隽立然

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2003.9-2007.7哈尔滨工业大学计算机科学与技术专业本科

2007.9-2009.7哈尔滨工业大学计算机科学与技术专业硕士

2009.9-2015.3哈尔滨工业大学计算机科学与技术专业博士

工作经历:

2015.5-2020.12哈尔滨工业大学生命科学与技术学院讲师

2020.12-至今哈尔滨工业大学生命科学与技术学院副教授

PersonalProfile

EDUCATION:

B.Eng.HarbinInstituteofTechnology,Harbin,China,ComputerScienceandTechnology,2003-2007

M.Eng.HarbinInstituteofTechnology,Harbin,China,ComputerScienceandTechnology,2007-2009

Ph.D.HarbinInstituteofTechnology,Harbin,China,ComputerScienceandTechnology,2009-2015

ACADEMICAPPOINTMENTS:

Lecturer,HarbinInstituteofTechnology,Harbin,China,BiomedicalEngineering,2015-2020

AssociateProfessor,HarbinInstituteofTechnology,Harbin,China,BiomedicalEngineering,2020-present

研究方向和领域

生物信息学

Bioinformatics

研究内容

主要研究方向为基因组大数据分析方法与软件，包括三方面内容：

1.基因组学机器学习，研究机器学习算法在基因组学问题上的应用与改进；

2.基因组注释与可视化，研究对容量庞大、格式多样、关系复杂的基因组大数据进行注释及可视化方法与软件；

3.多组学数据分析，运用统计、计算方法，分析多组学数据、解决生物学问题。

ResearchInterests

Themajorresearchareaismethodsandsoftwareofgenomebigdataanalysis,including3topics:

1.Machinelearningingenomics:Improvementandapplicationofmachinelearningalgorithmforgenomics.

2.Genomeannotationandvisualization:Annotationandvisualizationmethods/softwareforgenomebigdatawithmassvolume,variousformatsandcomplexrelationship.

3.Multi-omicsdataanalysis,Analyzingmulti-omicsdatabycomputationalandstatisticalmethods,solvingbiologicalproblem.

研究成果

代表性论文

1.Juan,L.*,Wang,Y.,Jiang,J.,Yang,Q.,Wang,G.,andWang,Y.*(2020).EvaluatingIndividualGenomeSimilaritywithaTopicModel.Bioinformatics.（SCI检索）

2.Juan,L.*,Wang,Y.,Jiang,J.,Yang,Q.,Jiang,Q.,andWang,Y.*(2020).PGsim:AComprehensiveandHighlyCustomizablePersonalGenomeSimulator.FrontBioengBiotechnol8,28.（SCI检索）

3.Juan,L.,Liu,Y.,Wang,Y.,Teng,M.,Zang,T.,andWang,Y.(2015).Familygenomebrowser:visualizinggenomeswithpedigreeinformation.Bioinformatics31,2262-2268.（SCI检索）

4.Juan,L.,Teng,M.,Zang,T.,Hao,Y.,Wang,Z.,Yan,C.,Liu,Y.,Li,J.,Zhang,T.,andWang,Y.(2014).Thepersonalgenomebrowser:visualizingfunctionsofgeneticvariants.NucleicAcidsRes42,W192-197.（SCI检索）

5.Juan,L.,Wang,G.,Radovich,M.,Schneider,B.P.,Clare,S.E.,Wang,Y.,andLiu,Y.(2013).PotentialrolesofmicroRNAsinregulatinglongintergenicnoncodingRNAs.BMCMedicalGenomics6Suppl1,S7.（SCI检索）

