12月18日外媒科学网站摘要:阅读如何重塑大脑毒素细胞植物血液动物癌细胞

12月18日(星期三)消息,国外知名科学网站的主要内容如下:

《自然》网站(www.nature.com)

研究人员表示,Casgevy对患者的整体健康,包括身体、情感、社交和功能健康等方面,都带来了明显的改善。他补充道,这种疗法具备“一次性功能性治愈”的潜力。

β-地中海贫血和镰状细胞病均源于血红蛋白基因突变。虽然胎儿血红蛋白可以缓解这些突变的影响,但其产生通常在出生后不久便停止。Casgevy利用CRISPR-Cas9基因编辑技术,通过禁用基因“开关”,使胎儿血红蛋白重新产生,从而缓解疾病。

《科学通讯》网站(www.sciencenews.org)

研究团队以棋盘花为目标植物,这种植物广泛生长于美国西部地区,是百合的近亲。吃了足够多的这种植物的牲畜会受到两种化合物的毒性作用,即棋盘花辛(zygacine)和棋盘花碱(zygadenine)。研究人员向羊注射了适量棋盘花提取物,并从第三天开始定期采集耳垢样本,持续一个月。此外,他们还从在满是棋盘花的牧场上放牧三天的羊身上采集了样本。

结果显示,来自不同有毒植物的毒素可以出现在动物的耳垢中。这为牧场主提供了一种新的工具,通过分析耳垢快速识别有毒植物,甚至精确定位到特定牧场区域,从而更好地保护牲畜安全。

《每日科学》网站(www.sciencedaily.com)

1、新型血液检测方法可快速评估纳米药物治疗效果

澳大利亚皇家墨尔本理工大学(RMITUniversity)与多尔蒂研究所(DohertyInstitute)的科学家开发了一种新型血液检测技术,旨在帮助筛选癌症患者,从而使治疗更加安全和高效。

这种测试仅需从白血病患者身上提取一滴血,就能快速评估不同聚乙二醇(PEG)纳米药物在杀死癌细胞和减少副作用方面的效果。

在研究中,研究人员从15名白血病患者的血液中测试了三种不同的PEG纳米药物。他们将这些纳米药物分别添加到血液样本中,并在37摄氏度下孵育一小时,随后评估这些药物对血液中癌细胞和健康细胞的作用效果。通过这种方式,他们可以确定哪种疗法最适合不同患者。

研究还探讨了患者免疫系统的差异如何影响纳米药物疗效。他们发现,患者血液中抗PEG抗体的水平会显著影响治疗效果:抗体水平越高,药物杀死癌细胞的效果越差,且对健康细胞的毒性越大。

这一研究成果发表在纳米科技领域权威期刊《ACSNano》上。

2、科学家现在可预测气候变化如何影响植物生长周期

天气模式决定了季节的开始与结束,但植物和动物对这些模式的响应,即物候学,同样至关重要。尽管气象学家可以提前几个月准确预测气温,但预测某种树木在其分布范围内何时开始长出叶子,通常更具挑战性。

当气候变化等复杂因素介入时,预测植物物候变得更加困难。

这项突破性研究源于一份19世纪的旧报告,该报告包含了美国东部数千份动植物物候观察记录。这些记录由美国史密森学会(SmithsonianInstitution)发起,通过志愿者收集,成为美国最早的公民科学项目之一,用于监测生物季节性变化。

1、阅读如何重塑大脑并提高认知能力

如今,为了娱乐而阅读的人越来越少。据调查,50%的英国成年人表示他们不经常阅读,而这一比例在2015年为42%。在16至24岁的年轻人中,近四分之一的人表示从未定期阅读。

这对我们的大脑有何影响?从文字到视频的转变是否改变了大脑的功能,甚至影响了人类的进化?瑞典隆德大学(LundUniversity)发表在《神经影像》(Neuroimage)杂志上的一项新研究对此进行了探讨。

通过分析1000多名参与者的开源数据,研究人员发现,不同阅读能力的人大脑结构存在差异。具体而言,熟练读者的大脑左半球两个关键区域在语言处理方面表现出独特特征。

其中一个区域是颞叶的前部,负责帮助联想和分类不同类型的有意义信息。另一个是颞横回(Heschl’sgyrus),位于颞叶上部,是听觉皮层的所在地。研究显示,阅读能力较强的人,其左半球颞叶前部的体积通常比右半球更大。

