作为承载清华大学建设“双一流”大学的重要使命的医学学科组成部分，北京清华长庚医院以成为国际一流医学中心为目标，以“提供健康守护、培养医学精英、创新临床研究、追求卓越管理”为使命，致力于全面借鉴台湾长庚纪念医院现代医院管理模式和经验，实现医教研均衡发展。
医院已经建立了符合我国及北京市要求、具有鲜明特色的住院医师-专科医师一体化培训体系，现有住院医师规范化培训基地13个，专科医师规范化培训试点基地2个，2018年被教育部评为首批国家临床教学培训示范中心。2019年度国家住院医师年度业务水平测试成绩位居全国第一。2020年度董家鸿院长荣获全国住院医师规范化培训“优秀住培基地负责人”，同年医院与哈佛大学合作启动师资发展计划等国际合作项目，培育一批具有国际化视野的青年骨干师资。2021年正式成为英国爱丁堡皇家外科学院普通外科培训项目认证基地。
学员待遇保障
1.培训基地层面绩效：7-10万/年
2.伙食补助：450元/月
3.住宿福利：优先解决宿舍
4.节假补贴：依医院标准统一发放
5.夜班费：依医院标准统一发放
6.教材费：住院医师教材费400元/人.年
7.医师职业发展导师：匹配活动经费600元/人.半年
招生对象和计划
1.招生对象
应为拟在北京地区从事临床医疗工作的全日制医学专业（临床、口腔、中医）本科及以上学历的毕业生，或已从事临床医疗工作并取得《医师资格证书》，需要接受培训的人员，包括委托培训人员和自主培训人员。
2.初步招录计划
专业
单位人
社会人
全科
17
3
内科
13
2
神经内科
外科
12
麻醉科
1
妇产科
重症医学科
耳鼻咽喉科
皮肤科
康复医学科
康复治疗（技师）
5
放射科
检验医学科（技师）
专业基地介绍
1.全科
北京清华长庚医院全科是国家级全科医学住院医师培训基地，也是昌平区全科医学质量控制中心。基地以全科医学科为核心，以北京德胜社区卫生服务中心为基层培训基地，联合北京清华长庚医院所属昌平区天通苑北社区卫生服务中心、昌平区东小口社区卫生服务中心、北七家社区卫生服务中心等紧密医联体，实现综合医院与基层社区卫生机构的紧密衔接，为培训学员提供了全方位的培训和学习平台。
2.内科
3.神经内科
神经内科为医院优先发展三大重点学科之一，按照国际一流神经医学中心标准组建，亚专业设置齐全，现有床位60张，年门诊量5万余人次。神经内科医工结合特色特出，师资力量雄厚，由知名专家武剑教授领衔，指导老师均由来自国内外顶尖医学中心，教学形式多样，教学成果优异，医师资格考试以及住院医师规范化培训结业考试通过率100%。
4.外科
外科专业基地由董家鸿院士领衔，科室设置齐全，配套科室实力雄厚。现有师资141人,均来自国内顶尖医学中心，教学经验丰富；2021年开放床位数386张，年收治住院病人数14516人次，年手术量13473台。外科收治病种涵盖培训目录要求，手术及操作种类丰富。
5.神经外科
神经外科为医院优先发展的重点科室，由杨学军教授担任科室主任和基地主任，王劲和王贵怀教授（首任主任）担任首席专家，科室以颅脑外伤、脑血管病、颅脑肿瘤为基本病谱，以脊髓脊柱、功能神经外科为特色。师资12名，床位数60张，年手术量1500台余，配备显微镜、骨微动力、神经内镜、3D打印、脊柱内固定等培训空间和设备。科室作为分中心与北京天坛医院和上海华山医院神经外科建立国家神经系统疾病研究中心，进行联合培养强基计划。
6.麻醉科
麻醉科是医院重点发展学科，由张欢教授担任基地主任。全年手术量2万余例，手术麻醉种类齐全，其中包括复杂肝胆手术，肝肾肺移植，小肠移植，心脏移植，鼾症，高龄骨科及心胸血管手术等。目前科室拥有师资12名，清华大学临床医学院教授1人，副教授1人，硕士研究生导师2人。科室配备有国际一流水准的专业仪器和设备，教学活动多种多样，包括理论讲课、图谱学习、文献阅读、教学查房、Workshop及知识更新等。
7.妇产科
妇产科基地负责人是知名专家廖秦平教授，基地现有主任医师3名、副主任医师6名、主治医师13名，均来自北京市知名三甲教学医院并接受正规教学培训。基地包括妇科病房（含计划生育病房）、产科病房、产房、妇产科及计划生育科门诊、妇产科微生态实验室、妇产科超声室、阴道镜室等部分，集医疗、教学、科研于一身，开展基础与临床研究，为培养合格住院医师提供优越条件。
8.重症医学科
重症医学科首批获得国家重症医学住院医师与专科医师规范化培训基地资质。年收治急危重症近1500例，病种丰富，涵盖各特色亚专科危重疾病。配备多种先进医疗设备可供教学培训、实操；基地拥有多名教学经验丰富的指导老师，定期开展多种教学、科研培训活动，为住院医师培养创设了良好的培训环境。
9.耳鼻咽喉头颈外科
10.康复医学科
康复医学科由潘钰主任领衔，以神经康复、慢性肌骨疼痛康复、肿瘤康复为特色专业方向，拥有医产学研协同发展的优秀康复师资队伍，开展国内外前沿康复新技术，教学管理有序，理论和操作培训规范。以培养康复医师和康复治疗师六大核心能力为目标，向社会输出优秀康复人才。
11.皮肤科
皮肤科为医院重点发展学科之一。负责人为赵邑教授，基地现有临床带教老师10名及2位国内外知名特聘教授。医教研工作在门诊、病房及医疗美容中心开展。亚专业设置齐全。以银屑病等炎症性皮肤病、激光医学美容、皮肤外科及皮肤肿瘤、组织细胞疾病等为特色。教学实力坚实，每周设置形式内容多样的教学活动，定期组织评估、考核,提升住院医师的综合实力，并提供参与临床研究与转化研究的机会，为住院医师的成长提供良好的空间。
12.放射科
放射科由郑卓肇主任领衔，基地具有先进的影像设备、齐全的检查项目、完善的住培教学数据库，多数带教老师具有多年三甲医院教学工作经历，科室每周开展住院医师专项培训活动，定期进行人文培训、医师座谈会等，致力于住院医师在人文、医学、科研、教学等方面的综合提升。
13.检验医学科（技师）
检验医学科负责人为赵秀英教授，基地现有师资15人，其中主任医/技师3人、副主任医/技师2人，均具有丰富的临床带教经验。科室于2019年7月通过ISO15189评审，具有深厚的医、教、研及人文底蕴，是训练有素、活泼向上的团队。现有临检、生化、免疫、血液、微生物、分子生物专业组及7位医师组成的临床顾问组，可开展400多项检测项目。基地自成立以来，住培结业考核通过率100%，具有完善的培训和考核体系，为青年检验人才提供初阶、进阶培训，以培养优秀的检验医学人才。