南京博物院前身是1933年蔡元培等倡建的国立中央博物院，原拟建"人文"、"工艺"、"自然"三大馆，后因时局关系，仅建"人文馆"，即现在的南京博物院大殿。2009年扩建，2013年11月6日对外开放后，成了仅次于中国国家博物馆的中国第二大博物馆，共设历史馆、特展馆、数字馆、艺术馆、民国馆、非遗馆六馆。
大门
平面图
文渊广场
地面上浮雕。正中是博物院全景。周围是院藏镇馆之宝。
第一排：釉里红岁寒三友纹梅瓶、青瓷神兽尊、神人兽面纹琮
第二排：错银铜牛灯、博物院全景、金兽
第三排：广陵王玺金印、三彩陶双鱼瓶、青花寿山福海纹瓷炉
服务中心
艺术馆
特展馆（左）、历史馆（右）
历史馆。南京博物院前身是1933年蔡元培等倡建的国立中央博物院，原拟建"人文"、"工艺"、"自然"三大馆，后因时局关系，仅建"人文馆"，即现在的南京博物院大殿，该建筑为仿辽代宫殿式，由著名建筑师徐敬直设计，经建筑大师梁思成修改，整个大殿雄伟壮观，是近代建筑史上的杰作，也是南博的标志性建筑，其结构部分按《营造法式》设计建造，细部和装饰兼采唐宋遗风。
展馆内景
先上二楼。
院长致辞
导览图
远古印象
江苏地处长江下游，傍江临海，历史悠久，经济文化繁荣昌盛。远古洪荒，在这片江海交汇的神奇土地上，森林，植被繁茂，动物种类繁多，在生生不息的生命繁衍中，人类出现了。本展览为常设展览，旨在向观众展示远古时期江苏大地原始人类的生存遗迹。
大角鹿
猛玛象
披毛犀
古野牛
古野马
海百合化石
天地造化，史前神韵
序言
穿越蒙昧-旧石器时代
“南京人”头盖骨三维成像图
从元谋人到山顶到山顶洞人。
旧石器时代工具
砍砸器
江苏文明之根
饭稻羹鱼
陶器
溧阳神墩水稻种子化石
陶器、石器
社会演进
平等社会
初步分层社会。陪葬品的多寡和贵贱开始有区别。
明显分层社会。墓穴的大小、陪葬品的多寡和贵贱有明显区别。
琢玉通灵
人鸟兽玉饰新石器，昆山市赵陵山遗址
古城初现
连云港藤花落古城
朝墩头遗址玉人像
良渚玉钺
草鞋山遗址玉琮
神人兽面纹琮，新石器，常州寺墩遗址
新沂市花厅遗址环壁
新沂市花厅遗址组合玉饰
精彩陶艺
新石器时代标本室
方国风云吴越春秋-青铜器时代
诸夷拓疆
土著生活
社祭制度、商朝东界
祭祀骨架
社会生活
青铜尊
青铜兽面纹铙，商，南京市江宁区出土
方国竞辉
重点方国常州武进淹城
淹城全景
天目山城址
古宜国
古干国
丧葬礼制青铜礼器
青铜器
青铜四凤盘
青铜牺觥，西周，镇江市丹徒区烟墩山墓出土
原始瓷礼器
吴越争霸
政治团体吴中心区
木渎古城遗址
奔吴诸国
吴外姓
吴属国
礼乐盛兴
石编钟
青铜编钟
越礼新风
原始青瓷甬钟
军事竞逐
镞
剑
戈
矛
车马器
齐楚相安
青铜错金银牺尊，战国晚期，涟水县三里墩出土
青铜马/车/俑，战国晚期，涟水县三里墩出土
郢爱，战国晚期（楚国），盱眙县南窑庄遗址出土。（纵12.6cm，横最大处8cm，厚0.3cm）平面呈长方形，边缘斜直，面有篆书“郢爰”阴文印记，完整54个(纵6行，横9行)半印6个，背微弧，光滑。
错金银重络铜壶。重量为5590g，高23.6厘米，口径12.8厘米，腹径22.2厘米，圈足径13.8厘米。壶体除了颈部与腹部的错金银斜方格云纹外，还各有48条蟠龙和48行梅花，工艺极其繁复精致。壶身网格套外还有四只伏兽和四个衔环兽首。
专家还发现了三段三十九个字的铭文。壶上铭文的内容与流落美国的陈璋方壶几乎一致，在这两段铭文背后记录的是一段战国时期的跌宕起伏的历史事件。
可能是后来铜壶的主人为了躲避战乱，将本用来盛酒的铜壶装入了金子埋入了地下。这件铜壶与许多窖藏一样，都等不到自己原来的主人来将它们重新取出。再次出现在世人面前，已经是两千年后了。
这件文物是一个村民给意外发现了，后来自愿上交给了南京博物院。
周代土墩墓文物标本室
郡国华章汉家故里
楚汉之争
西汉全图
郡王并行
西汉时期的江苏
西汉江苏境内诸侯王国
东汉时期江苏境内诸侯王国
铜雁足灯
宏伟王陵
“凿山为藏”的崖洞墓。西汉时期徐州地区的汉代诸侯王陵均采用此形制，在山体中心凿出外墓道，内墓道，耳室，甬道，棺室及陪葬墓等部分
“黄肠题凑”竖穴木构墓
永生之梦
展厅局部
