新一代CART细胞疗法,第五代CART,通用型CART治疗

新一代CAR-T细胞疗法,第五代CART,通用型CART治疗

CAR-T疗法

CAR-T(ChemericAntigenReceptorsT-cellImmunotherapy)疗法,全称嵌合抗原受体T细胞免疫疗法,其主要原理是,从癌症病人身上分离免疫T细胞,利用基因工程技术为T细胞引入一个能够识别肿瘤细胞并同时激活T细胞的嵌合抗体,然后将扩增好的CAR-T细胞回输到病人体内。

截至目前,全球共两种CAR-T产品获批上市,分别是来自诺华的Kymriah和Kite制药的Yescarta,它们分别用于治疗儿童和年轻成人的急性淋巴细胞白血病和特定类型大B细胞淋巴瘤。

CAR结构

嵌合抗原受体(CAR)是CAR-T的核心部件,赋予T细胞HLA非依赖的方式识别肿瘤抗原能力,这使得经过CAR改造的T细胞相较于天然T细胞表面受体TCR能够识别更广泛的目标。

第1-4代CAR结构如图1所示。

第一代CAR含有一个胞内信号组分,能够识别靶抗原并激活T细胞,但因为无共刺激分子,不能转导增值信号和诱导细胞因子产生,所以T细胞无法增殖而导致杀伤肿瘤效果不佳。

第二代CAR增加了一个共刺激分子或者可诱导共刺激分子,在没有外源性共刺激分子的情况下,T细胞也能持续增值并释放细胞因子。

第三代CAR包含了两个共刺激分子,提高T细胞的杀伤能力。

第四代CAR在此基础上将额外的分子原件插入到CAR中以表达功能性转基因蛋白,例如诸如白细胞介素基因的功能原件,可以提高杀伤能力,或者是调控开关、自杀基因,以提高CAR-T疗法的安全性和可控性。

通用CAR的设计原则

目前CAR-T疗法受到抗原特异性和可拓展性的限制,为了提高CAR的灵活性,希望能设计一种通用型CAR,以便能识别更多的抗原。通用型CAR使用“第三方”中间系统,拆分抗原靶向结构域和T细胞信号单位,以赋予CAR-T细胞识别多种抗原的能力,这种“第三方”中间系统有BBIRCAR和SUPRACAR。

BBIRCAR:生物素结合免疫受体

靶向生物素的免疫受体(biotin-bidingimmunereceptor,BBIR)T细胞,是将活化的生物素与抗体相结合,亲和素结合在CAR-T细胞表面,通过亲和素和生物素之间非共价作用实现T细胞的靶抗原激活。BBIR系统含有二聚体亲和素,可以有效识别和结合多种生物素化抗原特异性分子,如scFV、mAbs或肿瘤特异性配体(图2)。

SUPRACAR

为了增强CAR的灵活性和可用性,科学家发明了一种分离、通用、可编程式(split、universal、programmable,SUPRA)的CAR系统。SUPRACAR是一种双组份受体系统,通用受体是带有亮氨酸适配器的T细胞(zipCAR),另一部分是带有亮氨酸适配器的能靶向特异性抗原的scFV(zipFV)(图3)。

这种具有亮氨酸适配器的分体式SUPRACAR的临床优势有:

1、自由切换zipFV:zipFV可以针对不同的肿瘤抗原进行切换,或者通过扩增组合成针对多种肿瘤抗原的CART细胞,而无需进一步修饰T细胞。

2、能控制细胞活性和毒性:SUPRACAR系统可以通过两个亮氨酸适配器的结合强度来控制细胞的活性,从而调节T细胞活化的程度。还可以通过没有特异性抗原靶标的zipFV竞争结合通用系统上的亮氨酸适配器,减少T细胞的活化程度从而控制细胞毒性。

3、可改变信号域和效应细胞的类型:例如研究人员已经开发一种正交的SUPRACAR系统,可以独立调节不同的T细胞亚群。

通用T细胞的设计原则

生产通用CAR-T细胞的设计原则是从同种异体健康受体产生肿瘤抗原特异性T细胞,通过基因编辑的方法破坏T细胞的TCR基因和HLAⅠ类基因,消除移植物抗宿主病(GVDH)。ZFN、TALEN和CRISPR/Cas9是比较常用的基因编辑手段。

