尖锐湿疣虽表现为皮肤损害，而病根却在体内，单一的药物治疗很容易产生耐药性，不容易治愈;进行激光、冷冻、电灼等物理治疗时，操作医生缺乏耐心、细心和经验，容易漏掉体积小、生长在隐蔽部位的疣体，为复发留下隐患。
2、湿疣很复杂
部分尖锐湿疣患者的疣体较大而且根深，甚至融合成片，自身互相传播，临床治疗很难将其彻底的清除干净;潜伏感染的人类乳头瘤病毒会造成尖锐湿疣复发;亚临床感染的存在以及再活动也与本病的复发有关。
3、患者体质差，免疫功能低下
患者合并糖尿病、肝炎等基础疾病，体质差容易感冒且免疫力低下，如果首次治疗不彻底，而患者自身又不配合就极易复发。4、夫妻间交叉感染
夫妻一方的尖锐湿疣病症已经治愈而且另一方是亚临床感染或着潜伏感染状态，经过亲密接触之后会引起交叉感染，因此特别提醒尖锐湿疣患者在彻底治愈之前不要进行房事，同时还要要求性伴侣共同治疗
尖锐湿疣的危害有多大
1、传染给别人。尖锐湿疣的传染性极强，只要您接触到了沾有患者的分泌物的物品，如毛巾、洗脚盆和厕所的马桶圈等，那么您就很有可能会患上尖锐湿疣。
2、影响怀孕和生育。如果孕妇患有尖锐湿疣，那么尖锐湿疣会通过分娩时传染给婴儿，导致婴儿也患有尖锐湿疣。所以建议尖锐湿疣患者在治疗好病情以后再去怀孕和生育。
3、容易发生癌变。如果得了尖锐湿疣没有及时治疗或者治标不治本，反复的发作，也有可能会使尖锐湿疣病毒发生癌变。尤其是女性，经研究发现，女性尖锐湿疣癌变的几率要比男性尖锐湿疣的几率高的多。
4、有溃疡和出血等现象出现。因为这种疾病的发病部位经常是在生殖器，而这些部位又是最容易引起感染的，所以，就会不可避免的造成局部的溃疡、疼痛以及出血和化脓等症状。
5、心理危害。尖锐湿疣属于性病范畴，一但被确诊，不少病人会背上沉重的心理负担。当夫妻间有一方患病，双方便相互猜疑，导致家庭不和睦，甚至很可能导致一场婚姻危机。心理的担忧，害怕，也是导致部分患者讳疾忌医的主要因素，病情不断加重却隐瞒不敢治疗。所以，适当的心理疏导和原谅关爱，是鼓励患者积极就医的重要因素。