哪些问题是农村土地确权中存在的，当前农村土地管理产权状况复杂、承包关系不清、权属争议较多等现象突出，它们盘根错节、相互交织，阻碍了农村土地承包经营权的确权。总结起来，农村土地确权存在的问题主要有：1、承包地确权基础不牢。农村二轮土地承包中，
当前农村土地管理产权状况复杂、承包关系不清、权属争议较多等现象突出，它们盘根错节、相互交织，阻碍了农村土地承包经营权的确权。总结起来，农村土地确权存在的问题主要有：
1、承包地确权基础不牢。农村二轮土地承包中，少数乡村干部对承包政策操作不规范，落实不到位，村民之间，集体与个人之间土地遗留问题关系错综复杂，权属信息不明确;致使部分《农村土地承包经营权证》没有及时分发到户，出现“有地无证、有证无地、一地多证、一证多地、无地无证”等现象，给当前确权工作增加了难度。
2、确权工作量大，需要投入大量的人力、财力。二轮承包时基本都是靠竹竿和皮尺传统方法丈量，确权登记颁证则要求测绘精准、程序规范，主要是依据GPS现场测量定位，甚至要采用航拍彩图、鱼鳞图测绘等现代技术，投入大;调查摸底、影像解释、制作地图、信息录入等工作流程，需要村民到场见证签字，解决现实问题需要村民多轮开会协商，费时费力，村民和外出务工农民参与积极性不高。
4、农民的心理因素不能忽略。一是部分村民希望通过确权颁证弥补减损的土地面积，原来一直没有解决的问题能够得到解决。二是部分村民实际种植土地面积大于登记面积，希望借助新一轮确权登记增加惠农补贴。三也有人担心自己因户籍迁走而在确权颁证中失去土地。同时，也有一些别有用心的人，借农村土地确权颁证工作大讲土地私有化，侵犯农村集体经济组织利益的利益。
自2011年中央部署开展试点工作以来，问题重重，疑虑声很多。15年7月，针对农村土地承包经营权确权登记工作中存在的问题，中国地理信息产业协会向农业部发送了一份报告，同时抄送中央农办、财政部、审计署和国家测绘地理信息局。
报告指出，由于低价竞争、政府资金不到位等原因，在农村土地承包经营权确权登记工作开展过程中，存在着低于成本价恶性竞争、低价中标导致粗制滥造、地方政府资金不到位等严重问题。国家投入大量财政资金，本来是惠民工程、民生工程、民心工程，有可能变成烂尾工程、豆腐渣工程。
农地确权成本高，现行政策下收益又极小化。确权是为了带来诸多收益，确权后应有利于土地转租、抵押和买卖。但就目前政策来看，农地确权所确“承包经营权”显然不能买卖，仅允许转租和抵押。且对中国而言，绝大部分农地、尤其是占主体的破碎农地，其转租价值非常有限，而抵押价值则几乎不存在。破碎且规模小的承包地即使可以转让，理论上也可以到银行去融资，但因不能自由买卖，必然抵押价值极低。这一方面是因为几十年承包权租金的定价比较困难，另一方面银行为小额放贷承担的单位成本势必很高，银行肯定缺乏动力。因此，它不会有利于这一政策希望支持的农村家庭农场壮大。不允许农地自由买卖，政府可能有其考虑，首先是担心这个政策一旦实施会引起农村土地过度集中，甚至可能导致大批农民失地；其次，政府可能还担心农地利用失控，无法实现耕地保护的目标。
一、房屋确权纠纷怎么解决
这种情况下可以向当地法院提起诉讼。口头协议需要有第三方人认证。按照确权之诉提起诉讼。
（二）诉讼受理费：案件收取，一般每件300元。
（四）在房产地法院立案庭递交起诉状，根据要求缴费会得到一个立案通知书，在举证期把证据递交补充齐全。等开庭审理。
（五）如果最终得到确权判决，要及时申请法院给房管部门发出协助执行通知书，办理产权。
二、农村土地确权纠纷如何解决
（一）运用土地确权原则和方法，确定实践中具体土地权利的类型、性质、主体、客体，以及权利内容等。
（二）掌握土地权属争议的类型、现行法律法规和规章中规定的处理方式、处理机关、处理程序；运用有关土地权属争议调处的规定，对具体争议案件提出处理方式和程序。
（三）运用土地确权和争议调处法律、政策，针对具体争议案例进行分析，提出处理意见。各地要从机构建设、队伍建设、经费保障、规范程序等各方面，切实采取有力措施，建立健全土地权属争议调处机制，妥善处理农村集体土地权属争议。
由于各村干部及农户人口变化大，农户实际耕种的承包地、自留地等土地难以准确区分类别，容易造成承包地总面积增大，影响了确权面积准确性。又如承包土地时，明确规定果园地不允许承包，但有的果园地也登记在权证上。1998年农村土地“二轮延包”时，土地是按面积平均发包到人，由于在不同区域土质差异大，按照地力肥瘦折扣标准计算后，相同承包人口的家庭，土质差的承包土地面积相对较宽，土质好的承包面积相对少，使得目前确权实测后各户人均面积不一致，导致按照实测面积据实确权难以顺利推进。
近年来，随着国家取消农业税、粮食补贴等一系列惠农政策的出台以及新农村建设土地占用的增加，农村集体土地价值上升，农民对土地确权利益期望增多，在确权过程中承包土地权属争议和纠纷渐渐增多。尤其是“二轮延包”遗留问题使得复杂的土地承包纠纷在此次确权落实过程中显现出来，且目前村委会和乡镇经营管理指导站主要承担基层土地承包经营权纠纷调解，协调解决难度非常大，影响土地承包确权的落实。农村土地承包法规定，拥有该土地承包经营权以承包合同为依据，但实际工作中一些承包合同中土地承包关系信息不清问题引发土地纠纷相对突出。如实际土地承包经营状况与发证情况不相吻合。又如，土地按面积平均发包到人，由于在不同区域土质差异大，按照折扣标准计算后，土质差的家庭承包土地面积相对较宽，使得目前确权实测后各户人均面积不一致，承包面积相对少的农户则不同意按实有面积确权，只接受按平均实测面积确权，导致据实确权难以顺利推进。
由于配套机制滞后及土地承包难确权导致土地承包权有偿退出难，土地经营权在抵押贷款、银行融资等方面作用难以得到发挥。一是尚未建立专业的土地经营权评估机构。农地经营权价值是金融机构授确定信贷款额度的基础，而目前专业的土地经营权价值评估机构和具有专业资质的评估人员匮缺。二是缺乏真正意义上的土地流转中介机构和土地仲裁机构，在借款人出现经营风险、缺乏偿还能力时，对土地经营权处置带来一定困难，权属登记缺乏法律效力，金融机构债权难以得到保护。
再次，健全配套机制，提高抵押融资率。一是建立农地价值评估专业机构。制定农地经营权价值评估管理办法，引入具有权威性的专业中介机构和专业人才对农地经营权抵押价值进行准确评估，合理确定农地价值，为金融机构开展农地经营权抵押贷款创造条件。二是充分履行农地流转中心和土地仲裁委员会职能，为土地流转提供合同、法律、竞价、纠纷等服务，为农地经营权抵押贷款提供配套服务。