ZFN:锌指核酸酶

ZFN是一种特异性DNA核酸内切酶,针对目的基因序列设计并合成ZFN,使之对DNA进行特异性切割,从而形成DNA双链断裂区,通过非同源末端连接或借助同源重组等方式完成DNA的修复连接,从而导致靶基因表达丧失。

使用这种基因编辑技术,破坏T细胞中TCRα恒定区的表达,使TCR功能丧失,从而不能对TCR特异性刺激做出反应。使用相同的方法,破坏HLA基因(图4),研究结果显示TCR-/HLA-缺陷型的T细胞在动物模型中不引起GVDH。

TALEN:类转录激活因子效应物核酸酶

TALEN也是一种位点特异性核酸内切酶,图5是应用TALEN基因编辑技术生产通用的CD52-/TCR-T细胞,同时破坏CD52和TCRα(TRAC)基因,CD52抗原是一个抗体依赖性补体靶点,所以切除CD52基因,可以更好地避免GVDH。

CRISPR/Cas9:规律成簇的间隔短回文重复序列

由于ZFN和TALEN都需要针对不同的基因设计特定的核酸酶对,导致该技术的广泛应用受到限制。CRISPR-Cas9系统于2012年被发现,科学家们利用靶点特异性的RNA引导Cas9核酸酶带到基因组上的具体靶点,从而对特定基因位点进行切割、修饰。如图6所示,通过CRISPR方案可以一次性切除内源性TCR和HLAⅠ类基因产生同种异体的通用CAR-T细胞。与ZFN和TALEN相比,CRISPR/Cas能够极快地测试任何新提出的基因改造。

CRISPR-Cas9已被成功用于CAR-T细胞的多重基因编辑,例如两种基因(TRAC和B2M)和三种基因(TRAC、B2M和PD-1),通过敲除人PD-1基因,阻断免疫检查点的抑制信号,可以增强CAR-T细胞的体内抗肿瘤活性。

FT819,IPSCCARITcells

FateTherapeutics公司开发了一款现成的CAR-T细胞产品FT819,FT819来自健康供试者,创建一个能诱导多功能干细胞(IPSC)主细胞系,并使用主细胞系生产大量不受患者限制的“通用型”CAR19T细胞。研究人员通过将CAR引导至TCRα(TRAC)基因座,确保完全消除GVDH,除此之外,CAR19T细胞含有CD19的基因,能靶向CD19阳性肿瘤细胞是能显示出高效的细胞毒性作用。

FateTherapeutics公司下一步计划是开展人体临床实验,全面评估CARIT产品的安全性和有效性。

通用CAR-T细胞临床应用

TALEN基因编辑的TCR缺陷型CAR-T细胞处于临床试验阶段,两名患有高度复发难治性CD19+B-ALL的婴儿用通用CAR-T细胞治疗后,都得到了缓解,并成功接受了同种异体干细胞移植。

两种使用CRISPR-Cas9基因编辑的通用CAR-T细胞都启动了临床试验(NCT03166878,NCT03229876),但目前还没有详细的结果。

通用CAR-T细胞面临的挑战

通过破坏结合“第三方”中间系统的同种异体T细胞的TCR基因和HLAⅠ类基因,可以产生不引起GVDH并能广泛用于生产的通用CAR-T细胞。然而在实际应用中,仍存在一些关键性问题,例如微量TCR阳性的CAR-T细胞引起的GVDH反应、基因编辑过程存在的脱靶效应等,除此之外,还有许多问题需要进行进一步探索,例如:

1、需要更多的临床数据,以确定通用CAR-T细胞的有效性和毒性;

2、长期随访检测急性和慢性GVDH、排斥反应等副作用;

3、建立和统一CAR-T细胞疗法的临床、工业和监管标准。

总结:包括ZFN、TALEN和CRISPR-Cas9在内的基因编辑方法可以产生通用的T细胞,一种分离、通用和可编程的(SUPRA)CAR可以使CAR-T细胞灵活地针对不同的靶点,还能有效控制T细胞活性。新一代通用CAR-T细胞在临床试验中的应用,为癌症免疫治疗提供了新型的治疗手段。

参考文献:JuanjuanZhao,QuandeLin.etal.UniversalCARs,universalTcells,anduniversalCARTcells.JournalofHematology&Oncology.(2018)11:13