2、研究人员证实控制金属薄膜热流关键原理,助力计算机芯片升级

美国弗吉尼亚大学(UVA)的研究人员成功验证了控制金属薄膜热流的关键原理,为提升计算机芯片效率取得了重要突破。这一研究发表在《自然通讯》(NatureCommunications)杂志上,为下一代高效电子设备的发展奠定了基础,使未来的芯片能够更加快速、紧凑且节能。

铜因其卓越的导电性而广泛应用于电子设备。然而,当器件尺寸缩小至纳米级时,即便是铜这样的优秀材料也面临热量增加带来的性能下降问题。这种现象在铜中尤为明显,导致导电性和效率的显著降低。

为了解决这一难题,UVA团队将研究重点放在热科学中的马西森规则上。该规则用于预测不同散射过程对电子流的影响,但在纳米级材料中一直未得到全面验证。这次研究首次在超薄铜膜中成功验证了这一规则的适用性。

研究小组采用了一种新方法——稳态热反射(SSTR),测量了铜的导热性,并将结果与电阻率数据进行对比分析。他们发现,当使用特定参数时,马西森规则能够可靠地描述纳米级铜膜中的热量传播方式。

通过结合实验测量和先进建模,研究团队为开发能够在降低能耗的同时提高效率的材料铺平了道路。在温度管理至关重要的领域,这一发现为更冷、更快、更可持续的电子技术的未来迈出了重要一步。(刘春)