THE END

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1.机器学习在生物学研究中的应用在这篇文章中,我们将讨论机器学习在生物学研究中的应用,包括背景介绍、核心概念与联系、核心算法原理和具体操作步骤以及数学模型公式详细讲解、具体代码实例和详细解释说明、未来发展趋势与挑战以及附录常见问题与解答。 2.核心概念与联系 在生物学研究中,机器学习主要用于处理和分析大量生物数据,以揭示生物过程和系统的复https://blog.csdn.net/universsky2015/article/details/135803924
2.机器学习方法及其在生物信息学领域中的应用数据量之大,研究之深入,以及基因组数据本身的复杂性之高,对理论、算法和软件的发展都提出了迫切的需求。而机器学习方法例如遗传算法和决策树等正适合于处理这种数据量大、含有噪声并且缺乏统一理论的领域。 本文对机器学习方法及其在生物信息学中的应用进行了一定的研究,主要工作有以下四个方面: 1.提出一种基于变https://wap.cnki.net/touch/web/Dissertation/Article/2009093438.nh.html
3.机器学习与生物信息比如生物信息学里面的:回归分析、随机森林、支持向量机等算法,都是比较成熟的应用了。在最近阅读文献得过程中,小编发现了一篇材料学科的文献,文中用到的XGBoost算法与小编之前钻研过的两篇生信文章的算法十分相似,那么今天就给大家剖析一下当生物信息遇见机器学习,会有什么火花,https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzA5NjU5NjQ4MA==&mid=2651200369&idx=1&sn=5038992effb9b1e911f4543fb08b8f26&chksm=8b5f1c1ebc2895085c4799d1c73c76ef81a942b8e8b8959e8f2e4efe6f8c38e4b76c549d00af&scene=27
4.EMBOReports生物学中的人工智能革命:AlphaFold的优势和劣势应该继续投资于实验结构生物学所需的关键基础设施和实验结构测定所需的研究。从基于人工智能的聊天机器人、虚拟助手，到自动驾驶汽车、“智能”机器人吸尘器和割草机，人工智能的用例很多。蛋白质折叠示例使我们了解如何从人工智能模型中获益，同时又不会对其产生过度依赖。归根结底，深度学习算法的发展与人类学习没有什么http://baijiahao.baidu.com/s?id=1714702231346588290&wfr=spider&for=pc
5.转:2024年展望:未来十大最吃香最具前景专业分析1.1 深度学习算法研究 神经网络架构优化:开发更高效、更强大的神经网络模型。 迁移学习:研究如何将一个领域的学习成果应用到另一个相关领域。 强化学习:探索AI如何通过与环境互动来学习最优策略。 联邦学习:研究如何在保护数据隐私的同时进行分布式机器学习。 https://maimai.cn/article/detail?fid=1851243312&efid=XSQx0hfK7u4CsISU06jfRw
6.[机器学习理论&实践]机器学习在生物信息学中的探索机器学习是我一直深入研究和应用的领域,其在生物信息学中的应用尤为引人注目。通过让计算机从数据中学习模式,机器学习为处理生物信息学中的复杂问题提供了新的思路。我理解监督学习、无监督学习和强化学习等方法的区别和适用场景,这些方法在生物信息学中有着广泛的应用。 https://cloud.tencent.com/developer/article/2373063
7.机器学习在肉类微生物安全中的应用研究进展机器学习方法可以从海量、复杂的数据中提取关键信息,学习数据集中各变量间的隐藏关系,现已逐渐成为食品安全领域数据密集型分析任务的强有力工具。 本文通过归纳近年来国内外相关研究,总结了机器学习方法在肉品中有害微生物的检测和预测建模中所起到的关键作用,分析了该法在实际应用时的不足之处,并展望了该法在肉类https://www.rlyj.net.cn/fileup/HTML/2022-36-11-006.shtml
8.机器学习如何大展手脚,更有效地协助医药研发澎湃号·湃客在本小节中,我们选取了几个应用机器学习算法的药物研发领域进行介绍。 1、化合物活性预测 包括人工神经网络在内的机器学习方法在药物研发的化合物活性预测中应用已久。具体来说,化合物的活性直接反映在它的分子描述符(molecular descriptors),因此可以使用 DNN 进行建模来预测活性。Dahl 等在 Merck-Kaggle challenge 数https://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_7086146
9.遗传算法:仿生学在AI技术中的应用遗传算法是一种基于自然界进化原理的优化方法,它借鉴了生物进化的机制,通过模拟基因的交叉、变异和适应度选择等过程,来搜索问题的最优解。在人工智能领域,遗传算法被广泛应用于解决复杂的优化问题,如参数优化、路径规划、机器学习模型的选择等。本文将介绍遗传算法的原理、应用以及未来的发展方向,深入探讨仿生学在AI技术http://www.360doc.com/content/23/1019/10/78851418_1100749756.shtml
