云南省林地面积4.23亿亩，森林面积3.59亿亩，森林蓄积量20.2亿立方米，位居中国第2位，森林覆盖率达62.4%，是全国平均水平的2.7倍。
云南是中国森林植被类型最丰富的区域，全境从南到北跨越8个纬度带，发育着包括雨林、季雨林的热带森林和包括季风常绿阔叶林、半湿润常绿阔叶林、暖热性针叶林、暖性针叶林的亚热带森林。随着海拔的升高，还分布着温性针叶林、寒温性针叶林、灌丛草甸和高山苔藓植被。建有森林公园57处，其中国家级32处。
热带雨林
原始森林
怒江大峡谷
千龟山风景区
独龙江峡谷
梅里雪山针阔叶混交林
草原生态系统
云南省草地面积2.29亿亩，其中可利用草原面积1.78亿亩，天然草原植被综合盖度达87.9%，是全国平均水平的1.56倍。云南是中国草原资源类型最丰富、植物种类最多的省份之一，有暖性灌草丛、热性灌草丛、山地草甸和高寒草甸4个草原类，50余个草原型，分别占全国的44.4%和31.4%；草原植物类型有4958种，占云南高等植物的35.41%，多样的草原植物让云南草原成为中国南方草原的代表。
大山包黑颈鹤国家级保护区
普达措亚高山草原
弥里塘草甸
格拉丹草原
会泽大海草山
哈巴雪山景区高山牧场
湿地生态系统
云南省湿地总面积921.69万亩，其中自然湿地面积607.98万亩，湿地保护率达52.96%。云南湿地类型复杂多样，有河流、湖泊、沼泽和人工湿地4类15型湿地，从高山亚高山沼泽化草甸到河谷漫滩湿地，集中了中国内陆淡水湿地的所有类型。大部分湿地位于世界重要水禽迁徙通道和物种过渡地带，为黑颈鹤、东方白鹳、黑鹳、中华秋沙鸭等越冬候鸟提供了重要的越冬栖息地。云南湿地野生动物、植物种类及特有种种类居全国之首。有湿地脊椎动物1006种，包括滇池金线鲃、大理裂腹鱼、中甸叶须鱼等云南特有种237种；湿地植物1619种，云南特有植物128种。建有湿地公园19处，其中国家级18处，省级1处。
高黎贡山保护区
沾益海峰湿地
大山包大海子湿地
荒漠生态系统
云南省荒漠化类型主要为水蚀荒漠化，具有面积大、分布广、沙化速度快等特点，荒漠化土地3.16万公顷，仅分布于焚风效应强烈的干热河谷地区，呈线状分布；有沙化土地面积2.94万公顷，主要是泥石流冲积形成的冲积扇，季节性河流造成的河漫滩及江河湖泊水位下降泥沙淤积形成的沙化土地。云南也是岩溶地区石漠化土地分布较为广泛的省份之一，岩溶土地总面积794.1万公顷，涉及65个县695个乡镇，石漠化土地面积235.2万公顷，建有沙漠（石漠）公园5处。