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1.基因编辑技术在小鼠骨髓瘤细胞研究中的最新进展基因编辑技术在小鼠骨髓瘤细胞研究中的最新进展 在医学研究的浩瀚星空中,基因编辑技术如同一颗璀璨的星辰,引领着我们探索生命的奥秘,特别是在癌症研究领域。近年来,随着CRISPR-Cas9、TALENs和ZFN等基因编辑技术的飞速发展,科学家们得以更加精准地操作基因序列,这为小鼠骨髓瘤细胞的研究开辟了新的天地。本文将带您一https://baijiahao.baidu.com/s?id=1818563315236241524&wfr=spider&for=pc
2.CRISPR网站设计gRNA数据怎样分析呢分子生物2019-12-02 10:51:23 能否发给我一下,CRISPR网站的网址呢?谢谢!http://crispor.tefor.net/ https://muchong.com/t-13645661-1
3.刘佳课题组构建针对膜蛋白sgRNA设计的CRISPR网站CRISPR近日,上海科技大学免疫化学研究所、生命科学与技术学院刘佳课题组与免疫化学研究所生物医学大数据平台合作,通过升级sgRNA设计的算法,针对已被质谱鉴定的细胞表面蛋白基因设计sgRNA得到膜蛋白组sgRNA文库(CRISPR-Surfaceome),创建了网上数据库CRISPR-Surfaceome(https://crispr-surfaceome.siais.shanghaitech.edu.cn/home)。https://siais.shanghaitech.edu.cn/2022/0815/c5404a767972/page.htm
4.CRISPR1. 目的基因sgRNA设计 ” 目前设计sgRNA的网站比较多,张锋老师实验组总结了sgRNA设计工具如:https://zlab.bio/guide-design-resources,其中synthego(https://www.synthego.com/products/bioinformatics/crispr-design-tool)是小编比较喜欢用的设计工具。不过该网站只能设计人、果蝇和小鼠基因的sgRNA。以人的基因TP53为例http://www.dentalearner.com/archives/3855
5.CRISPRA Fast and Comprehensive Guide RNA Design Tool for Genome Editing, Repression and Activation (CRISPR-ERA) Here we describe a web tool called CRISPR-ERA for automated genome wide sgRNA design. CRISPR-ERA can provide different sgRNA searching approaches for genome editing, such as Cas9 nuclease. Inhttp://crispr-era.stanford.edu/
6.CRISPRCasgRNA设计到底该选哪个工具既有这么多种基因编辑器,那gRNA的设计工具更是眼花缭乱,最近感觉CRISPR技术的更新、进化速度远远大于我们学习的速度。 2. 常用的gRNA设计网站 一般来说,会先打开张峰课题组的网站https://zlab.bio/guide-design-resources,并在下方的“TOOLS FOR GUIDE DESIGN”随意选择一个gRNA设计工具(一般选用CRISPOR)。然而真的是https://www.jianshu.com/p/0b56e1d6203f
7.CRISPRCAS蛋白的gRNA序列的设计流程8. 根据网站设计不同的gRNA,选取合适和评分最高的gRNA即可出。 9. 最后在设计好的gRNA序列的5'端点引入酶切位点,合成单链的正反向序列,酶切链接到建好表达载体上, 载体有相同酶切位点。 相关阅读 逆转录PCR/RT-PCR的原理、实验步骤和参数设置 Magigen CRISPR Cas12蛋白家族? https://www.magigen.com/cn/h-nd-674.html
8.CRISPR/Cas9基因敲入试验步骤(二)sgRNA的设计及退火因此,我强烈推荐基于重组整合方法设计的CRISPR载体,使用难度低,可靠性强,而且成本上也不会增加。其实验步骤分三步:1、使用XbaI、EcoI等其他稳定可靠的内切酶酶切载体,回收载体;2、使用PCR将靶点做到特定片段上,回收片段;3,重组整合反应,转化即可。 2017-01-29· IP浙江 回复 lixwei20121 请问: BbsI 是不是用于https://3g.dxy.cn/bbs/topic/38427515
9.sgRNAs&基因编辑sgrna设计网站设计成对 sgRNA 序列 打开网站 http://crispr.mit.edu,将基因名称,邮箱,第二外显子序列输入到对话框,点击 Agree and submit,等待网站设计成对的 sgRNA 序列。一般推荐网站设计,因为网站可以预测脱靶位点数,避免基因脱靶产生。当然也可以手动选择特异的 sgRNA 序列。 https://blog.csdn.net/geekfocus/article/details/128613082
10.科学网—基因编辑CRISPRLocal:无参本地设计sgRNACRISPR-Local 相比于其它设计 sgRNA 的工具的优点在于:一、适用于无参考基因组的品系;二、可以筛选同时靶向于多基因的 sgRNA;三、比较节约计算资源;四、可以离线运行,既有命令行界面也有图形界面,也能以多种格式输出数据用于进一步的批量分析或可视化。目前,CRISPR-Local 已应用于 71 个植物基因组,既支持 CRISPR/https://wap.sciencenet.cn/blog-656335-1151550.html
11.会议日程基于CRISPR/Cas12a系统的动物源性食品真实性捡测研究 陕西科技大学教授李国梁 12:10 基于UPLC-Q TOF MS技术的94种典型中国小麦的地理区分及霉变小麦真实性清洁卓越 - 卫生设计与清洁对食品安全文化的影响 英特乐传送带(上海)有限公司高级食品安全专家贾永生 10:00 质量文化建设 玛氏箭牌糖果(中国)有限公司 供应商http://www.chinafoodsafety.com/conference23_c.htm