10.[论文总结]深度学习技术在植物领域的研究251CTO博客11.3 机器学习 11.4 结论和未来的工作 1. A Review on Deep Learning for Plant Species Classification using Leaf Vein (IF=15.2,2020) 许多的深度学习技术应用于植物叶子识别。大部分的研究工作是基于CNN、GLCM、朴素贝叶斯分类器、RBF神经网络、PNN、MLP和zernike矩实现。 https://blog.51cto.com/luohenyueji/5950083
11.机器学习算法在自动驾驶领域的应用大盘点!雷峰网根据这些奖励,智能体学习做出恰当行为。去理解算法的局限性和优点,开发更加高效的学习算法,是增强学习的目标。增强学习可以解决大量实际应用,从AI的问题到控制工程或操作研究——所有这些都与开发自动驾驶汽车相关。这可以被分为间接学习和直接学习。 在独自动驾驶汽车上,机器学习算法的一个主要任务是持续渲染周围的环境https://www.leiphone.com/category/yanxishe/58ypBb14z4wnIV4Q.html
12.第一轮通知第十一届国际分子模拟与人工智能应用学术会议(2023过去20年,以计算化学、计算生物学、生物信息学为代表的分子模拟技术已经在生命科学和材料科学领域取得广泛的应用效果,成为包括化学化工、材料科学和生命科学等领域认识和解决复杂科学和工程问题的重要方法之一。 过去5年,以机器学习为代表的人工智能技术已经成为新一轮产业变革的核心驱动力,正在对世界经济、社会进步和人类https://www.neotrident.com/news/details/1057.html
13.AIforScience:站在科研范式的转折点上GPT目前仍是会出错的猜测机器,用来辅助科学研究靠谱吗? 什么是AI4S,为什么是现在? 科研全流程主要分几步,AI如何被嵌入其中? 为什么说AI4S已经驱动AI制药进入2.0时代了?AI制药1.0时代和2.0时代有什么不同? AI4S的应用前景如何?以化学、生物、材料等领域为例。 https://www.iyiou.com/analysis/202411161082866
14.内蒙古自治区科学技术厅面向人工智能、大数据领域的快速发展与化学化工学科交叉融合的重大需求,重点研究化学和化工关键基础数据库的构建及机器学习算法的建立与优化,人工智能在功能分子设计、化学反应与测量、系统工程等领域的应用,为功能分子设计与合成、材料结构的快速鉴定、化学反应预测、化工过程优化以及人口健康相关领域,提供完备的基础分子和材http://kjt.nmg.gov.cn/kjdt/mtjj/202211/t20221116_2173883.html
15.机器学习与多模态数据分析在生物学研究中的最新应用–技术进步:随着计算能力的提升和算法的改进,机器学习模型将能够处理更大规模和更复杂的数据集。 –应用领域扩展:机器学习和多模态数据分析将不仅限于疾病研究,还可能扩展到生态学、进化生物学等领域。 –个性化医疗:通过分析个体的生物数据,未来的研究可能推动个性化医疗的发展,为患者提供更为精准的治疗方案。 http://www.forwardpathway.com/111209
16.科学基金“十四五”发展规划全文附完整115个优先发展领域面向人工智能、大数据领域的快速发展与化学化工学科交叉融合的重大需求,重点研究化学和化工关键基础数据库的构建及机器学习算法的建立与优化,人工智能在功能分子设计、化学反应与测量、以及系统工程等领域的应用,为功能分子设计与合成、材料结构的快速鉴定、化学反应预测、化工过程优化以及人口健康相关领域,提供完备的基础分子http://www.ecorr.org.cn/news/industry/2024-05-27/190913.html
17.科学家如何利用机器学习技术来改善人类降研究?专区生物标志物 癌基因 癌症 机器学习是一门多领域的交叉学科,主要包括概率论、统计学、逼近论、凸分析、算法复杂度理论等多门学科,近年来,科学家们不断将机器学习技术应用到改善人类健康和疾病等研究领域中,本文中,小编就整理了多篇研究报告,共同解读科学家如何利用机器学习技术来改善人类的健康。分享给大家!【1】Scienchttps://www.bioon.com/article/6792381.html
18.神经网络自编码器算法在癌症信息学研究中的应用2 自编码器在癌症信息学中的应用传统的机器学习算法对输入特征的依赖性很高,特征提取的优劣会直接影响机器学习算法的预测或分类性能。因此,面对复杂多样的生物数据,选用合适的特征提取算法来帮助研究者得到最优的输入特征至关重要。如表2所示,这一部分将结合前人的研究介绍各种自编码器如何应用于组学数据、生物医学图像http://school.freekaoyan.com/bj/wswyjs/2021/12-26/16405242061503379.shtml
19.ICESJMARSCI新型AI算法提升海洋浮游生物图像机器识别性能北京时间11月10日,中国科学院深圳先进技术研究院集成所光电工程技术中心李剑平博士团队在海洋数据机器学习算法研究中取得新成果,提出了一种基于对比学习的浮游生物图像识别检索框架,在解决实际海洋数据中的不均衡分布、数据漂移、开集识别问题中展现出了优异性能。 https://www.siat.ac.cn/kyjz2016/202212/t20221209_6571703.html