一、①实验前准备,每天早上到实验室后,先把超净工作台的紫外灯打
开15-20分钟。②超净台前做实验,需佩戴干净的橡胶手套/一次性薄膜手套,rna抽提
需带口罩。③取ep管/枪头时需用镊子,不可以用使用过的手套直接取用。取完ep管/枪头
后,袋子及时封好。④橡胶手套须放入超净台照射紫外,实验操作过程中不得带出超净台,
移液器在一天工作结束后调至最大量程,并用75%乙醇清洁移液器,枪头盒及超净台面。⑤
实验进行的过程中或观看实验时,没有带口罩不要在超净台前讲话。二、总rna抽提
1)细胞培养皿中细胞样品用1*pbs洗两次后,用1ml枪将pbs吸干净,加入1mltrizol
(invitrogen)溶液,吹打混匀,并吸至1.5mlrnasefreeep管中使细胞充分裂解,室温
静置5min;
组织样品用液氮充分研磨,加入1mltrizol(invitrogen)溶液,混匀,室温放置5min
使其充分裂解;(管盖与管壁都需标记样品名称)2)加入200μl氯仿,剧烈振荡混匀30s,
使水相和有机相充分接触,室温
静置3-5min;(离心时离心管按顺序排放,离心完毕,离心管的顺序也按顺序排好,与
第一步的顺序一致)
3)4℃下,14,000g离心15min,可见分为三层,rna在上层水相,移至另一个新的rnase
freeep管;(用20-200ul的枪吸取上清,吸上清时,枪头应沿着液面上层吸取上清,枪头
不可碰到、吸到中间层)4)沉淀rna:加入等体积异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒6-8应
用振荡器混匀),室温静置10min;
5)4℃下,14,000g离心10min,收集rna底部有沉淀,应将ep管放置在-80度冰箱过
夜,继续在4℃下,14,000g离心10min,收集rna沉淀),去上清;
6)用75%乙醇洗涤两次(12,000g离心5min倒ep管即可,不用振荡器震荡或枪头吸打
沉淀),超净台风干;沉淀不
能过干或过湿,过干则不易溶解,过湿则乙醇残留。7)视沉淀量加入适量depc水(至
少15ul)溶解沉淀。三、去基因组
使用rnase-free的dnase(promega),按以下体系配置反应液,37℃消化30min,65℃
灭活10min。
rnadnase10xbufferh2o(rnasefree)rnasin总
体积
然后按以下步骤操作:
1)加入等体积的苯酚/氯仿,上下颠倒混匀,室温放置5min,后14,000rpm,
离心15min,取上清。
2)加入等体积的氯仿,上下颠倒混匀,静置分层后14,000rpm,离心15min,
取上清。
3)加入等体积异丙醇,轻柔地充分混匀(颠倒6-8次),-20℃静置15min;4)4℃下,
14,000g离心15min,收集rna沉淀,去上清;5)用75%乙醇洗涤两次(12,000g离心5min),
超净台风干;6)加入适量depc水(至少15ul)溶解沉淀。
四、总rna纯度和完整性检测
1)纯度检测:取1μlrna样品50倍稀释,在核酸蛋白检测仪上测定od值,od260/od280