男性尖锐湿疣好发于外生殖器，早期症状主要表现为阴茎、龟头、包皮、阴囊等生殖器部位，或与生殖器官有紧密联系的部位，比如尿道口、肛周、腹股沟等，出现单个或多个淡红色小丘疹。可随病情的加重，逐渐发展为乳头状、菜花状、鸡冠状的疣体，呈现为红色或污灰色，少数患者存在皮肤瘙痒、出血、脓性分泌物聚集等异常症状。
若尖锐湿疣发生在阴茎、龟头、包皮等部位，可能会诱发龟头或包皮炎症，严重时会引起排尿疼痛。在进行性生活时也可能会出现外生殖器疼痛、出血的情况发生。
由于在临床上，尖锐湿疣并没有相对特异性的治疗方法，而且容易反复发作。因此若男性已经确诊为尖锐湿疣，建议及时进行对应治疗。比如外用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊、氟尿嘧啶乳膏等药物。但主要的治疗方式为疣体切除，常通过激光、冷冻、电灼，或者手术等方式进行切除。
男性尖锐湿疣的主要症状是外生殖器出现新生物，通常发生在阴茎包皮、冠状沟等处。同性恋患者也可在直肠内长出尖锐湿疣，如果性交方式改变，也可在口腔内长出尖锐湿疣，主要表现为乳头状、鸡冠状或菜花状新生物，一般无明显疼痛或瘙痒感。
男性尖锐湿疣早期症状初起为细小淡红色丘疹，以后逐渐增大增多，单个或群集分布，湿润柔软，表面凹凸不平，呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起，红色或污灰色，
根部常有蒂，且易发生糜烂渗液，触之易出血，皮损裂缝间常有脓性分泌物郁积，致有恶臭，且可因搔抓而引起继发感染。因其生殖器温度较低，所以干燥部位的损害常常表现为小而扁平状。
尖锐湿疣在男性和女性来说，并没有什么症状上的差别。对于男性来说，尖锐湿疣常出现的位置就是在阴茎、龟头、冠状沟、尿道口附近，也可以出现在肛门以及直肠附近。在尖锐湿疣的早期，会在上述这些部位出现一个个淡红色的小丘疹。如果不管它，这些丘疹会慢慢的变多变大，表面会有疙疙瘩瘩的情况存在。
典型的尖锐湿疣表现是像菜花状、鸡冠状、乳头状。尖锐湿疣的疣体主要是污粉色，或者是接近于肤色。尖锐湿疣的疣体表面比较脆弱，容易发生破损出血的情况，而且表面会有明显的渗液。尖锐湿疣的患者并没有什么特殊不适的感觉，但是可能会有异物感或者是刺痒的感觉。