清代林之翰《四诊抉微》发展了男科脉学理论，认为“男子尺脉恒弱”“男得女脉为不足，病在内。左得之，病在左；右得之，病在右”“男得女脉者，谓尺盛而寸弱”。
吴谦等编《医宗金鉴》记述了疝病的气血寒热虚实辨证要点，认为疝病“在左边阴丸属血分”“在右边阴丸属气分”“凡寒则收引而痛甚，热则纵而痛微。凡湿则肿而重坠；而虚也重坠，但轻轻然而不重也”，同时对阴肿、疳疮等男科疾病也作了较详的论述。
温病大家叶天土论失精之病颇有见地，将失精分为梦泄、精浊、精滑、遗精，指出其治非草木血肉有情之品能愈，而是“全赖自知利害，保真为第一要”；论阴痿，认为是“心悸内怯”和“情志怫郁”致“心肾不交”所为。
郑钦安《医法圆通》认为疝病“上缩则阴盛，红肿乃热增”；对失精病则认为“神魂不藏是其本旨”“法宜封固”；更重要的是明确指出阴茎的勃起功能受心控制，即“玉茎之举，必须心火下煦”。
石寿棠《医原》在男性生理解剖方面，认为“肾藏精”是因肾与精液总管相通之故，并认识到男子精、溺两管至前阴合而为一。在养生方面，其认为必须“寡欲节劳，以养其心”再适寒温、调饮食，则精自足，此为葆精妙法，也为男子优生之要法。
许克昌《外科证治全书》论述了囊脱、阴头痈、小儿茎肿、强中等男科疾病，并认识到下疳疮的外因是由于“娼妇阴器淤浊未净，辄与交媾，致淫精邪毒，感触精宫为患”，且“最不易愈”，同时还指出其有传染性。
这一时期还值得一提的是《傅青主男科》《血证论》和《阳痿论》三书。
《傅青主男科》认识到男科疾病有其特点，须分科研究，该书便是为有别于妇科而著。此著虽题为“男科书”，但不是男科专著，不过其对男科病的论述颇有见地。如对失精证的论述分精滑梦遗、夜梦遗精、遗精健忘等，其理皆为心肾不交，其治不论何因，均从心肾着手，可谓抓住治失精之机要;另外，还对阳强、阴痿、疝气、肾子痈、偏坠等疾病进行了论述。
《血证论》中“男女异同论”篇提出了“男子主气”的论点，用逻辑推理方法论述了男女生理上的差异，认为“男子以气为主，气主阳气而上行，血随气上而成髭须。丹田为男子气血之总会,男子血入丹田从水化而为肾精。男子之精属气属水，而其中也有血有火。男子主气，气主阳而上行，血余不从下泄，而循冲任脉上绕唇周而为髭须，而生髭者乃泄血之余也”。这种认识方法虽不完全揭示男性精气与髭须的实质，但就中医对此问题的认识高度来看，无疑是一个很大的进展，对中医男科理论的补充有重要意义。
《阳痿论》二卷，是中医史上男科专病的又一部著作，但未得刊行，系清末医家韩善徵所著。卷上论总义和病机，卷下列医案和方药。该书对阳痿的病因病机论述甚为精细，对病理力主阴虚，尚有痰、暑、瘀阻等。该书不仅是记载阳痿病最早的专著，也是对阳痿病论述最要者。
清末民国初期的陆清潔编著《大众万病医药顾问》，使中医临床各科资料得到了很好的收集整理，男科资料也是如此。《大众万病医药顾问》计16种，每种论述一科疾病，男科资料主要集中在“性病科”“内科”及“妇人科”等科中，共论男科疾病如男子不育症等10余种，对每一病均从病源、症状、变证、疗法、调养、方解等诸方面详加阐述。
“性病科”除外女科病，全是男科病，在该科总论中列有用药、服药、煎药、卫生、医理“五须知”，望诊、闻声、问证、切脉“四要诀”，并在“总诀”中提出了治性病之“六要诀”，内容包括戒手淫，绝欲，以补药为主，以及阴痿、失精、早泄的体育疗法等。总之该书对男科内容的论述较前任何时候的论著均较详细，对男科学的发展做出了积极的贡献。
这一时期的医家通过大量的男科临床实践，积累了不少经验，使中医男科学的雏形得以基本形成。此外，这一时期对性传播疾病的诊治也积累了一定经验，并出现了《解围元薮》《霉疮秘录》等论著。
接下来我们讲中医男科学的成形期。成形期是指新中国成立之后。
尽管古代医家从不同侧面充实和发展了男科内容，使男科医学有所发展，但由于社会、经济、文化等方面的诸多因素和对男科疾病特点认识的不足，中医男科一直没有形成较为完整的理论体系，更无相应的系统学科专著问世。
著名中医学家秦伯未明确指出“由于男女生理上的特点，前阴症状各不相同……在病因方面，多因阳虚、气陷和肝火、湿热。一般以肾为男子的先天”。在《中医临证备要》中记述了男子乳房结核、无子等10余种疾病。
中医外科专家许履和对男科疾病尤其是前阴疾病的治疗很有创见，《许履和外科经验集》记述了睾丸血肿、子痰、阴茎痰核、阴囊血痣等近20种男性外科病。
索延昌《虚证论》一书中专立“男虚论”一章对一些男科疾病加以论述，这是建国后首次对男科疾病加以专门论述的文献。活血化瘀专家颜德馨的《活血化瘀疗法临床实践》记载用活血化瘀法治疗阴囊萎缩等男性疾病，开创了活血化瘀法在男科临床中运用的新篇章。《男性不育》从各个方面论述了男子不育症的各种问题，是新中国成立后的首部男科专病著作。
进入20世纪70年代末80年代初以后，随着国际“男性学”热潮的出现和国内经济的迅速发展、政治环境的相对宽松及社会的客观需求，中医界高度重视对男科学的研究，中医男科学的发展进人了高峰时期，中医男科学学科专著不断涌现，80年代末中医男科学作为中医临床医学的一个专门学科得以形成，其学科基本体系得以构建。