12.盘点:2022年CRISPR/Cas研究进展精华专区他们发现Cas7-11通过使用Cas7.1结构域将它的前体CRISPR RNA(pre-crRNA)加工成crRNA,而且在crRNA的指导下,它还使用Cas7.2和Cas7.3结构域在两个确定的位点上切割靶RNA。该结构还揭示了Cas7-11的一个组成部分没有任何明显的功能作用。这一发现表明他们员可以将这个组成部分移除,重新设计Cas7-11,使它变得更小,而不影https://news.bioon.com/article/cd9fe52187b1.html
13.华人科学家团队推出CRISPRPrimeEditing系pegRNA设计的全自动算法美国耶鲁大学陈斯迪团队推出CRISPR Prime Editing系统pegRNA设计的全自动算法,研究成果于2020年9月28日在《自然生物医学工程》上在线发表。此算法可以根据基因组目标位点和定点编辑的突变自动设计出多个pegRNA,并且提供优先级排列。研究人员以此算法为核心创建了一个简单、快速设计pegRNA的网站pegFinder。该网站可以帮助研究人员http://www.moa.gov.cn/gbzwfwqjd/zjyqwgz/202011/t20201110_6356030.htm
14.世界首个完全由AI设计的CRISPR基因编辑器来了!医药新闻CRISPR基因编辑技术是21世纪最受关注的生命科学突破之一。去年,首款基于CRISPR的基因编辑疗法获批上市,标志着遗传疾病治疗的新纪元。与此同时,人工智能的进步也为设计更强大的基因编辑器带来了希望。 2024年4月22日,AI蛋白质设计公司 Profluent在预印本平台bioRxiv上发表了题为:Design of highly functional genome edithttps://bydrug.pharmcube.com/news/detail/caaf4f23c9805c777a3c7947e7f137f4
15.小干扰RNA(siRNA)设计与合成基因编辑(CRISPR/Cas9),AAV/LV/ADVGene activation via saRNA , design and experimental Validation of saRNAs, CRISPR/Cas9,AAV/LV/ADVhttp://www.mixsungen.com/
16.诺奖的背后:基因编辑发展史上的幕后英雄和未来发展,是魔剪还是设计CRISPR John van der Oost于1989年在阿姆斯特丹自由大学(Free University of Amsterdam)获得博士学位,他最初志在解决世界清洁能源的需求而研究如何利用蓝藻来生产生物燃料。在返回阿姆斯特丹之前,他相继在赫尔辛基和海德堡研究细菌的代谢途径。1995年,瓦赫宁根大学(Wageningen University)向他发出终身教职的聘任邀请,但是https://general.medsci.cn/article/show_article.do?id=eedd201816de
17.GeneiousPrime2022破解版GeneiousPrime2023.1w在一个界面中执行各种克隆和引物设计操作。自动注释质粒图谱和表达载体。模拟各种分子克隆操作,包括限制性克隆,Gibson组装,Gateway克隆和TOPO克隆。设计和测试引物,找到CRISPR位点,并优化密码子。 3、数据管理 只需拖放即可以通用文件格式(包括Genbank,SnapGene,FASTQ,FASTA,BAM,VCF,GFF)导入,导出和转换序列,注释和注释,http://www.sd173.com/soft/9265.html
18.(1)引物设计:利用在线网站Design CRISPR guides with off-target and efficiency predictions, for more than 100 genomes.http://crispor.tefor.net/
19.reliabilityforfunctionalgenomicsRNAiandCRISPRThe Dharmacon Reagents portfolio encompass the broadest range of quality molecular biology tools for reliable and accurate gene function manipulation supporting gene-modulation (RNAi, (siRNA / shRNA / miRNA), CRISPR modulation, (CRISPRa / CRISPRi) and gehttps://www.dharmacon.com/
20.纳米人miRNA是目前临床诊断多种疾病的生物标志物,它的失调也与多种不同的疾病有关,如癌症、痴呆和心血管疾病等。而实现有效治疗的关键就是在早期对疾病进行准确诊断以提高患者的生存希望。德国弗莱堡大学Can Dincer团队设计了一种CRISPR/ Cas13a驱动的微流体,并将其集成到电化学生物传感器中进而用于检测miRNA。 http://www.nanoer.net/phone/showinfo-4-13342.html
21.Nature综述:国内顶尖课题组都在用,科研成果取得大的突破!CRISPR-Cas9基因编辑技术 第一天 基因编辑简介 1.基因编辑基本概念介绍 2.单基因遗传病数据库 (实操) 3.基因编辑历史 4.TALEN 5.Zinc finger 6.Base editor 7.Prime editor 第二天 1.如何选择正确Cas9蛋白类型 2.gRNA设计和软件(实操) 3.sgRNA修饰 https://www.biodiscover.com/reaseach/742102.html
22.想筛就筛,CRISPR文库一站式服务低至2.4w,立省2w!CRISPR文库能够在全基因组范围内进行筛选,可以高效地研究基因功能以及发现靶点。然而,CRISPR文库筛选整个工作流程涉及多个步骤与实验,对于新手小白来说,无疑是个巨大的挑战。 源井CRISPR-iScreen?一站式筛选服务¥2.4w起,最高立省2w+;还有400+文库https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU3MTE3MjUyOA==&mid=2247673607&idx=2&sn=cd6115639a78cbc3e3b668999f0f5010&chksm=fd9c5f6e5c10b141d5fa7b8d9cc9fd6fc8ef6418ee733a86213ea3c4b0b578606854f2cd3699&scene=27