众所周知，伊斯兰教教派林立，中东地区教派冲突不断，那么中国的穆斯林都是来自哪些教派？各个教派的发展历史又是如何？
我们今天来梳理一下。
伊斯兰教分为两大教派即逊尼派和什叶派，全世界约85%－91%的穆斯林隶属于逊尼派；什叶派约占10%－15%的穆斯林人口，主要集中于伊朗、巴基斯坦、伊拉克与印度四个国家。
与世界的总体情况类似，中国绝大多数的穆斯林属于逊尼派。只有聚居在塔什库尔干的塔吉克族信奉什叶派中的伊斯玛仪派，又称七伊玛目派。我国的塔吉克族属于高原塔吉克人，是新疆南部操东伊朗语部族的后裔。他们信奉的宗教仪式简单，一般不设立清真寺，多分散进行宗教活动，不举行五时拜功，只进行晨礼和昏礼，不专门封斋或朝觐麦加，塔吉克族也是新疆各少数民族中世俗化程度最高的民族。
此外，柯尔克孜族早在10世纪中叶就开始信奉伊斯兰教什叶派；新疆莎车地区部分的维吾尔族信奉什叶派中的十二伊玛目派（什叶派中最大派系）。
中国的穆斯林中逊尼派是主流，他们大多数源于伊斯兰教逊尼派四大教法学派之一的哈乃斐学派。
所谓教法学派就是伊斯兰教的法学，因为单靠《古兰经》无法给出日常生活与宗教行动中遇到的复杂情况的答案，因此从8世纪开始伊斯兰教法（沙里亚法）与一系列补充解释教法的学派建立起来，其中最著名的是哈乃斐派、马立克派、沙斐仪派和罕百里派四大教法学派。
对中国影响最大的哈乃斐派由阿布·哈尼法（699-767）创立，最初流行于伊拉克的库法附近，注重类比推理而不拘泥于教条，是较为灵活宽容的一派。
在中国传播最广、人数最多的是格底目教派，它是中国最早的伊斯兰教派，“格底目”在阿拉伯语中意为“古老”，因此该派也被称为“老教”。
回、东乡、撒拉、保安等民族都信奉该宗派。格底目保守、温和，既反对标新立异，又不干涉其他教派和门宦的事务。恪守伊斯兰教的基本信仰和各项功课，如“念、礼、斋、课、朝”五功，注重传统和习俗。由于长期受到汉文化影响，教派的中国文化特色明显，如葬礼时要穿白鞋、扎白带、戴白帽，过“头七”、“三七”、“百天”、“周年”等等。
格底目在教权上实行教坊制度，往往一个教坊以一个清真寺为中心形成独立的宗教团体，教坊之间互不隶属。中国最早的伊斯兰教宗教教育——经堂教育就是由该派的胡登洲（1522-1597）开设的，它对伊斯兰教的传播作用巨大。
事实上，伊斯兰教从唐代传入直到明代都没有发生教派分裂。直到明末清初，苏菲主义传入后，出现苏菲主义派别，而那些仍然坚持原有教义的派别则被称为格底目，因此该教派名称直至18世纪才出现。
早在10世纪，伊斯兰教中神秘主义色彩浓厚的苏菲主义就传入中国；明末清初时，分别在内地与新疆形成门宦与依禅。
所谓门宦是苏菲主义派别在回族穆斯林中的通称。在苏菲主义的影响下，一些穆斯林专注于精神修炼，建立起道堂进行用功修炼、布道说教，他们的宗教活动中心也从清真寺转向了道堂。
一些来自名门望族的宗教导师成为教主，拥有数量不等的清真寺或教坊，教徒和教主之间产生依附关系，教主逐渐被神化，他们的陵墓和拱北（教主墓上的圆顶建筑）受到教徒们的朝拜。
在甘肃、宁夏、青海等地逐步形成了40多个这样的门宦，其中最著名的是虎夫耶、库布忍耶、嘎迪忍耶和哲赫忍耶四大门宦。
四大门宦中人数最多的是哲赫忍耶，它由甘肃阶州（今武都）的回族人马明心（1719-1781）朝觐麦加后建立。它与虎夫耶的花寺门宦针锋相对，马明心提出一系列改革方案，“入其教者皆有周济，人情贪利，附之者逾众”，受到下层教众的广泛欢迎，一度被清廷称为“新教”。
但是哲赫忍耶多次参与反清暴动，乾隆年间马明心因为与花寺门宦在教理和礼仪上存在分歧，导致新老教派斗争，最终发展成声势浩大的反清起义。1781年与1783年两次起义被镇压，双方死亡近2万，史称“乾隆回暴”。
同治年间该派又领导“陕甘回变”，太平天国运动使西北防务空虚，回民伺机叛乱。从1862年至1873年，持续十年后，方被左宗棠镇压，陕甘回变造成近2000万人丧生，占当时陕甘两省人口三分之二。回变领导人之一就是哲赫忍耶第五代教主马化龙。
