常设《壮丽三峡》《远古巴渝》《重庆·城市之路》《抗战岁月》《宋庆龄与保卫中国同盟文物资料陈列》《白鹤梁水下博物馆基本陈列》等展览13个，年均推出临时展览20-30个，加以《重庆大轰炸》半景画演示、《大三峡》环幕电影、三峡大坝数字沙盘、互动展示魔墙四大展示亮点。
1楼
壮丽三峡
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分为造化三峡、山水之间、三峡风流、永远的三峡四个单元。《壮丽三峡》以丰富的地理人文史料，将三峡山水、人文历史一一展现，其中有三峡工程、三峡移民、三峡文物保护的壮举，更有可歌可泣的三峡移民精神，犹如动人的画卷，抒发三峡的壮美、神奇、深厚、多情，谱写永远的三峡。
2楼
远古巴渝
《远古巴渝》以石器时代、青铜时代的馆藏文物，集中展示重庆古老文明，追溯3000年文化的根源。
巴渝地区发现了许多的旧石器文化遗址，时代分布从旧石器时代早期到晚期都有分布，其人类发展序列相对完整，世界上少有，是研究早期人类活动的重要地区之一。
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三峡地区孕育了中国西南地区最早的新石器文化，一个个新石器文化在这片青山秀水之中，持续不断地生长了6000余年。
重庆：城市之路
《重庆：城市之路》，以大量文物资料，反映20世纪的100年中，重庆面临的若干机遇及发展，包括城市变迁、商业金融中心地位的形成、工业的崛起等。扫描对重庆起推动作用的人物、事件，展示重庆直辖后的风采。
3楼
抗战岁月
抗战时期，重庆作为中国的战时首都、中共中央南方局所在地、抗日民族统一战线的重要政治舞台同盟国中国战区统帅部所在地，为抗日战争和世界反法西斯战争的胜利作出了巨大的历史贡献。在这场英勇不屈的反侵略战争中，重庆人民同全国各族人民以和世界爱好和平的人民一道，以其坚毅的勇气、惨烈的牺牲、卓绝的奋斗，谱写出了追求民族独立和人类正义的壮丽诗篇。
展现在我们眼前的《抗战岁月》展览、《重庆大轰炸》半景画以及《重庆大隧道惨案》复原场景，三位一体，共同构成了一幅宏大的历史画卷，它将我们带回到那场决定民族命运与世界和平的伟大战争中。
历代钱币
《历代钱币展》集中了从远古的贝币到当代我国的人民币，展品达2000件以上。
西南民族民俗风情
中国大西南，包括重庆、四川、云南、贵州、广西、西藏六省、区、市。在这片美丽的土地上，30多个民族和睦相处，共建美好家园。大西南历史与自然的多样性和差异性，造就了西南民族文化与传统的多样性和独特性。美丽的自然山川，多彩的民族风情，造就了充满和谐、充满神奇的魅力大西南。
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重庆博物馆从上世纪50年代初就开始征集、研究西南少数民族的生产生活用品和艺术品。这里展示其中部分藏品，虽不足以反映西南少数民族文化的博大精深，但可管窥西南民族风情之一隅。
巴蜀汉代雕塑艺术
展览名称：“巴蜀汉代雕塑艺术”
开展时期：2021年5月15日（常设展览）
展览地点：重庆中国三峡博物馆3楼巴蜀汉代雕塑艺术展厅
展览形式：免费参观
中国雕塑源远流长，巴蜀地区的汉代雕塑是中国艺术宝库中的一颗璀璨明珠。为迎接“5·18国际博物馆日”，自2021年5月15日起，重庆中国三峡博物馆将推出焕然一新的“巴蜀汉雕艺术”专题陈列，展览是对原有“汉代雕塑艺术”的改造升级，展厅面积约720平方米，共展出石阙、画像石、画像石棺、画像砖、陶俑、模型明器等巴蜀地区汉代雕塑类文物近160件（套），其中一级文物多达47件（套）。
4楼
历代瓷器
历代书画
中国书画是中国文化的重要组成部分，有着深厚的传统和独特的民族风格。国画有“工笔”和“写意”之分，人物、山水、花鸟画是中国画的三大类，五代时期，宫廷画院诞生了；宋代，诞生了“文人画”。于是中国画坛就有了民间画、文人画和院画的区别；中国历代书法家们以真、草、篆、隶、行诸书体展示他们的才艺，诞生了众多的书艺流派。
景仁怀德--李初梨刘钧捐赠文物展
这里展出的是一位革命老人捐献文物的一部分，这位老人叫李初梨。
走进展厅，我们会看到一尊汉白玉雕刻的李初梨塑像，又看到李初梨的一组生活照片。塑像后，有一间李初梨的“书房”，一个学养深厚的老革命家、文化人的书房，儒雅、书卷气，能反映李初梨的学养、气质的书房。经过“书房”后，就进入了展厅，按书画、陶瓷、紫砂、砚台、铜器、碑帖分六类展出。展出明清书画22件，历代瓷器21件，明清紫砂25件，砚台8件，铜器9件，碑帖8件，展品总数93件。这个数量，只占李初梨捐献文物的15％。
高罗佩私人收藏文物展
展览名称：巴渝旧事君应忆——荷兰高罗佩家族捐赠高罗佩私人收藏文物展
展出地点：重庆中国三峡博物馆4楼展厅
经过3年多的海外文物征集和展览筹备，首次在国内展出高罗佩在重庆生活工作期间所收藏的文房用品、家居、瓷器古玩等近200件套，均为高罗佩后人近期捐赠给我馆的高罗佩私人收藏，这批文物陪伴高罗佩走完了他最后的人生道路，也是中荷两国友谊的永久见证。展览将从“高罗佩的书房与文玩收藏”、“高罗佩的生平与汉学成就”、“高罗佩的作品与字画收藏”和“再续高罗佩与重庆的历史前缘”四部分，展示一位外国人的东方收藏，回顾重庆的抗战岁月，走近高罗佩的传奇人生。