复旦大学上海医学院儿科学系设在儿科医院，每年承担临床医学八年制、五年制以及预防、公共卫生等专业1000余名医学生的理论授课与临床实践教学工作;拥有7个博士点、10个硕士点，每年在读研究生250余名。拥有国家儿科和儿外科住院医师规范化培训基地，国家围产新生儿和小儿麻醉专科基地，13个上海市儿科亚专科和儿外科医师培训基地，每年在培住院医师和专科医师规范化培训学员210余人;每年培养长期进修学员350余名，短期进修学员400余名。每年举办60余期继续教育学习班。形成了“全链条式教育”的儿科人才培养体系，致力于院校教育、毕业后教育、继续教育为一体的有机衔接和螺旋式能力提升。十三五期间，获国家精品开放课程，国家虚拟仿真建设项目。2021年，《儿科学)获首届国家精品教材奖。