各种殉葬品
玉棺盖
西汉金缕玉衣
精美工艺
编钟
“长毋相忘”铭合符银带钩
汉代漆器图案
鎏金铜鹿灯
铜牛灯
错银铜牛灯
日常生活
邳州汉画石像石墓
江东风流六朝迭起
六朝古都
石辟邪。全名叫做“太平村失考墓辟邪”，出土于栖霞区燕子矶太平村太子凹，是南朝时期的文物，也是南京作为南朝宋、齐、梁、陈四个朝代的首都，最终成为六朝古都的历史见证，因此，称这座石辟邪是整座南京博物院中“最南京”的文物，名副其实。
帝王陵墓
六朝皇帝陵墓和简表
开发江南
农业手工业
士族生活门阀制度
奢华生活
牛车出行
庄园经济
青瓷鸟兽人物堆塑罐
红陶飞鸟人物堆塑罐
魏晋风华
鼓吹出行砖画
南朝·羽人戏龙砖画
南朝·竹林七贤与荣启期砖画。画长约4.8米，高约0.8米，出土于南京西善桥某南朝大墓中，是我国考古发现的最早且品相最为完好的大型人物画像砖实物，南朝帝王陵墓装饰壁画，20世纪中国百项考古大发现之一。砖画由200多块古墓砖组成，分为两幅，嵇康、阮籍、山涛、王戎4人占一幅，向秀、刘伶、阮咸、荣启期4人占一幅。人物之间以银杏、松槐、垂柳相隔。8人均席地而坐，但各呈现出一种最能体现个性的姿态，士族知识分子自由清高的理想人格在这块画像砖上得到了充分地表现。
六朝文物标本室
隋唐时代
展品
人首鱼身陶俑
人首龙身陶俑
双鱼
东南都会
大运河
古扬州城
陶牛车
多彩生活扬州铜镜
唐三彩
商贸汇聚
骆驼和胡俑
妇女服饰
浓妆高髻
载歌载舞
盛唐遗韵
南唐出土陶俑
唐宋文物标本室
宋元时代
市民风尚
平江图
白釉黑花瓷镜盒
瓷枕
元代遗珍
元代大运河图
瓷器
如意云纹金盘
梅花巾扣
盛世江南明清辉煌
宫阙相望
明初都城南京
南京明故宫模型
明代琉璃构件位置示意图
明洪武年白釉“赏赐”铭文瓷瓶
明孝陵
大报恩寺
大报恩寺塔琉璃拱门。在南京的秦淮区中华门外，有一座中国规格最高、规模最大、保存最完整的寺庙遗址，这便是2010年全国十大考古新发现之一的南京大报恩寺遗址。在这座遗址中发掘出了世界唯一一枚佛顶真骨、以及七宝阿育王塔等极为珍贵的文物，大报恩寺的琉璃宝塔位列中世纪世界七大奇迹。这座奇迹般的遗址中有一样精美的建筑构件被整体搬迁到了南京博物院内，这便是大报恩寺琉璃拱门。
明代的工匠们在建造南京大报恩寺时，重要的建筑构件，都烧制了1-2套备份，主要用来修复建筑时使用，而南京博物院内的大报恩寺琉璃拱门，就是用的其中一套备份材料搭建起来的，与原件一模一样
两江总督署
富甲天下
江南民居
甘熙宅第
熙园
留园
家俱
古典园林
南京瞻园、无锡寄畅园、无锡云起楼、扬州寄啸山庄
苏州网师园、苏州环秀山庄、苏州拙政园、扬州个园
富裕生活
青花釉里红水中八事纹盘
象牙雕
犀角杯
金凤冠
瓶
扇子
镶螺钿漆柄绘山水麦茎编织团扇
铜镜
绣品
熏香炉
昆曲
工艺重镇
苏州玉器
玉器
琢玉流程
宜兴紫砂
五彩釉紫砂方壶
扬州漆器
苏州刺绣
书画王国
文房四宝
红木雕荷花蟹虫笔洗
明文徵明《雪桥跨蹇图》文徵明好做雪景，以粗笔写山峦树石，线条雄阔劲健，略具黄公望笔意；敷色简淡，天空、溪水皆以淡墨烘染，空留出皑皑雪地，不施白粉，然觉严冬寒气逼人。
清，郑燮《甘谷菊泉图》以书法笔趣入画，用笔瘦劲古道。画中丛菊苍岩，草涧流泉，其章法奇致，处处留白，画面满而不塞，颇具金石情趣。款题：“南阳甘谷家家菊，万古延年一种花。”
清倪瓒《游马驾山书画图卷》
星汉璀璨
文字和书籍是文明的进步产物
名家
郑和下西洋
高大上的内厅。
数字馆
数字馆位置：历史馆与特展馆交界处的负一层。
通过扶梯隧道进入数字馆。其上有一拱形顶罩。上面变换着各种星空动画。
南京博物院数字馆由实体展馆和网络虚拟馆构成。实体馆约1200平方米，用抽象概念辅以历史事实的表现方式诠释中华文明发展历程。网络虚拟馆通过网络和图像识别技术复原实体展馆的空间和内容，是实体展馆的延伸。
六大展区：序厅、萌动与发轫、进取与成长、扩张与融合、封闭与开放、生命因你永恒。
这些图腾向我们箴式了古人对于自身与自然认知及思索。
地上流动的各个时期的字体，就像历史在我们面前翻转显现。
霸王别姬
用C形巨幕影片以战争、帝国故事表现人类进步过程中的豪迈激越、坚韧不拔。