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10.刘佳课题组构建针对膜蛋白sgRNA设计的CRISPR网站CRISPR近日,上海科技大学免疫化学研究所、生命科学与技术学院刘佳课题组与免疫化学研究所生物医学大数据平台合作,通过升级sgRNA设计的算法,针对已被质谱鉴定的细胞表面蛋白基因设计sgRNA得到膜蛋白组sgRNA文库(CRISPR-Surfaceome),创建了网上数据库CRISPR-Surfaceome(https://crispr-surfaceome.siais.shanghaitech.edu.cn/home)。https://siais.shanghaitech.edu.cn/2022/0815/c5404a767972/page.htm
11.CRISPRCAS蛋白的gRNA序列的设计流程8. 根据网站设计不同的gRNA,选取合适和评分最高的gRNA即可出。 9. 最后在设计好的gRNA序列的5'端点引入酶切位点,合成单链的正反向序列,酶切链接到建好表达载体上, 载体有相同酶切位点。 相关阅读 逆转录PCR/RT-PCR的原理、实验步骤和参数设置 Magigen CRISPR Cas12蛋白家族? https://www.magigen.com/cn/h-nd-674.html
12.(1)引物设计:利用在线网站Design CRISPR guides with off-target and efficiency predictions, for more than 100 genomes.http://crispor.tefor.net/
13.CRISPR/Cas9载体设计与构建的作用机理CRISPR/Cas9 载体设计与构建方法1:利用试剂盒快速方便地将gRNA 靶点序列插入到Cas9/gRNA 质粒中。构建好的Cas9/gRNA质粒能够同时表达植物密码子优化的Cas9 蛋白及gRNA,应用CRISPR 技术进行目标基因的敲除和编辑。 CRISPR/Cas9 载体设计与构建方法2:根据NtDXR 基因序列,利用在线工具ZiFiT Targeter Version4.2:选择合适的https://www.chemicalbook.com/NewsInfo_5909.htm
14.世界首个完全由AI设计的CRISPR基因编辑器来了CRISPR基因编辑是公认的21世纪以来最受关注、最具突破性的生命科学突破,自2012年正式诞生后,短短8年后就获得了诺贝尔奖的认可,去年年底,首款基于CRISPR的基因编辑疗法获得FDA批准上市,用于治疗镰状细胞病和β-地中海贫血,从而开启了遗传疾病治疗的新篇章。 https://m.thepaper.cn/newsDetail_forward_27159623
15.使用指南粒曼CRISPREasyKO试剂盒(RNP法)收藏1.我之前没有做过基因敲除,目前在学习CRISPR/Cas9技术和原理,从头设计gRNA(学习软件/网站),自己构建载体、包装病毒、转染细胞和筛选单克隆和KO纯合子,涉及的技术流程比较复杂,感觉至少需要半年的学习,还不一定能"一次性"成功获得该实验材料(这一步才是刚刚拿到课题的实验材料),费时、费力、费钱; http://www.elem-bio.cn/news_details/28.html
16.基因编辑ThermoFisherScientific完整的 CRISPR 和 TALEN 基因编辑工具包 我们开发了一套完整的基因编辑工具以帮助研究人员探寻和理解基因组如何影响表型,其中包括针对基因编辑工作流程中每个步骤的值得信赖的解决方案。设计用于精确切割、敲入和标记的 CRISPR-Cas9 系统或 TALEN 构建体,将其有效转染到细胞中,并验证基因型和表型结果。我们的已优化并经https://www.thermofisher.cn/cn/zh/home/life-science/genome-editing.html
17.医微客因此整理了生物医学、化学、新药研发等常用数据库及网站向大家分享,主要分为以下8大类,欢迎交流补充! 文献检索网站 基因组、蛋白质组数据库 蛋白序列、基因序列、CRISPR工具网站 生信分析工具网站 NovoPro(集大成的在线工具) 化学小分子药物数据库 专利下载数据库 https://www.ewitkey.cn/vipshuo/show-19917.html
18.随机突变文库构建与筛选研究进展在此基础上,Jako?iūnas等扩展了现有的CRISPR技术,采用易错PCR和Cas9介导的基因组整合方法,将大型供体突变体文库整合到单个或多个基因组位点,成功率达到98%–99%[35]。该方法称为CasPER,是Cas9介导蛋白质进化反应的简称。 CasPER包括以下主要步骤(图5):首先,选择合适的DNA突变片段。其次,在目标靶点设计gRNA。http://journals.im.ac.cn/html/cjbcn/2021/1/gc21010163.htm