深入研究病毒与细胞相互作用关系，寻找并开发新的抗病毒药物。生物化学与分子生物学：主要开展生物化学、分子生物学及病毒学方面的基础与应用研究。包括：目的基因克隆、改建、修饰以及真核、原核病毒系统中的表达，构建和改造表达载体，寻找克隆有潜在价值的病毒基因和蛋白多肽药物基因。开展病毒疫苗、基因工程药物与基因工程疫苗的研究开发。同时开展以腺病毒载体、干细胞等对神经系统退行性疾病进行基因治疗的研究；登革热分子流行病学调查、致病机制及疫苗开发研究；人乳头状瘤病毒（HPV）分子流行病学研究及HPV致病机制研究；肿瘤血管新生信号调节网络及靶向基因治疗研究，探索肿瘤治疗的新策略；利用哮喘及炎性肠病动物模型，研究炎症以及组织病变过程中的重要参与细胞和所分泌的功能介质如细胞因子等。
动物学：围绕实验动物的饲养、繁殖、管理、质量控制、生物安全及其标准化建设研究。包括：人类疾病动物模型建立（艾滋病、糖尿病、生殖、心血管等疾病）；应用实验动物疾病模型，开展药物和疫苗的药效学、免疫原性、药代动力学和安全性评价等研究。
三、学科点主要成果和目前承担课题在所有招生学科点中，共获得国家级科研成果奖9项，省部级科研成果30余项，院校及市级科研成果20余项，其中遗传学学科的一项科研成果获2005年国家自然科学二等奖。学科点承担各类研究课题40余项，包括国家自然科学基金项目、国家重大传染病专项、国家重大新药创制、国家科技支撑计划、国家"973"、"863"科技计划、中美医学基金（CMB）项目、教育部博士学科点专项基金、云南省科技计划、省自然科学基金等项目。
四、学科点实验室主要设备研究所具备良好的研究生培养条件。拥有国内外一流的实验设备，具备开展高水平的分子生物学、分子病毒学、免疫学、病原生物学、医学遗传学等基础研究及疫苗、免疫制品和基因工程产品的研制开发条件。
五、招生导师与学科（一）博士生导师10名。免疫学：李琦涵、刘龙丁、董少忠生物化学与分子生物学：孙茂盛、胡云章、马雁冰、孙强明、李鸿均病原生物学：廖国阳遗传学：杨昭庆（二）硕士生导师32名。免疫学：李琦涵、刘龙丁、刘建生、刘红旗生物化学与分子生物学：李琦涵、孙茂盛、胡云章、胡凝珠、李鸿钧、孙强明、马雁冰、谢忠平、董少忠、刘馨、寸韡遗传学：史荔、黄小琴、杨昭庆、俞建昆、姚宇峰病原生物学：陈元鼎、谢忠平、廖国阳、李卫东、孙明波、杨净思、马绍辉、施海晶、李华、龙润乡动物学：代解杰、孙晓梅、和占龙细胞生物学：廖国阳、刘龙丁
六、招生规模自1996年起，研究生招生规模稳步扩大，从刚开始每年招生3-4名，发展到如今每年招生近30名。至今为止，已培养毕业硕士生200名，博士生53名。目前在校生97名，其中硕士生76名、博士生21名。
七、其它
（一）培养方式：硕士生：三年。第一年在北京协和医学院学习学位课程，第二、三年回昆明完成毕业论文。博士生：三年。前半年在北京协和医学院完成学位课程，后两年半回昆明完成毕业论文。直博生：五年。第一年在北京协和医学院完成硕士、博士学位课程，第二、三、四、五年回昆明完成毕业论文。
（二）授予学位单位：学位证书由北京协和医学院与清华大学共同颁发。
（三）科研经费：研究生进入实验室后，从行政经费中每年拨给一定课题经费，以保证完成一定质量的毕业论文。具体：硕士生共拨给12000元、博士生共拨给18000元、直博生、硕博连读生共拨给30000元。除此之外，从2011年开始设立研究生创新基金。每年资助1-2名博士生、3-4名硕士生从事探索性研究课题。
（五）毕业去向：属于北京协和医学院毕业生，就业时由北京市教委派谴。