苏菲主义传播在新疆形成依禅教派，因其宗教领袖称为“依禅”（意为他们）而得名。依禅派由17世纪自称是穆罕默德后人的麦赫杜米·艾孜木传入新疆的喀什噶尔，随即在17世纪末获得南疆的宗教和政治统治权，南疆伊斯兰教进入全盛时期。
依禅教派重视苏菲经典与修行，主张克制、禁欲，通过神秘主义的直觉，入神、参悟，以认识安拉，达到“人主合一”。该派宗教仪式狂热，念经时配合各种动作，崇拜圣徒，朝拜圣墓。
赫杜米·艾孜木有两个儿子，长子玛木特阿敏、次子伊斯哈克都自称“和卓”（波斯语，原意“显贵者”，对“圣裔”的尊称），他们通过传教成为南疆六城的宗教领袖，但兄弟间为统治权发生争端。以玛木特阿敏为首成立白山派（教徒戴白帽），以伊斯哈克为首成立黑山派（教徒戴黑帽），彼此相争300余年，至20世纪两派才逐渐泯灭。
乾隆年间的大小和卓叛乱，即是白山派发动的。大和卓波罗尼都、小和卓霍集占两兄弟于乾隆二十年（1755）占领喀什噶尔、叶尔羌等地，二十二年（1757）杀清军副都统阿敏道，拥兵自立。次年乾隆发兵讨伐大小和卓。二十四年（1759）大小和卓兵败西逃，天山南路重新纳入中国版图，清代中国统一战争结束，清朝疆域臻于极盛。
到了清末民初，中国的伊斯兰教又有了极大的发展，那就是伊赫瓦尼派和西道堂的出现。
伊赫瓦尼，阿拉伯语意为“兄弟”，是一个非常年轻的教派，被称为“新派”、“遵经派”、“新行派”等。它由东乡族人马万福（1859－1937或1853-1934）创立，他是东乡县果园村人，被人称为“马果园”。
从十八世纪开始，阿拉伯大地上瓦哈比派迅猛兴起势不可挡。1888年马万福前往麦加朝觐、留学，学习瓦哈比派经典。1892年回国后，有感于当时的门宦和格底目的礼仪和风俗不符合经典，他就和一些著名的阿訇、哈吉们探讨瓦哈比派教义，决心改革中国的伊斯兰教，提出“凭经立教”、“遵经革俗”的主张。他提出包括：不聚众念《古兰经》，一人念众人听；不高声颂赞；不多做“都阿”（祈祷）；不朝拜拱北等十条纲领，被称为“果园十条”。
他们以改革者的姿态在甘肃临夏一带传教，因为提出以“伊赫瓦尼”来“统一教派和门宦”，受到了格底目和各个门宦的强烈抵制。马万福又到陕西、新疆等地讲学传教，1918年得到西北军阀的马麒、马步芳父子的支持开始在甘、青两省占有优势。
经过虎嵩山等阿訇的一系列改革，提出与其他教派各行其是、互不干涉的原则，伊赫瓦尼派和各门宦及格底目的关系缓和，在宁夏地区开始广泛传播。伊赫瓦尼派在教坊制度上与格底目类似，教坊间互不干涉，没有严密统一的宗教组织，清真寺也实行“董事会”制度，成员为教民推选。
要注意，该派虽然受瓦哈比派很大影响，但绝不同于瓦哈比派。一是因为产生教派的国情有差别；二是瓦哈比派遵从四大教法学派中最保守的罕百里学派，而伊赫瓦尼派依然遵奉在中国广泛传播、灵活宽容的哈乃斐学派。
西道堂同样是清末民初发展出来的新教派之一。它由甘肃临潭回族人马启西（1957-1914）创立，因为格外注重伊斯兰传播方式的本土化而被称为“汉学派”。
马启西出生于阿訇家庭，幼习经文，科举考试中了秀才，阿拉伯文与汉文造诣都很高。他本是虎夫耶支派北庄门宦门徒，1901年脱离北庄门宦成立金星堂，1909年改名为西道堂。该派既是宗教团体又是社会经济组织，倡导实业办教，分工合伙经营商、农、牧、副各业，从事生产。
在教理上，遵奉“五功”等伊斯兰教基本信条，同时以本国文化发展教理，兼容格底目和哲赫忍耶等多家礼仪风俗。教权结构类似门宦，教众对教主具有依附关系。1914年马启西被杀，马明仁继任教主，经过不懈努力逐步发展壮大。但1946年马明仁死后，道堂上层收敛财物，下层则陷入贫困，西道堂就此走向衰落。
虽然中国分化出这么多教派，但他们之间的宗教分歧并不大，大多是逊尼派，都承认四大哈里发为正统，都遵从哈乃斐派教法，它们也都多少受到什叶派的影响，大多数接受了中国传统文化，比起中东的教派来说更加世俗与灵活。