国家医学中心是国家卫生与健康委员会依托高水平医院设置的国家级医学中心，旨在打造医学高地，提升我国整体医疗水平。国家医学中心将在疑难危重症诊断与治疗、高层次医学人才培养、高水平基础医学研究等方面有力发挥牵头作用。
国家卫健委于2017年开始启动国家医学中心和国家区域医疗中心规划设置工作，截至目前，已在全国设置十个国家医学中心。
我国建立10大国家级医学中心，9家在北京
我国目前设置的十个国家医学中心：国家心血管病中心、国家癌症中心、国家老年医学中心、国家儿童医学中心、国家创伤医学中心、国家呼吸医学中心、国家重大公共卫生事件医学中心、国家口腔医学中心、国家神经疾病医学中心、国家传染病医学中心。
国家医学中心设置依托医院名单
国家心血管病中心：
中国医学科学院阜外心血管病医院（北京市西城区北礼士路167号）
国家癌症中心：
中国医学科学院肿瘤医院（北京市朝阳区潘家园南里17号）
中国医学科学院肿瘤医院（国家癌症中心）
国家老年医学中心：
北京医院（北京市东城区东单大华路1号）
北京医院（国家老年医学中心）
国家儿童医学中心：
首都医科大学附属北京儿童医院（北京市西城区复兴门外二环路西侧）、
上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心（上海市浦东区东方路1678号）、
复旦大学附属儿科医院（上海市闵行区万源路399号、徐汇区医学院路130号）
上海交通大学附属上海儿童医学中心
（国家儿童医学中心）
国家创伤医学中心：
北京大学人民医院（北京市西城区西直门南大街11号、北京通州区漷县镇漷马路）
国家呼吸医学中心：
中日友好医院（北京市朝阳区樱花园东街2号）、
广州医科大学附属第一医院（广东省广州市沿江路151号）
国家重大公共卫生事件医学中心：
华中科技大学同济医学院附属同济医院（湖北省武汉市解放大道1095号）
国家口腔医学中心：
北京大学口腔医院（北京市海淀区中关村南大街22号）、
四川大学华西口腔医院（四川省成都市人民南路三段14号）、
上海交通大学医学院附属第九人民医院（上海市黄浦区制造局路639号）
国家神经疾病医学中心：
复旦大学附属华山医院（上海市静安区乌鲁木齐中路12号）
首都医科大学宣武医院（北京市西城区长椿街45号）
首都医科大学附属北京天坛医院（北京市丰台区南四环西路119号）
国家传染病医学中心：
首都医科大学附属北京地坛医院（北京市朝阳区京顺东街8号）
浙江大学医学院附属第一医院（浙江省杭州市余杭区仓前街道文一西路1367号）
中日友好医院（国家呼吸医学中心）
从名单里可以看到国家医学中心所依托的大多数是国内一流大学直属附属医院（北京医院和中日友好医院直属国家卫健委），这些医院在科研和医疗技术上实力雄厚，人才荟萃。而且，各家医院拥有在国内无出其右的特色专长，拥有一流的设备、一流的技术、一流的人才，科研学术在国内领先，蜚声海外。
统计数据：国家医学中心目前设置十个专科类别，分设在十八家医院。在国家医学中心的设置上北京和上海的顶级医院占据大多数席位，这些医院在国内拥有很高的知名度。其中，北京设置有九个类别的国家医学中心，分设在十家医院。上海设置有四个类别，分设在四家医院。上海复旦大学附属华山医院设置有“神经疾病”和“传染病”两大国家医学中心，目前为止是唯一的存在。此外，广东、浙江、四川、湖北四个省的省会城市都设置有一个类别的国家医学中心。
按照国家卫健委发布的消息，除了设置国家医学中心，还会在全国六大区域（华北、东北、华东、中南、西南、西北）设置一定数量的专科类国家区域医疗中心，所有省份分别设置一家综合类国家区域医疗中心。